Ландрас дюрок: характеристика, описание с фото и отзывами, особенности содержания и разведения

характеристика, описание с фото и отзывами, особенности содержания и разведения

Порода свиней дюрок имеет мясное направление. Все чаще владельцы ферм и сельские жители используют их в своих хозяйствах.

Содержание статьи

История появления породы Дюрок

Эта порода была выведена в США, на основе большого разнообразия генетического материала свиней, завезенных на североамериканский континент еще в период колонизации. Основой для создания свиней дюрок стала гвинейская порода, привезенная в Америку из Африки, отличающаяся короткой щетиной, необычным красным окрасом и довольно крупными размерами.

Улучшение характеристик гвинейских особей произошло от их скрещивания с пиренейскими сородичами и британскими представителями породы беркшир зачастую имеющих красноватый цвет.

Селекция проводилась стихийно. Какого-либо единого контроля над этим процессом не осуществлялось. Фермеры скрещивали гвинейскую породу с другими по своему усмотрению. В результате коллективной селекционной работы были выведены свиньи дюрок.

Вследствие разнообразных комбинаций скрещивания порода первоначально не отличалась монотипичностью. В ней прослеживались две ветви, схожие по внешним признакам и другим характеристикам.

Первая образовалась в американском штате Нью-Джерси. Благодаря местности, на которой он возникла, такая ветвь породы получила название Джерси. Особи отличались крупной костной системой и большими свисающими ушами. Слабую выраженность имел гребень, идущий вдоль позвоночника. Характерной особенностью этих представителей была позднеспелость.

[adsp-pro-4]

Вторая ветвь, образовавшаяся в результате некоординированной селекции, появилась в американском штате Нью-Йорк. Размер таких особей был несколько меньше чем у Джерси, они имели более утонченное телосложение, но быстрое достижение товарного веса и процент мяса получался довольно высоким. Именно таких представителей стали именовать дюрок.

Порода свиней Дюрок была выведена в США путем скрещивания разных пород.

Со временем фермеры скрестили эти две ветви. В результате был получен гибрид чистопородной свиньи. В 1983 году породу официально зарегистрировали. В качестве названия она получила наименование дюрок-джерсийская, отразившее вклад работы фермеров обоих штатов по ее выведению.

Эти свиньи характеризовались повышенным образованием сала. Но селекционная работа при этом не остановилась. В результате скрещиваний были улучшены характеристики породы. В частности, повысились мясные качества. Неудобное двойное название сократили до более короткой формы – дюрок.

Сегодня численность поголовья такой породы свиней занимает второе место в мировом мясном животноводстве. Наибольшую популярность она завоевала у фермерских хозяйств США, Китая и ряда европейских стран.

Основные характеристики породы и фотографии

Внешний вид, характеризующий породу, имеет такие особенности:

• свисающие вперед крупные уши;
• спина, выгнутая дугой;
• характерный окрас от темно-красного до золотистого, редко с подпалинами, но без белого цвета;
• крупные размеры особей;
• массивные ноги и задние окорока.

[Not a valid template]

Во взрослом состоянии представители обоих полов имеют практические равные размеры. Длина самцов достигает 180-185 см, в то время, как женские особи меньше их всего на 5 см. Живой вес хряка может составить 3,6 центнера, а свиньи около 3 центнеров.

В один опорос самка производит в среднем 8-9 поросят. Но это считается наименьшим количеством появлением на свет приплода одомашненных свиней. Однако, хорошо развитым инстинктом материнства и спокойным нравом свиноматок эта отрицательная характеристика полностью компенсируется.

[adsp-pro-5]

С учетом того, что новорожденные поросята весят около 1,1 до 1,6 кг, а среднесуточный набор массы составляет от 750 до 950 г, к двухмесячному возрасту вес приплода может составить 190 кг. За первые 6 месяцев откорма поросенок набирает 100 кг. Установлено, что при сбалансированном рационе для свиней дюрок, затраты кормов на 1 кг привеса составляют 3 кг 750 гр.

Процентное соотношение мясной массы колеблется в зависимости от качества скормленной пищи и равняется 60-79%, а выход сала достигает 15%. Толщина сальной прослойки в области позвоночника составляет 1,8 см.

За первые 6 месяцев откорма поросенок набирает 100 кг.

Как выбрать породистую свинку

Чистокровных экземпляров породы дюрок приобрести у нас в стране непросто, хотя ее поголовье занимает второе место по распространенности в фермерских хозяйствах. Это происходит по той причине, что животноводы, пытаясь добиться получение более многочисленного приплода от одной свиноматки, скрещивают особи породы дюрок с представителя других мясных пород свиней, используемых для выращивания.

Это обстоятельство ставит под сомнение покупку поголовья свиней породы дюрок без наличия сопроводительных документов у продавца. Особи могут внешне быть похожими на чистокровных представителей породы, но будут отсутствовать другие особенности, характеризующие таких свиней.

Желая купить чистокровок, разумнее приобретать их в специализированных хозяйствах, занимающихся племенным делом. При реализации свиней продавцы в обязательном порядке предоставят необходимую сопроводительную документацию, свидетельствующую о чистокровности покупаемых особей. Также сотрудники разъяснят особенности их выращивания. При этом есть гарантия, что животные действительно будут иметь характеристики покупаемой породы.

Свиней Дюрок лучше приобретать в племенных хозяйствах.

Разведение свиней Дюрок

Такая порода свиней нетребовательна к уходу. Минимум, который следует обеспечить выращиваемому поголовью – ухоженный и теплый свинарник с просторной площадкой для выгула. Повысит качественную характеристику этой мясной породы возможность свободного движения на открытом воздухе в теплый период года

Обычно площадка для выгула устраивается возле свинарника, для свободного выбора животными места нахождения. Это снижает расходы на необходимости оборудовать такие выгулы навесами, защищающими свиней от солнца и дождя. Кроме этого, отпадает необходимость в принудительном перегоне стада из помещения в открытый вольер и обратно.

[adsp-pro-6]

Требование к постройке, используемой в качестве свинарника: чистота, и утепленные стены, чтобы не было необходимости оборудовать отопление в холодные периоды. Должна быть предусмотрена качественная вентиляция помещения, достаточность освещения и свободного пространства.

Правила кормления

Первостепенное значение для эффективного выращивания свиней породы дюрок играет их правильное кормление. Быстрота набора веса молодняком обеспечивается только при сбалансированном питании в достаточном количестве. В таких условиях поросята достигают веса в 1 центр уже на 6 месяцам выращивания.

Только при правильном и сбалансированном кормлении свиньи Дюрок хорошо набирают вес.

Для этой породы необходимо обеспечить получение таких кормов:

• бобовые;
• картофель:
• силос;
• отходы пищевой промышленности (шрот).

Кроме этого, желательно добавлять в их рацион молочные продукты, костную, рыбную муку и свеклу. Для полного усвоения пищевых веществ, осуществляется двухразовое кормление летом, а в остальные сезоны года трижды в сутки.

Включение в рацион свиней породы дюрок большого количества зерновых культур (овес, ячмень, кукуруза) может спровоцировать ожирение, что в итоге выразится большим процентным отношением количества сала в убойной массе, а также пониженным качеством мяса.

Каким заболеваниям подвержены свиньи Дюрок

Свиньи дюрок устойчивы к болезням, преследующие другие породы.

Для свиней Дюрок опасно заболевание атрофический ринит.

Наиболее уязвимое для них заболевание атрофический ринит, при котором воспаляется слизистая носовой полости. В последствие  болезнь приводит к деформации костей и другим патологическим осложнениям.

Заболевание вызывается болезнетворными бактериями. Наиболее подвержены заболевания поросята. Взрослые свиньи устойчивее к заражению.  Инфицирование происходит при контакте с явно больной особью.  Способность заразиться увеличивается при несоблюдении правил кормления и содержания. В крупных хозяйствах болезнь распространяется медленно, но  если не предпринять меры, то может охватить 50 %  поголовья.

В качестве профилактических мер необходимо при обнаружении больной свинью удалить ее от остального стада и предпринять меры к ее излечению. Если требуется экстренная помощь, поросят обрабатывают антибиотиками с пролонгированным действием.

Сравнение преимуществ и недостатков

О веских преимуществах этой породы свидетельствует их численность в мировой статистике поголовья свиней.

Животноводы предпочитают дюрок за такие положительные характеристики:

1. Быстрое достижение товарного веса. Уже к полугоду набирается необходимая масса, что на 1-2 месяца раньше, чем у представителей большинства других пород.
2. Достижение качественных характеристик мяса, вследствие приспособленности к выгулу свиней дюрок.
3. Наличие жировых прослоек между волокнами мяса придает сочности и повышает качество, делая его мягче.
4. Спокойный темперамент породы дюрок упрощает его выращивание, как в пределах небольшой фермы, так и в хозяйствах промышленного объема.

Занять первое место породе дюрок в распространении среди фермерских хозяйств мешают такие характеристики:

1. Проблематичность разведения этих свиней в северных широтах с прохладным климатом из-за восприимчивости к атрофическому риниту.
2. Небольшое количество поросят в одном приплоде. В среднем их бывает 8 штук, что меньше чем у обычных беспородных свиноматок.
3. Повышенное требование к кормам для обеспечения качества мяса.

К плюсам породы можно отнести высокое качество мяса, к минусам — малоплодность.

Эта порода не подходит для выращивания в тех хозяйствах, которые занимаются разведением и продажей молодняка. Так как одной свиноматкой за год производится около 20 поросят, в то время как от других пород в среднем 30 голов. Чтобы мясо было определенной кондиции, требуется специальный рацион для кормления сбалансированной пищей свиней дюрок,

Какая порода свиней лучше: дюрок или ландрас

Порода ландрас была выведена в Дании и считается одной из лучших представителей в беконном мясном выращивании. Сказать однозначно какая из этих пород превосходит другую довольно трудно. Если сравнивать их, то можно отметить, что ландрас плодовитей, чем дюрок. В одном помете у датской свиноматки появляется в среднем 12 поросят, что на 4 больше, чем у американской породы.

[adsp-pro-7]

Вес взрослой свиньи дюрок может достигать 360 кг с мясным выходом до 79%, в то время как представитель датской породы весит 300 кг, с получение кондиционного мяса 70%.

Ладрас считается одной из лучших свиней беконного типа, но для нее очень важен подбор сбалансированного корма. У дюрок мясо нежное и сочное, но при соблюдении правил кормления.

На фото представитель беконной породы свиней Ландрас.

Отзывы фермеров и заводчиков

Елена. Купила 2 поросенка дюрок. Выросли очень большие и добродушные по характеру. Шашлыки получаются отменные. Мясо прекрасное, по вкусу напоминает кроличье. Главная проблема – куда его девать.

Александр. Хотел завести вьетнамских поросят, но увидел породу дюрок и решил заняться их разведением. Довольно трудно отыскать племенных свиней. Специализирующихся хозяйств очень мало. Пришлось покупать из-за границы. Оформил все необходимые документы и теперь занялся разведением свиней дюрок. Продаю племенных поросят. Они пользуются спросом у покупателей.

Предлагаем к просмотру передачу, посвященную мясной породе свиней Дюрок. Желаем приятного просмотра!

Свиньи пород Дюрок, Ландрас и Гемпшир (Характеристики)

Свиньи этих трех пород относятся к беконному направлению производительности. Потребители все больше отдают предпочтение нежирным сортам мяса, и эти породы являются яркими представителями свиней с минимальным количеством сала.

Дюрок — порода свиней: характеристика

Красные свиньи не часто можно встретить в хозяйствах. Дюрок – необычная красная порода свиней, выведена она в США. В их селекции участвовали свинки из Гвинеи, Испании, Португалии и даже беркширы из Англии. Контроля при скрещивании пород не было, поэтому получившаяся порода не имеет своего автора. В результате фермерских селекционных работ было выведено две породы красного окраса, но с разными характеристиками – Дюрок и Джерси.

Селекционные работы не переставали вестись, и порода свиней Дюрок предстала в новом облике. Сегодня это большие свиньи, приспособленные к выгульному содержанию и которым характерна выносливость. Порода наделена крепкой конституцией, достаточно мясистыми окороками. Длина глубокого, широкого туловища средняя, голова не большая с изогнутым немного профилем, свисающие вперед уши. Ноги породы свиней Дюрок прямые, крепкие, высокие. Спина аркообразная.

Дюрок – мясная порода, но она средней плодовитости, поэтому ее для продажи поросят почти не разводят. За опорос свиноматка приносит 8-10 поросят. Невысоки и молочные качества свиноматки, без подкормок поросята плохо растут. Подкармливать их нужно с первых дней. Важно присутствие в корме железа и меди, которые присутствуют в витаминах и добавках. Сбалансированный откорм дает отличные среднесуточные привесы до 950 г.

Взрослые свиньи могут набирать вес 320-370 кг, выход продукции при убое до 80%. Мясо отличного качества, жира в нем до 3,93%.

Распространения широкого порода свиней Дюрок в России не получила из-за некоторых недостатков. Главный недостаток выражается в склонности к насморкам (ринитам). Затем идет требовательность к белковому питанию, необходимому для высоких приростов массы свиней.

Пугает заводчиков свиней недостаточная плодовитость животных и слабость потомства, случающаяся из-за неправильного питания и условий содержания. Порода свиней Дюрок восприимчива к пыли, грязи, недостатку свежего воздуха, сквознякам.

При соблюдении требований кормления и содержания порода Дюрок может превзойти даже крупную белую породу. Пока в России свиньи породы Дюрок используются в племенных целях, для улучшения качеств мяса у других пород.

Ландрас — порода свиней: характеристика

Еще одна представительница свиней с малым количеством подкожного жира, то есть беконная. Порода не так стара, выведена она в Дании. В скрещивании участвовали местные свиньи и английская белая крупная порода.

Ландрасы наделены крупной конституцией, белой мастью. Туловище у породы торпедообразное, длинное. Бело-розовая нежная кожа покрыта редкой светлой щетиной. Голова средних размеров, уши сильно свисают на глаза, шея мясистая, длинная. Ландрасы имеют хорошо развитые широкие, крепкие окорока, их размеры внушительны.

Мясные показатели породы свиней Ландрас высокие, убойный выход до 70%. Вес взрослых свинок до 300 кг. Порода чрезвычайно плодовита, при опоросе можно получить более 12 поросят. Свиноматка имеет отличный материнский инстинкт, молочность ее высокая.

Свиньи породы Ландрас считаются лучшими среди беконных пород. Все мясные породы требовательны к питанию, не исключение и Ландрасы. Корм должен содержать разнообразные белки, быть сбалансированным. В нем должны содержаться растительные компоненты, рыбная и мясная  мука, молочные продукты. Самой питательной культурой является ячмень.

Количество корма беконным породам нужно не большое, а вот качество и состав должны быть высокого уровня. Наряду с комбикормом и натуральными ингредиентами необходимо в рацион вводить минеральные и витаминные концентраты.

У свиней породы Ландрас есть плюсы и минусы. Из плюсов выделяется, скороспелость и многоплодность, быстрый прирост веса, живой характер, качество мяса. К минусам относится восприимчивость к стрессам, требовательность к питанию, слабая конституция.

Ландрасы используются в промышленном скрещивании с другими породами. В России порода распространена в разных регионах, так что приобрести ее можно без проблем.

Порода свиней Гемпшир: характеристика

Следующий представитель свиней беконного направления – порода Гемпшир. В Англии и США это самая старая порода. Породе присуща нежная конституция, хорошая производительность. Гемпширы не устойчивы к стрессам, беспокойны, зато выносливы и закалены. Эффективность породы доказывают скрещивания, которые создают отличных мясных товарных гибридов. Чистопородное скрещивание высокой продуктивности не показало.

Свиноматки гемпширы не многоплодные, всего 6-8 поросят они дают при опоросе, но материнские качества их отличные. Прирост молодняка в сутки может, составит до 950 г. Вес взрослых свинок в пределах 220-310 кг.

Характерной особенностью гемпширов является белый большой пояс у передних конечностей. Рыло свиней прямое, голова облегченная, с короткими прямостоячими ушами. Туловище длинное, на крепких конечностях прямые копыта, спина аркообразная.

К особенностям породы можно отнести: закаленность, высокие среднесуточные привесы, использование в производстве товарных гибридов, отличные материнские качества.

Недостатки гемпширов выражаются низким многоплодием, легкой возбудимостью, нежной конституцией, слабыми показателями чистопородного поголовья.

В Англии, Европе и Америке гемпширы по-прежнему популярны, ведутся постоянно работы по отбору лучших породных экземпляров. А вот в России гемпширы распространены слабо. Они используются тут в создании высокопроизводительных свиней.

кормление для свиней Дюрок Ландрас, самый эффективный, мясной

Свиньи – очень популярные животные у фермеров и заводчиков по всему миру. Они неприхотливы в содержании и при этом способны давать вкусное мясо и сало, а также финансовую прибыль. Перед убоем свиней необходимо окармливать, чтобы получить максимальную отдачу от их содержания. Однако далеко не все знают, как это правильно сделать. Важно учесть то, что для этого существуют определенные правила и хитрости.

Что должно входить в рацион питания свиней

Нормы кормления свиней во многом зависят от породы. Считается, что они являются практически всеядными животными, однако следует принять во внимание и то, что некоторые их виды относятся к травоядным. В этом случае основу ежедневного меню должны составлять сочные травы и овощные продукты, а также зерновые культуры.

В рацион наиболее распространенных пород должны входить:

• злаковые: горох, ячмень, пшеница, кукуруза, гречиха;
• сочные продукты: свекла, морковь, тыква, капуста, огурцы, кабачки, тыквы, картофель;
• зелень;
• грубая пища: травяная труха, отруби;
• молочные отходы и продукты;
• мясная продукция;
• концентраты и комбикорма. Больше подробностей о составе и приготовлении комбикорма для свиней смотрите тут;
• мясокостная и рыбная мука.

При этом пища должна быть обогащена витаминами и минералами. В том случае, если данных элементов недостаточно, можно добавлять покупные премиксы.

Полезные и вредные продукты

Для того, чтобы мясо обрело отличные вкусовые качества, а сало – зернистость, важно, чтобы хотя бы пятьдесят процентов всего рациона составляли зерновые, сочные, молочные и мясные продукты. Рекомендуется не увеличивать количество концентратов, комбикормов и отрубей в ежедневном меню, поскольку в них не так много полезных веществ и калорий.

Рыбные продукты следует добавлять в меню осторожно, поскольку они могут испортить вкус полученных мясных продуктов.

Некоторые заводчики пытаются кормить животных жмыхом, соей и овсом. Для того, чтобы они активно набирали и сохраняли вес, количество таких продуктов в рационе рекомендуется свести к минимуму, особенно в период откорма на убой.

Режимы кормления

Скорость роста и набора веса молодняка зависит не только от того, как был составлен рацион, но и от того, какой был выбран режим кормления.

• “Вволю”. Данная форма кормления считается наименее выгодной, поскольку предполагает отсутствие экономии продуктов и неограниченный доступ молодняка к еде. Его применяют после отрыва поросят от свиноматки. В этом случае у них в кормушке должен постоянно присутствовать корм;
• Нормированное. Данный способ предполагает кормление молодняка по нескольку раз в день в одно и то же время. При этом режим приема пищи составляется на основе наблюдений за поведением и аппетитом животных. Его можно считать наиболее оптимальным, однако он может требовать определенного опыта в разведении и выращивании свиней. Способ подходит для кормления животных всех возрастов;
• Ограниченное. Предполагает замену сочных кормов на более грубые с минимальным содержанием жира. Больше всего подходит для откорма на мясо для свиноматок, а также для питания поросят. Во втором случае следует давать меньше еды, чем могла бы съесть данная группа молодняка или же кормить их в соответствии с фиксированной шкалой.

Ограниченное кормление не рекомендуется применять новичкам, поскольку оно требует определенного опыта. Если допустить ошибку в составе рациона, животные могут болеть, страдать авитаминозом и голодать.

Питание животных в зависимости от возраста

Состав рациона для животных разного возраста должен быть различным.

Рацион поросят-сосунов

С первых дней после появления на свет поросята получают все необходимые витамины, питательные компоненты и микроэлементы с молоком матери. Однако по мере роста и развития может возникнуть и недостаток данных веществ. Поэтому уже через две-три недели следует вводить прикорм.

Постепенно в рацион вводится обрат и коровье молоко, травяную муку, концентраты и сочное питание. Обязательно в пищу следует добавлять поваренную соль, а также мел и костную муку. Таким образом, отъем от свиноматки производится в срок от сорока пяти до шестидесяти дней.

Кормление молодняка

Молодняк необходимо кормить так, чтобы к возрасту в десять месяцев они имели массу около ста килограммов, а к возрасту в один год – сто восемьдесят. Доля концентратов и комбикормов здесь должна составить от шестидесяти до восьмидесяти процентов, сочные – десять-двадцать, грубые – до десяти и корма животного происхождения – не более пяти процентов.

От правильного соотношения пищи в кормах зависит развитие и сохранение массы животного, а также общее состояние здоровья и организма в целом.

Кормление взрослых особей

Рацион питания взрослых животных мало отличается от меню молодняка. Разница обычно состоит только в количестве пищи. В период откорма соотношение должно меняться в зависимости от выбора: на постное мясо или жирное. Соответственно во втором случае должно быть больше сочных и жирных кормов.

Откорм свиней на убой

Откорм животных на убой значительно отличается от обычного кормления, поскольку в этом случае питание становится более интенсивным.

На мясо

Содержание на убой для получения мяса начинается у поросят по достижении трехмесячного возраста и длится до тех пор, пока животное не наберет вес в сто-сто двадцать килограммов. В

этом случае получаются большие мясные туши с сочным мясом и толщиной жира около трех с половиной сантиметров.

Откорм состоит из двух этапов: при первом средняя прибавка в массе составляет полкилограмма, во втором – около семисот пятидесяти граммов. Такие показатели достигаются питанием, богатым белком, а также витаминами и минералами. Рацион должен состоять из наиболее питательных сочных, зеленых и концентрированных кормов с низким содержанием жира. В последние периоды перед убоем половину всего меню должен составлять картофель, вторую половину – комбикорм. Наиболее выгодное время для откорма – летнее и весеннее.

Перед убоем рекомендуется исключить из рациона рыбные продукты, просо и сою, поскольку они негативно скажутся на вкусовых свойствах мяса и сала.

Беконный откорм

Для того, чтобы получить нежное и сочное мясо с жировыми прослойками, необходимо обеспечить молодняку рацион, содержащий, в первую очередь, зеленый корм и молочные продукты, концентраты и комбикорма, корнеплоды, соль и премиксы. В обязательном порядке в еде должен присутствовать ячмень.

В самом начале периода откорма ежедневный привес должен составить около четырехсот пятидесяти граммов, последние три месяца он должен быть не менее шестисот граммов. Для того, чтобы повысить аппетит и усвояемость пищи, необходимо обеспечить особям ежедневные прогулки на свежем воздухе.

Откорм для получения сала

Для того, чтобы в общей массе животного находилось не менее сорока процентов сала и жира, основой рациона необходимо сделать сочные корнеплоды и углеводные продукты. Очень важны для набора массы кукуруза, пшеница, просо, ячмень, бахчевые, а также комбинированные корма и концентраты.

Вне зависимости от того, с какой целью производится откорм, хряков перед убоем необходимо кастрировать, иначе мясные продукты приобретут характерный неприятный запах.

Обзор лучших пород

В первую очередь при приобретении свиней заводчики и фермеры обращают внимание на более крупные мясные породы. Они обычно неприхотливы в питании и быстро набирают необходимую массу.

• Крупная белая. Данная порода очень популярна в России. Ее представители отличаются крепким скелетом, гармоничным телосложением, широкой спиной и грудью. К возрасту в полгода животные достигают массы в сто килограммов, каждая свиноматка способна приносить до двенадцати поросят;

Длина туловища взрослых животных может составить до двух метров

• Ландрас. Масса туловища свиней породы Ландрас может достигать трехсот килограммов, а длина туловища – двух с половиной метров. За счет хорошего аппетита и малой подвижности особи быстро набирают массу. При этом за один опорос самка способна приносить по десять-одиннадцать поросят. При этом они требуют около четырех килограммов пищи на каждый килограмм живой массы в день;
• Дюрок. Главное внешнее отличие данной породы свиней состоит бурой окраске. Длина туловища животных обычно составляет до двух метров, масса тела – двух с половиной центнеров. Процент мяса в период откорма может составлять восемьдесят процентов, толщина сала – трех сантиметров. При этом свиньи породы Дюрок довольно подвижны и неприхотливы в содержании;
• Пьетрен. Порода отлично подходит для откорма на мясо, поскольку у них отсутствует генетическая предрасположенность к набору жира. При этом животные быстро набирают массу и достигают веса в два с половиной центнера. Приплод свиноматок относительно небольшой – до восьми поросят;
• Кемеровская. Порода подходит как для мясного, так и беконного откорма. Внешне ее представители отличаются густой шерстью и темным цветом кожи. Ежедневный прирост молодняка при этом составляет до девятисот граммов

Животные хорошо переносят смену климата и могут достигать массы более трехсот килограммов.

Мангал. Свиньи и поросята породы мангал отличаются наличием густого волосяного покрова. За счет него животные могут с легкостью переносить низкие температуры и пригодны для выращивания в северных регионах. Поросята мангалица очень активны, поэтому рекомендуется держать их в открытом загоне.

Видео

Больше деталей касательно откорма свиней в домашних условиях смотрите на видео

Заключение

Выращивать свиней на мясо, бекон и сало достаточно просто, если следовать определенным правилам. При этом меню животных можно корректировать в зависимости от вкусовых предпочтений заводчиков. В период содержания и откорма важно сохранять сбалансированность питания и обеспечивать правильное соотношение продуктов в ежедневном рационе.

Сальная порода свиней «Крупная белая»

Крупная белая порода сальных свиней пользуется популярностью среди покупателей, поскольку хорошо приспосабливается к любому варианту кормления и климату разных регионов страны.

Представьте: более 80 % всех свиней в России составляет именно эта порода, однако она получила большое распространение и по всему миру.

Отличительной чертой таких свиней является скороспелость — к годовалому возрасту могут достигать веса около 200 кг.

Свиньи породы крупная белая довольно продуктивна — приносит по 12-14 поросят.

Внешние признаки свиней породы крупная белая таковы: средняя голова, умеренного размера уши, мускулистая шея, широкая грудь и круглые мясистые окорока. Свинки имеют эластичную кожу, покрытую длинной щетиной.

Мы советуем кормить крупных белых овощами (картофелем, свеклой, яблоками, морковью, капустой), продуктами на основе молока, комбикормом, пшеницей, а также бобовой и тыквенной растительностью.

Почему нужно завести свиней породы крупная белая:

• Нетребовательность к еде;
• Большая продуктивность свиноматок;
• Быстрое половое созревание поросят;
• Высокая адаптивность к условиям содержания.

Приобретайте поросят крупной белой, ведь эти порода прекрасно приживется в ваших условиях содержания и будет радовать спокойным нравом, быстрым набором веса и плодовитостью.

Мясо — сальная порода «Ландрас + Крупная белая»

Эта прекрасная помесь свиней пород “крупная белая” и “ландрас” (гибридная порода F1) относится к мясо — сальному направлению продуктивности.

Получен этот гибрид путем скрещивания хряка породы ландрас со свиноматкой крупной белой.

Помесь ландрас и крупная белая отлична от чистопородных свиней тем, что у гибридной породы себестоимость приплода выходит гораздо ниже.

Главная особенность помеси крупной белой и ландраса заключается в очень быстром наборе массы при минимальном потреблении корма — свиньи набирают до 100 кг за 155 дней.

Свиноматки крупные и многоплодные, как правило, приносят большое потомство, которое способны выкормить. Гибридная порода свиней F1 также известна хорошим качеством сала и мяса.

 

Беконная порода «Крупная белая + Дюрок + Ландрас»

Трехпородных беконных свиней получают путем скрещивания свиноматки гибридной породы F1 с хряком породы дюрок или пьетрен.

Такое смешивание генетических качеств дает большой выход постного мяса, ведь максимальная толщина шпика на спине этих свиней составляет всего 0,8 — 1 см.

Почему так много людей уже выбрали эту “трехпородку”:

• Высокая сохранность молодняка
• Повышенная жизнестойкость
• Интенсивная скорость развития и роста
• Наименьшее количество затрат кормовых единиц на кг живой массы.

Свиноматки приносят хорошее потомство — от 10 поросяток в помете.

Заметим, что себестоимость приплода помеси трех пород крупная белая, ландрас и дюрок меньше на 1 — 5%, чем у двухпородной F1.

Навигация по записям

Какая порода свиней лучше для разведения

Выбор породы свиней для разведения в подсобном хозяйстве зависит от целей, которые ставит перед собой фермер. Ведь, в отличие от других видов домашних животных, результатом откорма свиньи помимо мяса может быть и сало. С учетом классификации пород предлагаем вашему вниманию обзор лучших из них с точки зрения производительности.

Самые продуктивные породы свиней

Мясные. Для откорма на мясную постную свинину стоит выбирать именно мясные породы свиней. К этой категории относятся такие породы, как:

Дюрок — при интенсивном мясном откорме из одной свиной туши этой породы можно получить 80% мяса.

 

 

Гемпшир — вполне адаптивная порода, способная приносить максимальные результаты (среднесуточный привес свиней достигает 900-950 г).

 

 

Пьетрен — сложная в уходе и привередливая в отношении корма порода.

 

 

Ландрас — довольно продуктивная порода с суточным приростом массы до 700 г и максимальным весом в конце откормочного периода 310 кг.

 

 

Темворс — за период откорма порода может набрать в весе до 100 кг.

 

 

Лакомб — представители этой породы демонстрируют высокий уровень производительности.

 

 

Литовская белая — живой вес свиноматки этой породы составляет 240-250 кг, хряка — 310-315 кг.

 

 

Эстонская беконная — нетребовательная к кормам порода свиней, вес которых может достигать 220-330 кг.

 

 

Вьетнамская вислобрюхая — за год порода способна набрать вес до 100 кг. Пожалуй, эту породу свиней небольшого размера можно назвать самой выгодной для разведения, поскольку она отличается высокой плодовитостью при малом расходе корма.

 

В наличии

ПК 54-11. Для супоросных свиноматок и хряков

Мясо-сальные. Составляющие эту группу универсальные породы по содержанию мышечной массы уступают мясным породам, при этом они менее прихотливы к условиям содержания. К их числу принадлежат:

Крупная белая — к 5-ти месяцам свиньи этой породы весят около 100 кг.

 

 

Брейтовская — максимальный вес самок — 230 кг, самцов — 330 кг. Туши имеют широкий слой сала (до 5 см).

 

 

Ливенская — в возрасте 6 месяцев свинья этой породы весит до 100 кг.

 

 

Беркширская — убойный вес взрослой особи может достигать 220 кг.

 

 

Латвийская белая — средний вес хряков — 312 кг, самок — 236 кг, а плодовитость последних составляет 11-12 поросят за один опорос.

 

 

Украинская степная белая — среднестатистический вес взрослой самки — 200-240 кг, самца — 300-350 кг.

 

 

Сальные. Повышенное салообразование — вот что объединяет между собой породы этой группы:

Крупная черная — при условии создания хороших условий вырастают до 200 кг за 10 месяцев.

 

Украинская степная рябая — живой вес самок этой породы — 230 кг, самцов — 340 кг.

 

Миргородская — живая масса свиноматки — 250 кг, хряка — 300 кг. При этом среднее количество поросят в одном приплоде — около 10.

 

Мангалицкая — живой вес взрослых особей данной породы составляет 300 кг.

В наличии

ПК 57-11. Для лактирующих свиноматок

При выборе подходящей породы для разведения также нужно учитывать вес свиноматки. Ведь от ее внешнего вида во многом зависят такие важные характеристики, как:

Количество живых поросят в помете.

 

Вес новорожденных поросят.

 

Способность свиноматки к молокообразованию.

 

Период отъема поросят от материнского молока.

 

Количество родившихся за год поросят.

 

Свиноматка не должна быть ни слишком худой, ни слишком жирной.

 

Определяйтесь с подходящей вам породой свиней, создавайте для их разведения оптимальные условия, а для выращивания поголовья приобретайте эффективные комбикорма ТМ «Feed&Life».

Селекционный центр по разведению племенных свиней

Воспроизводительные качества свиноматок:

Многоплодие гол.: 13,1
Количество поросят к отъему, гол.: 11,8
Молочность, кг: 78

Ремонтный молодняк:

Свинки

Возраст достижения живой массы 100кг, дн.: 148
Толщина шпика при весе в 100 кг.: 11
Среднесуточный прирост, гр.: 920

Хрячки

Возраст достижения живой массы 100кг, дн.: 133
Толщина шпика при весе в 100 кг.: 11
Среднесуточный прирост, гр.: 1130

Масса окорока в 100 кг: 12,4
Выход постного мяса, %: 60
Затраты корма на 1 кг прироста, кг: 2,6

Небрежное отношение к кормлению свиней и поросят породы Ландрас недопустимо. Они капризны и более придирчивы к качеству кормов, чем их прародительницы — белые крупные свиньи.

Составляя план питания, важно подбирать высокопитательные корма. Их цель — поставлять организму энергию, необходимую для интенсивного роста животных. Благодаря правильному рациону поросята к 6 месяцам вырастают в свиней весом в 140 кг.

Обязательным является наличие зерновых и зеленых кормов. Разнообразие в рацион вносят овощи, которые нужно скармливать животным в большом количестве. В питание должны входить комбикорма, силос, рыбная и костная мука. Хорошие результаты приносит добавление в еду продуктов молочного происхождения (сыворотки, обезжиренного молока).

Высокая питательная ценность кормов — это не единственное требование. При кормлении поросят необходимо исключить всякую возможность покупки кормов сомнительного качества. Продукцию лучше покупать из первых рук, у надежного поставщика. Расход кормов: 3,8 — 4 кормовые единицы на 1 кг привеса.

Наличие земельного участка может стать хорошим подспорьем для выращивания кормов собственного производства. Для содержания 2-5 голов вполне хватит продукции, полученной с 10-15 соток огорода.

Необходимо строго следить за графиком кормления, периодичность которого составляет 10-12 часов (2 раза в сутки). Зимой число кормлений можно увеличить до трех. Ненормированная выдача корма приведет хрюшек к ожирению.

Для случки хряков и свиноматок готовят заранее. Проводится тщательный отбор чистопородных свиней с явными характерными признаками, которые должны быть закреплены в последующем поколении.

В течение года хряков очень хорошо кормят, чтобы обеспечить заметную прибавку в весе и улучшить качество спермы.

Ключевым фактором для получения здорового потомства является содержание хряков в комфортных условиях на свинофермах, и долгие летние прогулки на свежем воздухе. С учетом крупно-породности, на содержание одного хряка должно быть выделено не менее 5 кв. м. в станке и 1 сотки земли в загоне.

Для образования качественной спермы важны не только содержание и кормление, но и нагрузка, которую возлагают на хряка, как на осеменителя. Для зрелых опытных самцов должно проводиться не более 30 случек со свиноматками в год, для молодых — не более 15. Уставший хряк Ландраса не сможет дать ожидаемых результатов, так как качество спермы для осеменения будет непригодной, что является основной причиной, по которой самцов на 4-5 год выбраковывают.

Для содержания свиноматки достаточно 4 м2. в станке. Норма участка в летнем загоне та же, что для хряка — 1 сотка. Перед случкой они должны получать корм с увеличенным содержанием протеина, минералов и витаминов.Как только свинья Ландрас начинает проявлять готовность к спариванию, следует провести случку. Половая охота у свиноматок длится около 2-х суток. За это время хряк-осеменитель должен покрыть ее два раза. Первый — через 12 часов после начала половой охоты, второй — через 12 часов после первого контакта.

Показателем успешной случки является спокойное поведение свиноматки, без каких-либо признаков половой охоты в последующие 18-20 дней. В случае неудачи ее можно повторить с другим осеменителем. Возможно, у первого хряка было недостаточно хорошее качество спермы.

Дюрок

При выращивании свиней фермеры преследуют различные цели. Стараясь выполнить поставленные перед собой задачи, свиноводы все чаще выбирают поросят определенного направления продуктивности, на котором выстраивают всю свою работу. Хорошими показателями мясной продуктивности обладает порода свиней Дюрок. Рассмотрим основные особенности этих животных.

Покоряя американский континент, европейцы привозили вместе с собой не только предметы домашнего обихода, утварь и одежду, но и разных домашних животных. В те далекие времена этот процесс носил стихийный характер. А в начале 19-го века скопилось достаточное разнообразие пород свиней, чтобы свиноводы любители смогли заняться селекционной работой.

Свинья породы Дюрок

Одним из направлений стала работа по скрещиванию красных гвинейских свиней с беркширскими, что привело к появлению новой породы, получившей название Дюрок.

Прошло еще несколько десятилетий планомерной и целенаправленной работы по улучшению и закреплению полученных признаков. В 1883-м году в Соединенных Штатах была официально зарегистрирована порода Дюрок.

Описание породы Дюрок

Свиньи имеют ряд отличительных особенностей, которые позволяют легко их узнать среди представителей других пород. Вы сами можете убедиться в этом, внимательно рассмотрев на фото поросят и свиней породы Дюрок.

Первоначально поросята Дюрок были сальной породой, однако высокий спрос на свиное мясо постепенно изменил основную характеристику этих свиней. Представители породы Дюрок широко распространены по всему свету, пользуются заслуженной популярностью и высоким спросом.

Дюрок очень неприхотлив в содержании

Свиньи Дюрок выносливы и обладают хорошей приспособляемостью. Иногда их используют в качестве генетического материала для получения товарных гибридов.

Внешний вид этих парнокопытных довольно характерен. Они обладают крепкой конституцией, большими размерами. Хряки и самки Дюрок практически одинаковой длины, примерно 1,8-1,85 м – самцы и 1,75-1,8 м — самки. Взрослые животные достигают живой массы в 300-360 и 240-300 кг соответственно. Уши длинные, свисающие вперед. Спина дугообразная. Ноги крепкие, высокие. Резко очерченные окорока хорошо развиты. Расцветка этих свиней получила название «красная масть», т. к. их окрас колеблется от темного красного до золотистого цвета. Бывают особи с подпалинами, но без какой-либо примеси белого цвета.

Свиньи Дюрок не очень плодовиты. В одном опоросе у свиноматки может быть 9-11 поросят. Самки обладают хорошо развитым материнским инстинктом, обладают спокойным характером, отлично заботятся о поросятах и хорошо их вскармливают.

Порода относится к скороспелым. Поросята рождаются довольно крупными (1100-1600 г). Ежедневные среднесуточные привесы могут достигать показателей в 0,75-0,95 кг. Масса гнезда в два месяца может доходить до 190 кг. Поросята Дюрок на контрольном откорме способны достичь живого веса в 100 кг за 170-180 суток. Кормовые затраты составляют 3,7-3,8 кормовых единиц на 1 кг привеса.

Выход мяса в туше составляет от 58 до 70%. Толщина сала над позвоночником достигает 1,2-1,8 см.

Содержание свиней Дюрок

Решив заняться разведением свиней именно этой породы, фермеры сталкиваются с вопросом, где можно купить поросят Дюрок.

Несмотря на широкое распространение породы, чистокровных особей приобрести довольно сложно. На просторах Беларуси и России, как правило, свиней этой породы скрещивают с другими, для увеличения приплода. Однако при правильном селекционном отборе можно получить поросят с внешними признаками Дюроков, но это совершенно не означает, что их качественные характеристики будут соответствующими.

Разводят дюрка на продажу преимущественно на племпредприятиях

Для приобретения молодняка для племенного разведения лучше обратиться в специализированное племенное хозяйство, где вам смогут предоставить гарантии соответствующей характеристики и точной принадлежности покупаемого поросенка к свиньям породы Дюрок.

Содержание этой породы не доставляет хозяину никаких хлопот при условии наличия выгула для животных. На свежий воздух свиней Дюрок можно выпускать уже ранней весной и предоставить им выгул до первых сильных морозов. В этом случае животные лучше себя чувствуют, мясная продукция получается лучшего качества, чему способствует более подвижный образ жизни.

Для организации выгула достаточно выгородить необходимый участок рядом со свинарником и обеспечить животным свободный выход в загон. В таком случае не потребуется устраивать дополнительные навесы и клети, чтобы защитить животных от неблагоприятных условий во время непогоды.

Размещение представителей этой породы в сарае должно соответствовать обычным нормам содержания свиней. Хорошая приспособленность поросят Дюрок к холодной температуре позволяет обойтись без дополнительного обогрева помещения свинарника.

Как кормить свиней

Поросята породы Дюрок очень требовательны к содержанию в кормах высокого процента белковой пищи.

На откорм выбирают двухмесячных поросят. Их содержат до достижения живого веса в 100 кг. По сравнению с другими породами, представители Дюроков достигают этого веса в кратчайшие сроки. Однако это достигается при хорошей сбалансированности кормов и соблюдении режима откорма.

Дюрок быстро прибавляет в весе

В качестве кормов рекомендуется использовать картофель, комбинированный силос, бобовые и жмых. Допускается введение в питание зерновых культур. Однако следует помнить, что кормление овсом, ячменем и кукурузой приводит к ожирению и потере свиньями мясных качеств.

Полезно включать в рацион откормочных поросят Дюрок костную или рыбную муку, отходы мясного и рыбного производств, молоко и молочные продукты, обрат, сахарную и кормовую свеклу. Количество кормлений следует ограничить тремя — зимой и двумя – летом.

Разведение породы Дюрок

По отзывам фермеров, занимающихся разведением породы Дюрок, этих свиней нецелесообразно содержать в хозяйстве с целью получения и продажи поросят. Малые опоросы не окупают круглогодичное содержание племенных животных. Для сравнения свиноматки крупной белой породы приносят в год до 30 поросят, тогда как Дюрок может дать не более 20-ти.

Поросятам этой породы необходимо вводить прикорм с первых дней жизни, иначе они заболевают рахитом, отстают в развитии. В корма следует дополнительно вводить продукты, содержащие железо, медь, витамины и добавки для поросят.

Признаки половой охоты проявляются у свиней Дюрок таким же образом, что и у других представителей парнокопытных. Активная охота длится около 48-ми часов, однако первые сутки свиноматку лучше оставить в покое, а в течение последующего дня провести случку, желательно дважды, для улучшения эффекта.

Большая выживаемость опороса близкая к 100%

Выживаемость поросят у свиноматок этой породы составляет около 93%, что зачастую удивительно, т. к. масса и габариты мамаши весьма значительные. Для получения здорового потомства следует качественно кормить будущую маму в период беременности. Также у нее должны быть регулярные и длительные прогулки в загоне на свежем воздухе.

В промышленных масштабах случки свиноматок и хряков проводят в соответствии со специальным планом. Чаще всего для покрытия самки используют двух хряков с интервалом в 12 часов. В частных подворьях это требование чаще всего недостижимо, но при возможности следует обращаться на соседние свинофермы для обеспечения качественной случки.

Несмотря на кажущуюся легкость выращивания и содержания, поросята и свиньи Дюрок требуют заботливого ухода и внимательного отношения со стороны фермера. Лишь в этом случае питомцы порадуют вас вкуснейшей продукцией, хорошим ростом и привесами.

Гродненское племпредприятие является поставщиком хряков и свинок на внутренний и внешний рынки. У нас Вы можете Купить свинью породы Дюрок. Узнать наличие и сколько стоят свиньи этой породы можно по номерам телефонов Центра селекции и генетики в свиноводстве + 375 (1514) 72146   + 375 (29) 1566007

Датские исследования: генетика дюрок более прибыльна

Согласно недавнему датскому исследованию, использование спермы дюрок вместо петрена в свиноводстве дает значительную финансовую выгоду на свиноматку от рождения до убоя.

Исследование было проведено Датским центром изучения свиней Сегеса, который изучил экономику получения гибридных свиней от хряков Дюрок или Пьетрен. Центр исследования свиней сообщил об испытаниях в пресс-релизе.

Исследовательский центр обнаружил, что гибриды Дюрок (Дюрок x Ландрас x Йоркшир — D-LY) имели более быстрый рост, немного лучший коэффициент конверсии корма (FCR) и больше D-LY были отняты от груди по сравнению с гибридами Пьетрен (Piétrain x Landrace x Yorkshire — П-ЛЙ).

Индивидуальный мониторинг свиноматок

Старший научный сотрудник центра Ханне Марибо отвечал за судебное разбирательство. В пресс-релизе, распространенном исследовательским центром, она цитирует: «Мы наблюдали за свиноматками D-LY и P-LY на индивидуальной основе от рождения до убоя, и цифры говорят сами за себя. Фактически, выгода составляет примерно на 13 датских крон (1,75 евро) больше на свинью с D-LY вместо P-LY ».

Датских кабанов дюрок разгружают с грузовика.Фото: Берт Янсен

Центр исследования свиней провел испытание на свиноматках датского происхождения (DanAvl). Их обслуживали спермой хряков Пьетрен или Дюрок. Свиньи весом 30 кг были переведены в загоны, где регистрировались суточный прирост и потребление корма.

На 700000 меньше поросят

Результат испытания показал, что с Дюроком в качестве линии-производителя на один помет приходится на 0,3 свиньи-отъемыша больше. Одновременно наблюдалось, что у потомства Duroc были лучшие FCR и суточный прирост.В среднем потомство Пьетрен показало прирост 897 г / день, тогда как результат для помесей Дюрок снизился до 1054 г / день.

Испытание также показало, что процент мяса у гибридов Пьетрен был на 2% выше, но поскольку пометы с отъемной линией Дюрок приводят к большему количеству отъемных свиней на помет, а гибриды Дюрок имеют лучшую конверсию корма и быстрее росли, финансовые выгоды были выше с Отцовская линия Дюрока.

Гипотетический переключатель

Исследователи заявили, что гипотетический 100% переход на Piétrain в качестве линии хряков вместо Duroc в Дании приведет к уменьшению количества поросят на 700 000 и забоя примерно на 2 000 000 в год в Дании.

Датская система свиноводства в значительной степени основана на породах дюрок. Таким образом, Кристиан Финк Хансен, отраслевой директор Центра исследований свиней Сегеса, увидел подтверждение преимуществ нынешней датской системы. В пресс-релизе он сказал: «Если бы суд доказал обратное, мы бы приняли необходимые решения. Мы постоянно в курсе событий, чтобы гарантировать, что в Дании созданы лучшие условия для выращивания одних из лучших свиней в мире ».

различных пород свиней — Дюрок.Порода свиней дюрок. Дюрок Свинки, свиноматки и кабаны — Свиноводство

Дюрок

В 1812 году в Нью-Йорке и Нью-Джерси были выведены ранние крупные «красные кабаны». Большие пометы и способность к быстрому росту были характеристиками дюрок с самого начала. Фонд, который сформировал сегодняшний «Дюрок», состоял из красных дюрок из Нью-Йорка и красных джерси из Нью-Джерси.

В 1823 году Исаак Фринк из Милтона в округе Саратога, штат Нью-Йорк, получил от Гарри Келси из Флориды, штат Нью-Йорк, красного кабана, одного из десяти свиней.Отец и мать этих свиней, вероятно, были импортированы из Англии. У Келси был знаменитый рысью жеребец по имени Дюрок, поэтому Фринк назвал своего красного кабана в честь лошади. Этот кабан был известен своей гладкостью и качеством туши.

Его потомки продолжили имя Дюрок, и многие из них унаследовали его цвет кожи, быстрый рост и зрелость, глубокое тело, широкие окорока и плечи и спокойный нрав. Дюрок был меньше, чем Джерси Красный, с более тонкими костями и лучшим качеством туши. Начиная с начала 1860-х годов, дюрок производился путем систематического смешивания двух очень разных сортов.

Первой организацией, занимавшейся записью, улучшением и продвижением красных кабанов, была Американская ассоциация дюрок-джерси, основанная в 1883 году. На Всемирной выставке 1893 года в Чикаго дюрок приобрел широкую популярность на первой успешной выставке Duroc Hog Show.

Дюрок предпринял две попытки закрепиться в этой стране; первые в начале 70-х годов не имели большого успеха, хотя некоторые из этих свиней были экспортированы в Данию. Они были повторно импортированы в начале 80-х, и MLC провела всестороннее испытание, чтобы оценить достоинства Duroc как конечного производителя.Было обнаружено, что на британском рынке свежей свинины в шкуре дюрок не может использоваться как чистокровный, а только как компонент помесного кабана. В результате развития помесных хряков Дюрок получено большое количество помесных свинок. Для них был найден рынок благодаря возрождению интереса к выращиванию свиней на открытом воздухе. В результате были разработаны программы разведения и селекции британского дюрока, в которых основное внимание уделялось характеристикам женской линии, а не традиционным признакам конечного производителя, связанным с породой.Дюрок занял особую нишу в британской индустрии, и была разработана уникальная британская версия породы.

Их толстая каштановая зимняя шерсть и твердая кожа позволяют им пережить холод и влажность британской зимы. Эта шерсть летом линяет, и свинья выглядит почти лысой, но, как следствие, она одинаково хорошо переносит жаркое сухое лето. Все чистокровные дюрок имеют красный цвет, и развитие так называемого «белого дюрока» было достигнуто только путем скрещивания с белой породой.

Его упорство в уходе за молодняком в сочетании с его послушностью делают его идеальным кандидатом в качестве домашней свиньи на открытом воздухе, в качестве матки или производителя, а его сочность и мускулистость делают его очень подходящим для чего угодно, от легкой свинины до тяжелой свиньи. производство.

Дальнейшие исследования, финансируемые MLC, позволили изучить утверждение Duroc о высокой степени нежности. Это привело к рекомендации включить генетику дюрока в план качества мяса.

(PDF) Сравнительные показатели свиней пород ландрас, йоркшир и дюрок

при недостаточном потреблении корма, что привело к уменьшению веса при отъеме на

и увеличению интервалов отъема до

интервалов обслуживания во время резервов тела

мобилизовано ( Льюис и Бантер, 2011).

Йоркширские свинки были самыми молодыми из

трех пород. Средний возраст тела

кг при весе тела 90 кг для Йоркшира, Ландраса и Дюрока составлял

171.50, 193,64 и 200,86 дней соответственно.

Эффект породы был очень значимым (P <0,01) на

этого признака.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Влияние породы хряков ландрас, йоркшир и

дюрок было очень значимым для среднего суточного прироста

, конверсии корма, толщины шпика и селекционного индекса

. Более того, эффект породы для свинок

был очень значимым для среднего суточного прироста, конверсии корма

, индекса селекции и значительной разницы

для среднего суточного потребления корма и толщины шпика

.В целом породы Йоркшир и

Ландрас показали лучшие показатели, чем порода

Дюрок, по среднесуточному привесу, конверсии корма

и селекционному индексу. Тем не менее, у хряков и свинок дюрок

самый тонкий шпик, а у

— у свиней пород ландрас и йоркшир.

БЛАГОДАРНОСТИ

Авторы выражают признательность центру разведения свиней

(PTU-HPT Siborongborong,

, провинция Северная Суматера) за предоставление всех

помещений и образцы свиней, использованных в этом исследовании.

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Бечкова Р., Данек П., Вацлавкова Е., Розкот,

М. 2005. Влияние скорости роста, толщины шпика

и мясистости на воспроизводство

Эффективность

свинок Ландрас. Чешский J. Anim.

Sci. 50 (12): 535-544.

Цай У., Д. С. Кейси и Дж. К. М. Деккерс. 2008.

Реакция отбора и генетические параметры

для остаточного потребления корма у йоркширских свиней.

Дж.Anim. Sci. 86: 287-298.

Chen, P. T., J.J. Baas, W. Mabry, J.C. M. Dekkers,

и K.J. Келер. 2002. Генетические параметры

и тенденции скорости роста постного мяса и его компоненты

у свиней Йоркшир, Дюрок,

,

Хэмпшир и Ландрас. J. Anim. Sci.

80: 2062-2070.

Де Бака, Р. К. 1962. Как работают испытательные станции

в Айове? Станция тестирования свиней штата Айова и процедура

для свинины.Брошюра. 291. P. 13.

Edwards, D. B., R.J. Темпельман и Р. Бейтс,

2006. Оценка Duroc-vs. От Пьетрена было получено

свиней по росту и составу. J. Anim.

Sci. 84: 266-275.

Hermesch, S., B.G. Люксфорд и Х. Грейзер.

2000. Генетические параметры постного мяса

Урожай, качество мяса, воспроизводство и корм

Показатели эффективности для австралийских свиней.

Наука животноводства.65: 239-248.

Хоке, М.А., К. Судзуки, Х. Кадоваки, Т.

Сибата и Т. Оикава. 2007. Генетические параметры

для эффективности корма и их взаимосвязь

с ростом и признаками туши

свиней породы дюрок. J. Anim. Порода. Genet.

124: 108-116.

Хоке, М.А., Х. Кадоваки, Т. Шибата, и К.

Судзуки. 2008. Материнские и прямые генетические

параметров продуктивных признаков и

материнских корреляций между продуктивностью и

признаков кормовой эффективности у свиней породы дюрок.Азиатский —

Австралийский. J. Anim. Sci. 7: 961-966.

Хоке, М.А. и К. Судзуки. 2008. Генетические параметры

для производственных признаков и

показателей остаточного потребления корма у свиней дюрок

,

и ландрас. J. Anim. Sci. 79: 543-

549.

Hoque, M. A., H. Kadowaki, T. Shibata, T.

Oikawa, and K. Suzuki. 2009. Генетические

параметры для измерения остаточного кормления

признаков потребления и роста в семи поколениях

свиней породы дюрок.Живой. Sci. 121: 45-49.

Kernerová, N., J. Václavovský, V. Matoušek, и

Z. Hanyková. 2006. Использование параметров теста производительности

для отбора свинок до

их включения в разведение. Чешский J.

Anim. Sci. 51 (6): 253-261.

Льюис, К.Р.Г. и К.Л. Бантер. 2011. Тело

развитие свиноматок, потребление корма и

материнская способность. Часть 1: продуктивность, показатели потребления корма до

и кормления в период лактации

первородящих свиноматок.J. Anim. Sci. 5: 1843-

1854.

Lonergan, S. M., E. Huff-Lonergan, L.J. Rowe,

D.L. Кухлерса и С. Юнгст. 2001.

Отбор

свиней дюрок с целью обеспечения экономичного роста свиней влияет на качество свинины. J. Anim.

Sci. 79: 2075–2085.

Матжик А.А. и И.М. Сумертаджая. 2002.

Perencanaan dan Percobaan dengan Aplikasi

SAS dan Minutab. Издание 2-е.Богор.

Богорский сельскохозяйственный университет.

МакГлон, Дж. Дж. И У. Понд. 2003. Свинья

Производство: биологические принципы и приложения

. Delmar Learning, Clifton

Сравнительные характеристики экзотических пород свиней (К.Н. Зебуа и др.) 151

Породы свиней — Свинина Юта

Йоркшир

Йоркшир
Мать Порода

Йоркширская порода известна как «материнская порода», потому что йоркширские свиноматки характерны для опороса и выращивают большие пометы свиней.Йоркширы — это свиньи с большими рамками, особенно по длине, что позволяет продавать их с более тяжелым весом без потери эффективности. Йоркширские курганы по годам рекордов Национальной выставки курганов в среднем составляют более 32 дюймов в соревнованиях по тушам, что неизменно длиннее, чем у любой другой породы, и даже длиннее, чем у помесей. Пятилетняя испытательная станция для йоркширских хряков при доведении до 240 фунтов прибавила в среднем 2,07 в день при эффективности корма 2,55, что является максимальным показателем в обеих категориях для всех пород.

Дюрок

DUROC
Они растут на вас.

Красная порода свиней, известная как дюрок, вносит основной вклад почти в каждое успешное свиноводство. Эта порода давно известна своей способностью расти быстрее при меньшем количестве корма. Способность дюрок демонстрировать высокую скорость роста, совпадающую с эффективным преобразованием фунта корма в фунты красного мяса, не имеет себе равных среди других пород. Используя чистокровных хряков дюрок в коммерческих целях, производитель может максимизировать гетерозис, возникающий при скрещивании чистых генетических линий.Скелетная структура Duroc, устойчивая к любым условиям окружающей среды, в сочетании с естественной компактностью позволяет производить быстрорастущий и эффективный продукт, приемлемый для упаковщика и потребителя. Это гарантирует, что порода дюрок будет и дальше играть неотъемлемую роль в производстве свинины для разборчивых американцев.

Хэмпшир

HAMPSHIRE
Ремень-клеймо кабана

Это черное животное имеет отчетливый и уникальный пояс, который представляет собой белую полосу, полностью охватывающую все тело, включая передние лапы и ступни.Хэмпширы производительны, худощавы, выгодны для выращивания и полны мяса. Хряки Хэмпшира агрессивны, а самки Хэмпшира завоевали репутацию в коммерческой свиноводческой отрасли как отличные свиноматки, которые увеличивают продолжительность жизни стада свиноматок.

Это черное животное с белым поясом известно повсеместно как «Знак мясного борова». Их способность производить выигрышные тушки не имеет себе равных, и они продолжают устанавливать стандарт, по которому оцениваются все остальные конечные производители.

Ландрас

LANDRACE
Универсальная порода

Ландрас превосходит по материнским показателям.Университетские испытания показали, что они входят в состав 5 из 6 лучших комбинаций пород F1 по показателям помета до 21-дневного возраста. Ландрас также находится на вершине или близко к вершине по количеству живорожденных и индивидуальному весу свиней при отъеме. Результаты теста потомства Национальной выставки Барроу показывают, что чистокровный ландрас занимает третье место по темпам роста, отставая от лидера всего на 0,1 фунта в день, и является самым худым по последнему ребру и вторым по толщине шпиком 10-го ребра. По длине туши они превосходят все породы. Генетическая оценка кроссадов привела к значительному улучшению продуктивности породы и туши.Эти изменения плюс эффективный отбор на более мелкие уши и сильные ноги сделали ландрас важным компонентом успешных программ скрещивания.

Польша Китай

ПОЛЬША КИТАЙ
Больше прочности

Польша Китай Китай предлагает коммерческое свиноводство, увеличивающее продолжительность жизни свиноматки и производительность коровника. Высокий процент постного мяса в Польше давно известен производителям свинины и еще более важен сегодня, поскольку все больше рынков платят за туши с высоким процентом постного мяса.Польские хряки и свиноматки выделяются практическими и прибыльными качествами, важными для рентабельного производства свинины — естественной прочностью, прочной, прочной структурой и способностью адаптироваться практически к любой среде, от пастбищ до закрытых помещений. Польские свиноматки остаются в стабильном состоянии, помет за пометом и превосходно работают в помещении для опороса.

Пятнистый

ТОЧКА
Они доставят

Нет никаких сомнений в важности выносливого, долговечного посевного материала для вашего стада, и пятнистая порода обеспечивает именно это.Спотовые хряки суровы, а также агрессивны в разведении, поэтому для выполнения работы не нужно использовать «детские перчатки». Они просто из тех свиноматок, которые могут быстро решить проблемы с оплодотворением. Репродуктивная способность также является сильной стороной пятнистой самки. Она вырастит то, что опоряет, и будет поддерживать при этом свое состояние. Выносливая сука пятнистой самки оказывает большое влияние на способность породы вносить законный вклад в пополнение запасов свиней в коммерческих операциях.Сегодняшний производитель свинины имеет широкий выбор генетических продуктов. Пятнистая порода является важной частью этого пула, особенно когда требуется дополнительная репродуктивная эффективность, выносливость, выносливость и агрессивность кабана.

Беркшир

БЕРКШИРЫ
Фактор удержания

Беркширская порода — единственный генетический источник в свиноводстве, который имеет премиальную ценность, основанную на известном превосходном качестве свинины.Научно доказано, что свинина Berkshire имеет лучший цвет, текстуру, мраморность, предельный pH и водоудерживающую способность — все это известные факторы, влияющие на качество еды и превращение свинины в предпочтительное мясо. Некоторые упаковщики платят за свиней с рынка Berkshire значительные наценки. Простой управленческий выбор — отбор чистокровных генетиков Berkshire с должным образом переданной родословной откроет двери для новых возможностей получения прибыли, которых нет нигде во всей свиноводческой отрасли. Сегодняшние беркширы были выведены так, чтобы быть сильными в прибыльных сферах — как по материнской линии, так и в качестве конечного производителя.Надбавки Berkshire могут быть реализованы на любом предприятии — большом или малом, и представляют собой прекрасную возможность сохранить жизнеспособность свиноводства на семейных фермах в будущем.

Честер Уайт

CHESTER WHITE
Материнская мускулатура

Поскольку все начинается в загоне для разведения, становится экономически необходимо внедрять генетику, обеспечивающую высокий уровень оплодотворения. Суки Честер Уайт издавна известны высоким уровнем оплодотворения и большим количеством крепких свиней в помете.У них лучшие предрасположенности, и они остаются продуктивными для большего паритета. Фактически, испытание Университета штата Айова показало, что у свиноматок Честера уровень оплодотворения на 12% выше, чем у трех других протестированных пород, и они заняли первое место по количеству опоренных, отнятых от груди и проданных свиней на одну свиноматку. Порода Честер Уайт практически лишена гена стресса. В документе, представленном на семинаре Центра промышленности штата Айова, показано, что Честер Уайт — одна из трех пород, которые неизменно демонстрировали превосходное мясо и пищевые качества. При скрещивании с другими породами типичной реакцией является высокий уровень гетерозиса.

границ | Сети эпистатического взаимодействия в масштабе всего генома, влияющие на эффективность корма у свиней дюрок и ландрас

Введение

Генетические или эпистатические взаимодействия между SNP, генами или QTL являются темой, представляющей интерес для молекулярной и количественной генетики (Cordell, 2002), поскольку это происходит, когда фенотипическая Эффект мутации зависит от наличия других мутаций в геноме (Papp and Pál, 2011). Изучение эпистаза увлекло биологов, поскольку эти взаимодействия являются ключом к пониманию функциональных взаимосвязей генов.На основе знаний, полученных в результате полногеномных ассоциативных исследований (GWAS), объективный обзор однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в геноме, анализируемый коммерческими платформами SNP, проверяется на ассоциацию с интересующим фенотипическим признаком. Хотя большинство этих SNP в значительной степени связаны, они показали небольшой эффект и составляют небольшую долю наследственной дисперсии (Frazer et al., 2009; Manolio et al., 2009; Eichler et al., 2010).

Эпистатические взаимодействия между генами некоторых количественных признаков, таких как качество мяса (Ovilo et al., 2002; Duthie et al., 2011a), туша (Duthie et al., 2010), репродуктивные признаки (Bidanel, 1993; Rodríguez et al., 2005; Noguera et al., 2009), рост (Crooks and Guo, 2017) и о характеристиках мышечных волокон (Estellé et al., 2008) сообщалось о свиньях. Эти данные проливают свет на различные взаимодействия, лежащие в основе геномной регуляции по нескольким признакам. Хотя сообщалось о большом количестве исследований GWAS по эффективности корма и особенностям пищевого поведения у свиней (Ding et al., 2017; Reyer et al., 2017b; Динг и др., 2018; Zhang et al., 2018), эпистатические эффекты этих признаков до сих пор не исследованы. При использовании 88 микросателлитных маркеров у свиней (Duthie et al., 2011b) были обнаружены эпистатические QTL (локусы количественных признаков) для роста, потребления корма и химического состава тела на разных стадиях роста. Однако, насколько нам известно, исследований эпистатических взаимодействий по всему геному с использованием высокопроизводительных геномных данных (HTG) и в контексте генетических (SNP) сетей, лежащих в основе признаков, связанных с эффективностью корма, у свиней не проводилось.

GWAS представляет собой одноэтапный подход, проверяющий каждый SNP с интересующей характеристикой, что вызывает множество проблем при тестировании. Кроме того, из-за высоких строгих пороговых значений некоторые из наиболее биологически значимых SNP упускаются. Таким образом, поиск отсутствующей наследуемости признаков привел нас к включению генетических или эпистатических взаимодействий, поскольку это помогло бы нам идентифицировать маркеры, объясняющие более высокую долю наследственной дисперсии. Более того, если все эпистатические SNP будут идентифицированы, это поможет создать основу для явного включения эпистатической дисперсии в будущие методы геномного прогнозирования в дополнение к аддитивной дисперсии.Такой подход повысит точность геномного прогнозирования FE и поможет свиноводству.

Методы системной геномики и сетевой биологии сосредоточены на обнаружении взаимодействий между генами и соотнесении их с фенотипом или проявлением болезни (Suravajhala et al., 2016). Сетевой метод WISH (Weighted Interaction SNP Hub) (Kogelman and Kadarmideen, 2014) был предложен для расчета эпистатических взаимодействий по всему геному и построения эпистатических сетей, лежащих в основе сложных фенотипов.Этот метод, недавно реализованный в R в виде пакета WISH-R (Carmelo et al., 2018), обнаруживает общегеномные взаимодействия между однонуклеотидным полиморфизмом (SNP) и признаками в высокопроизводительных геномных данных (HTG). WISH-R рассчитывает эпистаз и конструирует биологические сети с использованием структуры анализа сети взвешенной коэкспрессии генов (WGCNA) (Langfelder and Horvath, 2008). Здесь основное предположение WGCNA для кластеризации данных экспрессии генов используется для данных HTG для разработки безмасштабной взвешенной сети генетического взаимодействия для обнаружения биологически релевантных генетических модулей и биологических путей для сложных признаков.Здесь мы провели геномное сканирование на предмет эпистатического взаимодействия с последующим сетевым анализом для изучения степени эпистатических взаимодействий, лежащих в основе характеристик эффективности корма у свиней дюрок и ландрас. Кроме того, мы сообщили о биологических путях между породами и эффективными и неэффективными животными.

Материалы и методы

Дизайн исследования и фенотипы

Общий обзор дизайна исследования и основных этапов анализа представлен на Рисунке 1.Экспериментальное испытание проводилось на станции тестирования свиней «Bøgildgård», управляемой SEGES в рамках Landbrug и Fødevarer (L&F: Датский совет по сельскому хозяйству и продовольствию). Свиньи кормили ad libitum и подавали бесплатную воду. Авторы этого исследования не несут ответственности за животноводство, диету и уход, поскольку испытательная станция является объектом датской селекционной программы, проводимой SEGES.

Рис. 1 Схематическое изображение плана исследования и этапов анализа.

Образцы крови в Бёгильдгарде были собраны из яремной вены от каждой свиньи в пробирки, содержащие ЭДТА, и немедленно помещены на лед. Свиньи были чистокровными некастрированными самцами пород Данбред Дюрок (n = 59) и Данбред Ландрас (n = 50), всего 109 голов. Далее в статье породы упоминаются как дюрок и ландрас.

Для фенотипических признаков измеряли вес потребленного корма (FC) и FE для каждой свиньи на этапе тестирования, начиная с начальной массы около 28 кг для каждого животного.Фаза тестирования варьировалась от 41 до 70 дней в зависимости от жизнеспособности каждой свиньи. Вес тела в начале и в конце теста регистрировался в соответствии со стандартной процедурой тестирования испытательной станции, и их разница была обозначена как дельта-вес (DW). Коэффициент конверсии сырья (FCR) рассчитывали как соотношение между количеством FC и DW. Аналогичным образом, остаточное потребление корма (RFI) оценивалось как разница между наблюдаемым суточным потреблением корма (DFI) и прогнозируемым потреблением корма (pDFI) (Nguyen and McPhee, 2001).Сводка признаков представлена ​​в таблице 1. Животные также были классифицированы как группы с низкой и высокой кормовой эффективностью (LFE и HFE, соответственно) на основе конечных значений FCR для каждой породы. Это было сделано путем отбора свиней, которые были на одно стандартное отклонение выше или ниже среднего FCR для каждой породы, в результате было получено 15 образцов в группах LFE и HFE. Внутригрупповой анализ проводился с использованием RFI и FCR в качестве непрерывного признака.

Таблица 1 Описательная статистика фенотипических признаков от Duroc и Landrace, оцененных по признакам, связанным с эффективностью корма.

Генотипирование, контроль качества и ассоциация SNP

Выделение ДНК

было выполнено из собранной крови, а генотипирование SNP было передано на аутсорсинг компании GeneSeek (компания Neogen — https://www.neogen.com/uk/). Генотипирование проводили с использованием массива GGP Porcine HD (GeneSeek, Шотландия, Великобритания), включающего более 68 516 SNP в 18 аутосомах и двух половых хромосомах.

Контроль качества генотипа (QC) проводили с использованием программного обеспечения Plink (Purcell et al., 2007). Образцы со степенью генотипирования ≤ 90% маркеров были отфильтрованы.SNP с частотой вызовов <90%, частотами минорных аллелей <0,01 и равновесием Харди-Вайнберга (HWE) P <1 × 10 904 · 10-7 , а также SNP, расположенные на половых хромосомах, а также без информации о положении также были исключены. из набора данных.

Для выявления значимых SNP, связанных с FCR, как среди, так и внутри пород (группы LFE и HFE), мы провели ассоциативный анализ с использованием Plink версии 1.07 на основе функции « assoc ». Для этого были приняты два следующих подхода: сначала мы провели анализ по породе с учетом всей популяции (Дюрок — 59 образцов и Ландрас — 50 образцов).Затем ассоциация была также выполнена внутри групп для каждой породы для определения групповых SNP. Вычисленные значения p использовались на более поздних этапах в качестве фильтра.

Анализ парных взаимодействий на уровне всего генома

Мы провели общегеномную ассоциацию для изучения эпистатических взаимодействий для показателей эффективности корма у свиней дюрок и ландрас, применяя пакет WISH-R (Carmelo et al., 2018) на основе по методу WISH (Kogelman, Kadarmideen, 2014). Чтобы идентифицировать специфичные для породы и групповые взаимодействия SNP, мы выбрали 7000 лучших SNP, связанных с FCR, из каждого анализа, а затем выполнили расчет эпистатического взаимодействия индивидуально для каждой породы и каждой группы (LFE, HFE).Выбранные SNP были отсечены на предмет неравновесия по сцеплению (LD) с использованием функции « LD_blocks » с максимальным размером блока 1000 и порогом = 0,9 из пакета WISH-R (Carmelo et al., 2018). Кроме того, функция « epistatic.correlation » с учетом параметров по умолчанию использовалась для расчета эпистатического взаимодействия между оставшимися SNP (Kogelman and Kadarmideen, 2014; Carmelo et al., 2018). FCR использовался как непрерывный признак в анализах групп LFE и HFE и для обеих пород.

Модель гетерогенности, используемая для расчета эпистаза, имеет вид:

y = μ + β1snpi + β2snpj + β3 (snpi x snpj) + ε

, где y — интересующий фенотип, µ — точка пересечения, β ₁ и β ₂ — главные эффекты SNP, ϵ — случайный остаточный эффект, β ₃ представляет эпистаз двух локусов. Чтобы представить генотип snp _i и snp _j , данные генотипа были закодированы как 2 (минорные аллели гомозиготы), 1 (гетерозиготы) или 0 (основные аллели гомозиготы) на основе функции « генерировать.генотип »в WISH-R, который использует файл в формате PED и TPED от Plink (Purcell et al., 2007).

Эпистатические взаимодействия ( β ₃ ), оцененные с помощью WISH-R, были визуализированы с использованием функции « геном. Взаимодействие » с размером квантиля 0,9. Обзор взаимодействия по всему геному был рассчитан с использованием значений квантилей значимости взаимодействия между хромосомами. Это указывало на хромосомные горячие точки для взаимодействия данного фенотипа.Настройки WISH-R по умолчанию использовались для расчета хромосомных взаимодействий.

Эпистатические сети и анализ ассоциаций признаков

Рассчитанные коэффициенты эпистатической корреляции SNP-SNP использовались для построения эпистатических сетей, следующих за конвейером WISH-R, который идентифицировал модули SNP, связанные эпистазом. Затем мы суммировали модули, основанные на модуле eigenSNP (MSNP), и связали MSNP с интересующими характеристиками. Мы построили взвешенную сеть со знаком, используя « generate.модуль ”, отдельно для обеих пород, а также для групп LFE и HFE в каждой породе. Сильно коррелированные модули были объединены с помощью функции « mergeCloseModules» .

Чтобы распутать биологически значимые модули, мы использовали модуль eigenSNP для изучения взаимосвязи между FCR и модулями, что привело к тесту ассоциации модулей в масштабе всего генома. Мы также включили RFI в анализ ассоциации, чтобы определить эпистатические SNP для обоих признаков.

Три верхних значимых модуля (p ≤ 0.05 и r> 0,4) были выбраны для последующего анализа, чтобы раскрыть биологические пути, лежащие в основе признаков. Используемые P-значения были скорректированы с использованием подхода Бонферрони, обозначенного как P _adj . Самые высокие взаимодействующие SNP были определены с учетом оценки связности SNP с помощью функции « softConnectivity » (Langfelder and Horvath, 2008). SNP из наиболее значимых модулей были названы SNP-концентраторами и выбраны для дальнейшего анализа.

Аннотация сети SNP-SNP и идентификация генов

Аннотация SNP была сделана с использованием BiomaRt (пакет R) (Durinck et al., 2005; Durinck et al., 2009) из базы данных Porcine Ensembl , Sscrofa11.1 . Неопознанная аннотация SNP от Biomart была сделана с помощью g: Convert in g: Profiler (https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/convert) (Reimand et al., 2007). Онтологии генов (GO), канонические пути и биологическая интерпретация были выполнены из ClueGO версии 2.5.4 (плагин Cytoscape) (Bindea et al., 2009) на основе аннотации Sus scrofa . Пути KEGG, чрезмерно представленные в выбранных модулях, были идентифицированы путем группирования избыточных терминов с каппа-оценкой = 0.4. Были выбраны пути с GroupPValue ≤ 0,05, и сеть была визуализирована с помощью Cytoscape версии 3.7.1 (https://cytoscape.org/) (Shannon et al., 2003). Тепловая карта была построена с использованием пакета R pheatmap с учетом -log10 (GroupPvalue) для суммирования путей внутри и между группами.

Результаты

Эпистатические взаимодействия в масштабе всего генома

После контроля качества (QC) 48 444 и 49 876 локусов в Duroc и Landrace на 18 аутосомах свиней были доступны для анализа ассоциации с FCR.Аналогичным образом, 51 852 и 51335 SNP от Duroc и Landrace, соответственно, прошли QC в группах LFE и HFE.

Из анализа ассоциаций были отобраны 7000 лучших SNP, и на основе пакета WISH-R (Carmelo et al., 2018) мы рассчитали эпистатические взаимодействия на основе FCR как в породах, так и в группах пород (рис. ). В Дюроке, учитывая все население, горячие точки хромосом были широко распространены. Однако в группе Duroc с низкой эффективностью кормления (DLFE) попарное взаимодействие было более очевидным в хромосомах 10, 16 и 17 (рис. 2).Из группы Duroc, высокоэффективной (DHFE) (рис. 2), попарные взаимодействия были очевидны в хромосомах 4, 7 и 13. Хотя широко распространенное попарное взаимодействие наблюдалось в отношении всей популяции ландрасов (рис. 2), попарные взаимодействия были очевидны. Взаимодействие в группе с низкой эффективностью корма (LLFE) было очевидным только в хромосомах 8 и 18 (Рисунок 2), тогда как хромосома 14 выделялась группой с высокой эффективностью питания (LHFE) (Рисунок 2).

Рисунок 2 Парное хромосомное взаимодействие.DLFE и DHFE представляют группы Duroc с низкой и высокой кормовой эффективностью, LLFE и LHFE представляют группы Landrace с низкой и высокой кормовой эффективностью, соответственно.

Анализ сети SNP-SNP

Кластеризовав 5 191 оставшийся SNP после удаления LD, мы идентифицировали 10 модулей в Duroc. На основании наших критериев r> 0,4 ​​и значения p ≤ 0,05 для дальнейшего анализа были выбраны три модуля. Среди характеристик модуля значимо были связаны MEpink (297 SNP), MEblue (637 SNP) и MEred (313 SNP) (P _adj <0.01) с признаками FCR и RFI (рис. 3A). Для Landrace 5580 SNP были сгруппированы в 11 модулей после LD-сокращения. Среди идентифицированных модулей MEbrown (593 SNP), MEpink (113 SNP) и MEyellow (509 SNP) были наиболее значимыми модулями, связанными с FCR и RFI. (Рисунок 3B). Список SNP-концентраторов и их оценка связности приведены в дополнительной таблице 1.

Рисунок 3 Дендрограмма и графики корреляции модуля-признака в A: Duroc и B: Landrace, с FCR и RFI в качестве непрерывного признака.Верхняя панель каждого графика (A, B) представляет дендрограмму кластеризации SNP, полученную путем иерархической кластеризации несходства на основе TOM с соответствующими цветами модуля, указанными в строке цветов. Каждая цветная строка представляет модуль с цветовой кодировкой, который содержит группу сильно связанных SNP. Средняя панель каждого графика (A, B) представляет корреляцию характеристик модуля, где ось x представляет коэффициент конверсии корма (FCR) в первом столбце и остаточное потребление корма (RFI) во втором столбце; ось Y представляет модули.Цветовой код на графиках корреляции модуля и признака основан на корреляции Пирсона (p-значения в скобках). Положительные и отрицательные корреляции показаны красным и зеленым цветами соответственно. Нижняя панель представляет количество SNP, сгруппированных в каждом модуле.

Аналогичным образом взаимодействие SNP-SNP было рассчитано в группах LFE и HFE для обеих пород. В группе DLFE 5081 SNP были протестированы на взаимодействие после обрезки LD. SNP были сгруппированы в 20 модулей, в которых MElightgreen с 80 SNP оказался единственным модулем, значимым для FCR (r = –0.55, значение p = 0,03) и RFI (r = –0,52, значение p = 0,05) (рис. 4A). Что касается группы DHFE, было протестировано 5 118 SNP, которые были сгруппированы в 13 модулей. MEblack (198 SNP) значимо коррелировал с RFI (r = –0,61, p-значение = 0,02) (рис. 4B). Значимой связи для FCR не выявлено.

Рис. 4 Дендрограмма и графики корреляции модуля и признака в группах A: низкий по дюроку и B: по дюроку с высокой эффективностью корма. Верхняя панель каждого графика (A, B) представляет дендрограмму кластеризации SNP, полученную путем иерархической кластеризации несходства на основе TOM с соответствующими цветами модуля, указанными в строке цветов.Каждая цветная строка представляет модуль с цветовой кодировкой, который содержит группу сильно связанных SNP. Средняя панель каждого графика (A, B) представляет корреляцию характеристик модуля, где ось x представляет коэффициент конверсии корма (FCR) в первом столбце и остаточное потребление корма (RFI) во втором столбце; ось Y представляет модули. Цветовой код на графиках корреляции модуля и признака основан на корреляции Пирсона (p-значения в скобках). Положительные и отрицательные корреляции показаны красным и зеленым цветами соответственно.Нижняя панель представляет количество SNP, сгруппированных в каждом модуле.

Из группы LLFE, 4814 SNP были протестированы и сгенерированы в 22 модуля. Модуль MEcyan, включающий 146 SNP (r = –0,54, p-value = 0,04), достоверно коррелировал с FCR. Никаких значимых ассоциаций для RFI выявлено не было (рис. 5A). Среди 7547 SNP в группе LHFE было идентифицировано 29 модулей, и MEdarkolivegreen (r = –0,53, p-значение = 0,04) со 170 SNP и MEpaleturquoise (r = -0,6, p-value = 0,02) с 62 SNP значимо коррелировали с FCR. и RFI, соответственно (Рисунок 5B).

Рис. 5 Дендрограмма и графики корреляции модуля и признака в группах А: Ландрас с низким содержанием корма и В: Ландрас с высокой эффективностью корма. Верхняя панель каждого графика (A, B) представляет дендрограмму кластеризации SNP, полученную путем иерархической кластеризации несходства на основе TOM с соответствующими цветами модуля, указанными в строке цветов. Каждая цветная строка представляет модуль с цветовой кодировкой, который содержит группу сильно связанных SNP. Средняя панель каждого графика (A, B) представляет корреляцию характеристик модуля, где ось x представляет коэффициент конверсии корма (FCR) в первом столбце и остаточное потребление корма (RFI) во втором столбце; ось Y представляет модули.Цветовой код на графиках корреляции модуля и признака основан на корреляции Пирсона (p-значения в скобках). Положительные и отрицательные корреляции показаны красным и зеленым цветами соответственно. Нижняя панель представляет количество SNP, сгруппированных в каждом модуле.

Аннотации SNP и визуализация сети

SNP-концентраторы были идентифицированы (дополнительная таблица 1) из значительно коррелированных модулей (P ≤ 0,05), как описано выше. Сводка аннотированных SNP-концентраторов представлена ​​в таблице 2.

Таблица 2 Значимые SNP для FCR и RFI, аннотированные для анализа пути.

В Duroc из 1247 hub-SNP 43% SNP располагались в межгенных регионах, за ними следуют 40% в интронных вариантах (рис. 6A — круговая диаграмма). Что касается Landrace, из 1215 идентифицированных Hub-SNP, 43% SNP были интронными вариантами, за которыми следовали 40% SNP в межгенных регионах (Рисунок 6B — круговая диаграмма). Распределение SNP по хромосомам, идентифицированным по значимым модулям, и количество SNP, аннотированных для каждой породы, представлены на столбчатой ​​диаграмме для Дюрока и Ландраса, соответственно (Рисунки 6A, B — столбчатая диаграмма).

Рисунок 6 Графическое представление идентифицированного типа варианта (круговая диаграмма) и распределения SNP по хромосомам, идентифицированным в верхних значимых модулях (столбик) для (A) Duroc и (B) Landrace.

Для Duroc (1247 узловых SNP) и Ландрас (1215 узловых SNP) было обнаружено только 64 SNP, в то время как 1183 SNP были уникальными для Duroc и 1151 были уникальными для Ландрас. В группах DLFE и DHFE с 80 и 198 Hub-SNP, соответственно, четыре SNP были общими, что указывало на разницу во взаимодействии SNP у обеих пород.В группах LLFE и LHFE, среди 146 и 232 узловых SNP в каждой группе, соответственно, было найдено только шесть общих между ними. Аннотированные SNP-концентраторы (таблица 2), соответствующие генам, были подвергнуты анализу путей в ClueGO для сбора биологической информации о каждом гене во всех группах. Значимые пути (GroupPValue ≤ 0,05), лежащие в основе SNP-концентраторов, идентифицированные для каждой породы и в группах с низкой и высокой эффективностью кормления, приведены в дополнительной таблице 2 и на рисунке 7.

Рисунок 7 Перепредставленные пути передачи сигналов генов, идентифицированных из хаб-SNP в каждой породе с группами с низкой и высокой кормовой эффективностью.График имеет цветовую кодировку на основе -log10 (GroupPvalue) различных путей.

Пути, идентифицированные в Дюроке, указывают на метаболизм инозитолфосфата, сигнальный путь Erb , сигнальный путь Ras и сигнальный путь Rap1 . Для группы DLFE взаимодействие SNP-SNP указывало на метаболизм тиамина и метаболизм фенилаланина, тирозина и триптофана. В группе DHFE путями, возникающими в результате взаимодействия, были сигнальный путь гиппопотама и биосинтез гликозаминогликанов.В Ландрасе основными задействованными путями были путь передачи сигналов cGMP-PKG, путь передачи сигналов цАМФ, путь передачи сигналов MAPK, синтез и секреция альдостерона, а также синтез гормонов щитовидной железы. Было обнаружено, что деградация лизина является наиболее значимым путем, лежащим в основе группы LFE. Кроме того, чрезмерно представленные пути включают метаболизм аргинина и пролина, а также биосинтез жирных кислот. Такие пути, как удлинение и деградация жирных кислот, деградация валина, лейцина и изолейцина, деградация лизина и метаболизм триптофана, были идентифицированы для группы LHFE (рис. 7).

Аннотации гена, ссылочный идентификатор SNP, Sus scrofa EnsemblID, хромосома, в которой расположены SNP, и их оценки связности, рассчитанные для каждой породы и групп LFE и HFE, приведены в дополнительной таблице 3. Более высокое значение связности оценки (в сотнях и выше) показывают, что данные демонстрируют сильный фактор, который делает подмножество выборок глобально отличным от остальных.

Обсуждение

Кормовая эффективность свиней является важным количественным признаком, на который влияет комплексный генетический контроль.Понимание молекулярных механизмов, лежащих в основе этого сложного признака, поможет в эффективном отборе свиней, что принесет пользу производителям свиней. В датском свиноводстве дюрок в настоящее время используется в качестве конечных производителей в сочетании с помесью семей ландрас х йоркширский (Do et al., 2013). Акцент при отборе на эффективность корма в Дюроке больше, чем в Ландрасе. В нашем исследовании мы обнаружили, что Ландрас имеет значительно больший FCR по сравнению с Дюроком, это также согласуется с исследованиями, о которых сообщалось ранее (Jensen et al., 2007; Do et al., 2013).

Сообщалось о множестве исследований GWAS и QTL для определения эффективности корма у свиней. Однако, насколько нам известно, генетические сети, основанные на данных HT SNP для FE с использованием полногеномных эпистатических взаимодействий, не наблюдались у свиней дюрок и ландрас. В этом исследовании мы использовали полногеномные SNP, чтобы выяснить генетический вклад эпистатических эффектов в фенотипическую изменчивость таких характеристик, связанных с эффективностью корма, как FCR и RFI у свиней. Для этой цели мы использовали высокопроизводительные данные генотипа SNP, сгенерированные с помощью массива GGP Porcine HD, для поиска сигнатурных SNP, которые сильно взаимодействуют друг с другом, с последующим анализом избыточного представления сетей и путей, тем самым лежащих в основе связанных с FE признаков у датских производственных свиней.

Попарное взаимодействие варьировалось как между породами, так и внутри групп с низкой и высокой эффективностью корма в каждой породе. Хотя это не дает точного представления об индивидуальных взаимодействиях, это указывает на то, какие хромосомы могут быть горячими точками для взаимодействий данного фенотипа. Из сетевого анализа мы обнаружили несколько модулей, связанных с FCR и RFI у обеих пород, а также в группах с низкой и высокой эффективностью корма каждой породы, указывающих на пути, влияющие на эти признаки.

На основании анализа путей репрезентативности в Duroc были идентифицированы сигнальный путь Rap1, и Ras , метаболизм инозитолфосфата, путь передачи сигналов ErbB, синтез тироидных гормонов, путь передачи сигналов адипоцитокинов. Из взаимодействия SNP-SNP в DLFE было обнаружено участие метаболизма тиамина, биосинтеза фолиевой кислоты и метаболизма фенилаланина, тирозина и триптофана. В группе DHFE путями, возникающими в результате взаимодействия, были путь передачи сигналов гиппопотама, биосинтез гликозаминогликанов, биосинтез гликозилфосфатидилинозитола (GPI) -якоря и метаболизм азота.В Ландрасе основными задействованными путями были путь передачи сигналов cGMP-PKG, путь передачи сигналов цАМФ, путь передачи сигналов MAPK, синтез и секреция альдостерона и синтез гормонов щитовидной железы. Кроме того, было обнаружено, что деградация лизина является наиболее значимым путем, лежащим в основе группы LLFE, за которым следуют метаболизм аргинина и пролина и биосинтез жирных кислот, как некоторые другие пути. Для группы LHFE были идентифицированы такие пути, как удлинение и деградация жирных кислот, деградация валина, лейцина и изолейцина, деградация лизина и метаболизм триптофана.

mTOR и MAPK: ключевые пути передачи сигналов в Duroc

Основные пути, чрезмерно представленные в Duroc, включали сигнальный путь ErbB, пути Ras и Rap1. Путь передачи сигналов ErbB связан с геном NRG4 , как указано в нашем исследовании. Тирозинкиназы рецептора ErbB включают рецептор эпидермального фактора роста (EGFR), ErbB2, ErbB3 и ErbB4. Они важны для поддержания гомеостаза кишечника (Schumacher et al., 2017). Они показали, что лечение активированных провоспалительных макрофагов лигандом ErbB4 нейрегулином-4 ( NRG4 ) индуцирует апоптоз (Schumacher et al., 2017). Одной из основных нижестоящих мишеней семейства тирозиновых рецепторов ErbB является P13-K / Akt (Schuurbiers et al., 2009). Активация этого пути достигается после активации EGFR и четырех членов семейства ErbB. EGFR сам по себе является слабым активатором P13-K, но соединяется с путем Ras / P13-K / Akt или взаимодействует с ErbB3 (Schuurbiers et al., 2009). Ras вместе с Rap1 играют критическую роль в регуляции реакции пролиферации Т-клеток (Remans et al., 2004). Ras передает сигналы от TCR к активации сигнального каскада Raf-1 / ERK, необходимого для пролиферации Т-клеток, продукции IL-2 и созревания тимуса.Тесно связанный, Rap1 стимулирует TCR и подавляет Ras-зависимую трансформацию (Remans et al., 2004). P13Ks фосфорилируют 3′-гидроксильную группу инозитольного кольца фосфатидилинозитидов и делятся на три класса: P13K класса I, PIP3 и PIP2. PIP3 действует как вторичный мессенджер, облегчая набор и активацию PI3K-зависимой киназы-1 ( PDK1 ) (Yu and Cui, 2016). Продолжительность передачи сигналов PIP3 регулируется фосфатазой и гомологом тензина ( PTEN ), который действует, чтобы противодействовать активности PI3K.Серин / треонинкиназа AKT, также известная как протеинкиназа B ( PKB ), обладает доменом PH и рекрутируется на плазматическую мембрану вместе с PDK1. Фосфорилирование аминокислотных остатков с помощью PDK1, и mTORC2 (субъединица mTOR из семейства киназ, родственных P13K), соответственно, необходимо для полной активации AKT (Yu and Cui, 2016). Предыдущие сообщения о AKT3 , который является ключевым регулятором пути P13 / Akt / mTOR, участвует в путях ErbB, Ras, Rap1, cGMP-PKG в нашем исследовании.Городиска и др. (2019) также сообщили, что Akt действует в сигнальных путях фактора роста гепатоцитов (HGF) и эпидермального фактора роста (EGF). Akt является членом семейства киназ Akt и играет важную роль в модуляции выживаемости и пролиферации клеток у свиней с высокой кормовой эффективностью (Horodyska et al., 2019). Ген ADCY8 , который участвовал в большинстве путей в нашем исследовании, был связан с уровнем холестерина у свиней (Bovo et al., 2019).

Гены ABL1 , MAP3K4 , MAP3K5 (chr 1), SEMA6A (chr 2), KITLG (chr 5) и KAT2B , идентифицированные из SNMP, сильно взаимосвязанные (chr 13) также указали на ErbB, Ras, Rap1, гормон щитовидной железы, сигнальные пути наведения аксонов в Duroc.Каскады митоген-активируемой протеинкиназы (MAPK), как было показано, играют ключевую роль в трансдукции внеклеточных сигналов в клеточные ответы (Zhang and Liu, 2002), а их сверхэкспрессия увеличивает ветвление аксонов (Kalil et al., 2011). SNP с наивысшей оценкой связности указывали на такие гены, как SEMA6A , ABLIM1 и NTNG1 , которые участвуют в пути наведения аксонов. SEMA6A подавлялся в скелетных мышцах свиней, как сообщалось в исследовании транскрипционной реакции на кормление свиней рационом, обогащенным льняным семенами (Wei et al., 2016). ABLIM1 и NTNG1 влияют на содержание внутримышечного жира (IMF) (Wang et al., 2017; Wang et al., 2019). Некоторые другие SNP с высоким показателем связности указывали на ген MAP3K5 , который был связан с остаточным потреблением корма (Pu et al., 2016). Путь передачи сигналов MAPK (ERK1 / 2) вызывает фосфорилирование серина с помощью MAPK нескольких нуклеопротеинов, включая ядерный рецептор тироидного гормона beta1, который активируется тироидным гормоном (Tang et al., 2004) . KAT2B участвует в сигнальном пути тироидного гормона.Системные эффекты, опосредованные гормонами щитовидной железы, вызывают метаболические сдвиги, характеризующиеся усилением липолиза и глюконеогенеза, что влияет на эффективность корма у свиней (Reyer et al., 2017a). MAPK регулируют (либо стимулируют, либо ингибируют) каталитическую активность и специфичность киназ и фосфатаз, которые участвуют в метаболизме фосфатидилинозитолов (PI) и инозитолфосфатов (IP), тем самым оказывая регулирующее действие на PI- и / или IP-зависимые сигнальные пути (Caldwell et al., 2006). Гены P14KB и PLCB1 , которые ускоряли метаболизм инозитолфосфата, были связаны с метаболизмом фосфата и эффективностью корма у Duroc (Ding et al., 2018). Сообщалось, что P14KB обогащен фосфатным метаболизмом у беркширских и корейских свиней (Edea and Kim, 2014).

Мы также сосредоточились на изучении путей, идентифицированных высоко взаимодействующими SNP в группах LFE и HFE обеих пород. В группе DLFE TPK1 (chr 9) в значительной степени участвовал в метаболизме тиамина.Самая активная форма витамина B1 — пирофосфат тиамина; для его синтеза у эукариот требуется тиаминпирофосфокиназа, которая катализирует перенос пирофосфатной группы от АТФ к тиамину (Tylicki et al., 2018). Сообщалось, что добавление тиамина молочному скоту увеличивает pH рубца и уравновешивает популяцию бактерий, продуцирующих и потребляющих молочную кислоту (Wang et al., 2015). Тиамин имеет решающее значение для клеточной функции, поскольку его фосфорилированная и активная форма, тиаминдифосфат (TDP), действует как кофермент для трех ключевых ферментов метаболизма глюкозы (Liu et al., 2017), который сильно различается в группах с высокой и низкой эффективностью корма (Fu et al., 2017).

Из DHFE гены CRB1 (chr 10), DLG2 (chr 9), PARD6G (chr 6) и PPP1CB (chr 3) указывали на сигнальный путь бегемота. Этот путь эволюционно консервативен и контролирует размер органа, регулируя пролиферацию клеток, апоптоз и самообновление стволовых клеток (Leno-colorado et al., 2017). Путь гликозаминогликанов с участием гена CHST4 (chr 6) также был значимым в группе HFE.Этот путь был идентифицирован в исследовании GWAS крупного рогатого скота на предмет роста и потребления компонентов для повышения эффективности корма (Serão et al., 2013).

Перекрестный разговор о путях цГМФ и цАМФ, регулирующих секрецию альдостерона в Ландрасе

Основными путями в Ландрасе были эндоцитоз и пути передачи сигналов, включая цГМФ-ПКГ, цАМФ, сигнальные пути эстрогена, адренергические сигналы в кардиомиоцитах, секрецию инсулина, синтез гормонов щитовидной железы, синтез альдостерона, боковой амиотрофический склероз и метаболизм пуринов.Циклические нуклеотиды 3 ‘, 5′-циклический аденозинмонофосфат (цАМФ) и 3′, 5’-циклический гуанозинмонофосфат (цГМФ) являются повсеместными внутриклеточными вторичными мессенджерами, которые регулируют множество физиологических функций (Павлаки, Николаев, 2018). Эпистатические SNP с высоким уровнем взаимодействия указывают на гены GABBR2, , GNA12, PRKCG из хромосомы 1, 3 и 6, которые лежат в основе путей тироидного гормона, cGMP-PKG и цАМФ. Фосфодиэстеразы (ФДЭ) представляют собой гидролизующие ферменты, которые прекращают внутриклеточные эффекты циклических нуклеотидов за счет их гидролиза и предотвращают непрерывную активацию нижестоящих эффекторных белков (Павлаки, Николаев, 2018).Было обнаружено, что цГМФ-регулируемые ФДЭ, особенно PDE2 , регулируют перекрестный обмен цГМФ-цАМФ (Павлаки и Николаев, 2018). Для секреции альдостерона необходим PDE2A-опосредованный гидролиз цАМФ (Павлаки, Николаев, 2018). Ген ATP1A2 , действующий в большинстве путей, как упомянуто выше, был вовлечен в производственные признаки у свиней (Stefanon et al., 2004), а также был связан с сигнальным путем cGMP-PKG в нашем исследовании. Адренергическая передача сигналов в кардиомиоцитах была здесь чрезмерно представлена, где участвовали CACNG7 и CACNG5 .Согласно исследованиям, опубликованным ранее, CACNG7 является геном-кандидатом с кормовой эффективностью у крупного рогатого скота Nelore (Olivieri et al., 2016), тогда как CACNG5 дифференциально экспрессировался и участвовал в активации сигнального пути MAPK у кур (Li et al., 2018). Путь MAPK активируется несколькими стимулами и преобразует сигнал внутри клеток, генерируя разнообразные ответы, включая пролиферацию клеток, дифференцировку в быстро обновляющемся эпителии, выстилающем желудочно-кишечный тракт (Osaki and Gama, 2013).

В Ландрасе деградация лизина была связана с группой LFE. Удлинение жирных кислот, синтез и деградация кетоновых тел, валин, лейцин и деградация изолейцина, деградация лизина, метаболизм триптофана, пирувата, пропаноата, бутаноата, глиоксилата и дикарбоксилата, ферроптоз и пути молекул клеточной адгезии были чрезмерно представлены в HFE. В нашем исследовании гены SETD7 (chr 8) и PLOD1 (chr 6) участвовали в деградации лизина. Лизин является ограничивающей аминокислотой, и ее дефицит ухудшает иммунитет и рост животных (Liao et al., 2015). В отчетах также предполагалось, что пищевая добавка с лизином влияет на всасывание в кишечнике и метаболизм аминокислот (Yin et al., 2017). Ограничение лизина подавляет транспорт лизина в кишечнике и способствует потреблению корма, связанному с кишечным микробиомом у поросят (Yin et al., 2017). Из группы LHFE ACAT1 (chr 9) участвовал в большинстве путей, которые также, как было установлено, влияют на метаболизм липидов в эффективности корма у свиней (Reyer et al., 2017a). Ген LPCAT3 , участвующий в ферроптозе, включает арахидоновую кислоту (липид) в мембрану клеток кишечника и печени, что позволяет триацилглицеринам собираться в липопротеины (Hashidate-Yoshida et al., 2015). Установлено, что триглицериды влияют на энергетическую ценность животных. Было обнаружено, что содержание основных компонентов триацилглицерина, насыщенных жирных кислот (НЖК) и мононенасыщенных жирных кислот (МНЖК) (Kasprzyk et al., 2015) ниже у высокоэффективных кормовых свиней (Horodyska et al., 2019).

Аннотированные SNP и гены, лежащие в основе обсуждаемых здесь значительных избыточно представленных путей, указывают на их роль в характеристиках, связанных с эффективностью корма. Мы также определили другие SNP с высокими значениями взаимодействия SNP-SNP, высокой оценкой связи и сгруппированы в выбранные модули.Однако они находились в межгенных регионах и поэтому не были включены в анализ генов и путей. Поскольку эти SNP встречаются в модулях, выбранных для обеспечения высокого эпистатического взаимодействия между собой, необходимо подробное изучение этих SNP, чтобы понять их роль в характеристиках, связанных с эффективностью корма.

Заключение

В этом исследовании применялся новый подход к изучению эпистатического взаимодействия по всему геному в количественных признаках с использованием высокопроизводительных геномных данных в контексте сетевой и системной биологии.Насколько нам известно, это первое исследование, в котором сообщается о таких общегеномных сетях генетического взаимодействия, лежащих в основе характеристик эффективности корма у свиней. Мы использовали WISH-R и другие сетевые подходы для поиска попарного взаимодействия SNP для признаков эффективности корма на основе данных генотипа на основе предшествующих биологических знаний и структур. Высоко взаимодействующие эпистатические SNP, которые сгруппированы вместе в значимые модули (r> 0,4, p ≤ 0,05), были идентифицированы у Дюрока и Ландрас во всей популяции по признакам FCR и RFI.Подход, использованный здесь, предоставил много интересных генов и взаимодействий со значительными p-значениями. В то время как некоторые из идентифицированных SNP-концентраторов были связаны с генами, хорошо известными своей связью с эффективностью корма, другие являются новыми и потенциально открывают новые возможности для дальнейших исследований. Основными перепредставленными путями в Дюроке были пути mTOR и MAPK. В Ландрасе основными путями были цАМФ, путь цГМФ-PKG, синтез и секреция альдостерона и метаболизм пуринов. Дальнейшая валидация эпистатических SNP и генов, идентифицированных здесь в более крупной когорте, поможет создать основу для моделирования эпистатической дисперсии в будущих методах геномного прогнозирования, которые включают эпистаз, повышение точности оценки генетической ценности FE, а также помощь в разведении свиней. промышленность.

Заявление о доступности данных

Мы сделали наши данные генотипа вместе с метаданными общедоступными в репозитории данных NCBI-GEO с регистрационным номером: GSE144064 и ссылкой: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ запрос / acc.cgi? acc = GSE144064.

Заявление об этике

Эксперимент по эффективности кормов был одобрен и проведен в соответствии с Министерством окружающей среды и продовольствия Дании, Инспекцией экспериментов на животных под номером лицензии (tilladelsesnummer) 2016-15-0201-01123, и выдано разрешение C. главному исследователю / старшему автору (HK).

Вклад авторов

HK задумал и разработал этот проект «FeedOMICS», получил финансирование в качестве основного заявителя. VC и HK разработали эксперименты по отбору проб крови, сбор фенотипических данных и биостатистический / биоинформатический анализ. PB и VC провели биостатистический и биоинформатический анализ данных. Все авторы сотрудничали в интерпретации результатов, обсуждении и написании рукописи. Все авторы прочитали, просмотрели и одобрили окончательную рукопись.

Финансирование

Это исследование финансировалось за счет гранта Датского независимого исследовательского фонда (DFF) — Технология и производство (FTP) (номер гранта: 4184-00268B).

Конфликт интересов

Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могли бы быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

Благодарности

ВК получила частичную докторскую степень. стипендии Копенгагенского университета и Датского технического университета.Авторы благодарят SEGES — Исследовательский центр свиней (VSP) Дания за доступ к образцам крови и наборам данных фенотипа, использованным в этом исследовании. Авторы благодарят всех сотрудников, которые помогли собрать образцы на центральной станции тестирования свиней в Бёгильдгарде, Дания.

Дополнительные материалы

Дополнительные материалы к этой статье можно найти в Интернете по адресу: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2020.00121/full#supplementary-material

Сокращения

Chr, Хромосома; DFI, суточное потребление корма; DHFE, Duroc с высокой кормовой эффективностью; DLFE, Duroc с низким расходом корма; ЭДТА, этилендиаминтетрауксусная кислота; FC — потребление корма; FCR, коэффициент конверсии корма; FE, эффективность корма; GWAS, исследование ассоциации всего генома; HTG, данные с высокой пропускной способностью; KEGG, Киотская энциклопедия генов и геномов; LD — нарушение равновесия по сцеплению; LHFE, Landrace высокоэффективный корм; LLFE, ландрас с низкой кормовой эффективностью; pDFI, Прогнозируемое ежедневное потребление корма; RFI, остаточное потребление корма; SNP, однонуклеотидный полиморфизм; TOM, матрица топологического перекрытия; WGCNA, Сетевой анализ взвешенной коэкспрессии генов; WISH, SNP-центр взвешенного взаимодействия.

Ссылки

Bidanel, J. P. (1993). Оценка параметров скрещивания между крупной белой и мейшанской породами свиней. III. Доминирование и эпистатические компоненты гетерозиса по репродуктивным признакам. Genet. Sel. Evol. 25, 263. doi: 10.1186 / 1297-9686-25-3-263

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Bindea, G., Mlecnik, B., Hackl, H., Charoentong, P., Tosolini, M., Kirilovsky, A., et al. (2009). ClueGO: плагин cytoscape для расшифровки функционально сгруппированных онтологий генов и сетей аннотаций путей. Биоинформатика 25 (8), 1091–1093. doi: 10.1093 / биоинформатика / btp101

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бово, С., Маццони, Г., Бертолини, Ф., Скьяво, Г., Галимберти, Г., Галло, М. и др. (2019). Полногеномные ассоциативные исследования 30 гематологических и клинико-биохимических признаков крови у крупных белых свиней выявили области генома, влияющие на промежуточные фенотипы. Sci. Реп. 9 (7003), 1–17. doi: 10.1038 / s41598-019-43297-1

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Caldwell, K.К., Соса, М., Бакли, К. Т. (2006). Идентификация сайтов стыковки митоген-активируемых протеинкиназ в ферментах, метаболизирующих фосфатидилинозитолы и инозитолфосфаты. Cell Commun. Сигнал. 4 (2), 1–18. doi: 10.1186 / 1478-811X-4-2

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Кармело, В. А. О., Когельман, Л. Дж. А., Мадсен, М. Б., Кадармидин, Х. Н. (2018). WISH-R — быстрый и эффективный инструмент для построения эпистатических сетей для сложных признаков и заболеваний. BMC Bioinf. 19 (277), 1–7. doi: 10.1186 / s12859-018-2291-2

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Корделл, Х. Дж. (2002). Эпистаз: что это означает, что не означает, и статистические методы его обнаружения у людей. Hum. Мол. Genet. 11 (20), 2463–2468. DOI: 10.1093 / hmg / 11.20.2463

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ding, R., Quan, J., Yang, M., Wang, X., Zheng, E., Yang, H., et al. (2017). Полногеномный ассоциативный анализ выявляет генетические локусы и гены-кандидаты для пищевого поведения и эффективности питания у хряков дюрок. PLoS One 12 (8), e0183244. doi: 10.1371 / journal.pone.0183244

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ding, R., Yang, M., Wang, X., Quan, J., Zhuang, Z., Zhou, S., et al. (2018). Генетическая архитектура пищевого поведения и эффективность корма в популяции свиней дюрок. Фронт. Genet. 9, 1–11. doi: 10.3389 / fgene.2018.00220

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

До, Д. Н., Страте, А. Б., Дженсен, Дж., Марк, Т., Кадармидин, Х. Н. (2013). Генетические параметры для различных показателей эффективности корма и связанных признаков у хряков трех пород свиней. J. Anim. Sci. 91, 4069–4079. doi: 10.2527 / jas.2012-6197

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Durinck, S., Moreau, Y., Kasprzyk, A., Davis, S., De Moor, B., Brazma, A., et al. (2005). BioMart и Bioconductor: мощная связь между биологическими базами данных и анализом данных микрочипов. Биоинформатика 21 (16), 3439–3440.doi: 10.1093 / биоинформатика / bti525

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Durinck, S., Spellman, P. T., Birney, E., Huber, W. (2009). Идентификаторы сопоставления для интеграции наборов геномных данных с пакетом R / Bioconductor biomaRt. Нат. Protoc. 4 (8), 1184–1191. doi: 10.1038 / nprot.2009.97

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Duthie, C., Simm, G., Doeschl-Wilson, A., Kalm, E., Knap, P. W., Roehe, R.(2010). Эпистатический анализ характеристик туш свиней выявляет геномные взаимодействия между локусами количественных признаков, относящиеся к аддитивным и доминирующим генетическим эффектам. J. Anim. Sci. 88 (7), 2219–2234. doi: 10.2527 / jas.2009-2266

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Duthie, C. A., Simm, G., Doeschl-Wilson, A., Kalm, E., Knap, P. W., Roehe, R. (2011a). Локусы количественных признаков качества мяса у свиней с учетом импринтинга и эпистатических эффектов. Meat Sci. 87 (4), 394–402. doi: 10.1016 / j.meatsci.2010.11.017

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Duthie, C., Simm, G., Doeschl-Wilson, A., Kalm, E., Knap, P. W., Roehe, R. (2011b). Локусы эпистатических количественных признаков, влияющих на химический состав тела и отложение, а также на потребление корма и эффективность корма на протяжении всего периода роста свиней. Жив. Sci. 138, 34–48. doi: 10.1016 / j.livsci.2010.11.022

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Edea, Z., Ким, К. (2014). Полное геномное сканирование для выявления селекционных сигнатур между породами свиней Беркшира и коренными корейскими породами. J. Anim. Sci. Technol. 56 (23), 1–7. doi: 10.1186 / 2055-0391-56-23

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Eichler, E. E., Flint, J., Gibson, G., Kong, A., Leal, S. M., Moore, J. H., et al. (2010). Отсутствие наследственности и стратегий поиска основных причин сложного заболевания. Нат. Преподобный Жене. 11, 446–450.doi: 10.1038 / nrg2809

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Estellé, J., Gil, F., Vázquez, J.M., Latorre, R., Ramírez, G., Barragán, M.C., et al. (2008). Сканирование количественного признака локуса генома на признаки мышечных волокон свиней выявляет чрезмерное преобладание и эпистаз. J. Anim. Sci. 86 (12), 3290–3299. doi: 10.2527 / jas.2008-1034

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Frazer, K. A., Murray, S. S., Schork, N.Дж., Тополь Э. Дж. (2009). Генетическая изменчивость человека и ее вклад в формирование сложных черт. Нат. Преподобный Жене. 10, 241–251. doi: 10.1038 / nrg2554

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Fu, L., Xu, Y., Hou, Y., Qi, X., Zhou, L., Liu, H., et al. (2017). Протеомный анализ показывает, что митохондриальный энергетический метаболизм в ткани скелетных мышц отрицательно коррелирует с эффективностью корма у свиней. Sci. Реп. 7, 1–8. doi: 10.1038 / srep45291

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Hashidate-Yoshida, T., Хараяма, Т., Хисикава, Д., Моримото, Р., Хамано, Ф., Токуока, С.М. и др. (2015). Ремоделирование жирной ацильной цепи с помощью LPCAT3 обогащает арахидонат фосфолипидными мембранами и регулирует транспорт триглицеридов. Элиф 2015 (4), e06328. doi: 10.7554 / eLife.06328

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Horodyska, J., Hamill, R.M., Reyer, H., Trakooljul, N., Lawlor, P.G., Mccormack, U.M, et al. (2019). РНК-последовательность печени свиней, отличающихся по эффективности корма, подчеркивает изменения в метаболизме макроэлементов, росте печени и иммунном ответе. Фронт. Genet. 10, 117. doi: 10.3389 / fgene.2019.00117

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Дженсен, Т. Б., Баадсгаард, Н. П., Хоу, Х., Тофт, Н., Остергаард, С. (2007). Влияние лечения хромоты и других заболеваний на набор веса и конверсию корма у хряков на датской испытательной станции. Жив. Sci. 112, 34–42. doi: 10.1016 / j.livsci.2007.01.153

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Каспршик, А., Тайра, М., Бабич, М. (2015). Профиль жирных кислот свинины местной и коммерческой породы. Arch. Anim. Порода. 58, 379–385. doi: 10.5194 / aab-58-379-2015

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Когельман, Л. Дж. А., Кадармидин, Х. Н. (2014). Сетевой метод Weighted Interaction SNP Hub (WISH) для построения генетических сетей для сложных заболеваний и признаков с использованием данных полногеномного генотипа. BMC Syst. Биол. 8, S5. doi: 10.1186 / 1752-0509-8-S2-S5

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Langfelder, P., Хорват, С. (2008). WGCNA: пакет R для взвешенного корреляционного сетевого анализа. BMC Bioinf. 9, 559. doi: 10.1186 / 1471-2105-9-559

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лено-Колорадо, Дж., Хадсон, Н. Дж., Ревертер, А., Перес-энцисо, М. (2017). Анализ пути приручения и разведения свиней в Евразии. G3 (Bethesda) 7, 2171–2184. doi: 10.1534 / g3.117.042671

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Li, P., Фан, В., Эвераерт, Н., Лю, Р., Ли, К., Чжэн, М. (2018). Секвенирование информационной РНК и анализ путей позволяют по-новому взглянуть на восприимчивость цыплят к инфекции, вызванной сальмонеллой энтеритидис. Фронт. Genet. 9, 1–10. doi: 10.3389 / fgene.2018.00256

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ляо, С.Ф., Ван, Т., Регми, Н. (2015). Питание лизином у свиней и родственных животных с однокамерным желудком: биосинтез мышечного белка и не только. Springerplus 4, 1–12.doi: 10.1186 / s40064-015-0927-5

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Liu, H., Sang, S., Lu, Y., Wang, Z., Yu, X., Zhong, C. (2017). Метаболизм тиамина имеет решающее значение для регулирования коррелированного роста дендритных ветвей и нейрональных сомов. Sci. Реп. 7, 1–12. doi: 10.1038 / s41598-017-05476-w

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Манолио, Т. А., Коллинз, Ф. С., Кокс, Н. Дж., Гольдштейн, Д. Б., Хиндорф, Л.А., Хантер Д. Дж. И др. (2009). Обнаружение недостающей наследственности сложных заболеваний. Природа 461, 747–753. DOI: 10.1038 / nature08494

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Noguera, J. L., Rodríguez, C., Varona, L., Tomàs, A., Muñoz, G., Ramírez, O., et al. (2009). Двумерное сканирование генома на признаки плодовитости свиней показывает наличие множественных эпистатических QTL. BMC Genomics 10, 636. doi: 10.1186 / 1471-2164-10-636

PubMed Реферат | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Olivieri, B.Ф., Меркаданте, М. Е., Сирилло, Дж. Н., Бранко, Р. Х., Бонилья, С. Ф., де Альбукерке, Л. Г. и др. (2016). Области генома, связанные с индикаторными признаками кормовой эффективности в экспериментальной популяции крупного рогатого скота неллора. PLoS One 11 (10), e0164390. doi: 10.1371 / journal.pone.0164390

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Осаки, Л. Х., Гама, П. (2013). MAPK и сигнальная трансдукция в контроле пролиферации и дифференцировки эпителиальных клеток желудочно-кишечного тракта. Внутр. J. Mol. Sci. 14 (5), 10143–10161. doi: 10.3390 / ijms140510143

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Овило, К., Клоп, А., Ногера, Дж. Л., Оливер, М. А., Барраган, К., Родригез, К. и др. (2002). Количественное картирование локусов признаков качества мяса в популяции иберийских свиней × ландрас F 2. J. Anim. Sci. 80 (11), 2801–2808. doi: 10.2527 / 2002.80112801x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Павлаки, Н., Николаев, В. (2018). Визуализация опосредованного PDE2 и PDE3 перекрестного взаимодействия цГМФ с цАМФ в кардиомиоцитах. J. Cardiovasc. Dev. Дис. 5, 4. doi: 10.3390 / jcdd5010004

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пу, Л., Чжан, Л. К., Чжан, Дж. С., Сун, X., Ван, Л. Г., Лян, Дж. (2016). Анализ MAP3K 5 свиней: молекулярное клонирование, характеристика, паттерн тканевой экспрессии и вариации числа копий, связанные с остаточным потреблением корма. Genet. Мол. Res. 15, 1–13.doi: 10.4238 / gmr.15037998

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Перселл, С., Нил, Б., Тодд-Браун, К., Томас, Л., Феррейра, М. А. Р., Бендер, Д. и др. (2007). PLINK: набор инструментов для анализа ассоциаций всего генома и популяционных связей. Am. J. Hum. Genet. 81, 559–575. doi: 10.1086 / 519795

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Рейманд, Дж., Кулл, М., Петерсон, Х., Хансен, Дж., Вило, Дж. (2007). G: Profiler — веб-набор инструментов для функционального профилирования списков генов из крупномасштабных экспериментов. Nucleic Acids Res. 35, 193–200. DOI: 10.1093 / nar / gkm226

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Реманс, П. Х. Дж., Грингхейс, С. И., ван Лаар, Дж. М., Сандерс, М. Э., Папендрехт-ван дер Воорт, Э. А. М., Цварткруис, Ф. Дж. Т. и др. (2004). Передача сигналов Rap1 необходима для подавления генерируемых ras активных форм кислорода и защиты Т-лимфоцитов от окислительного стресса. J. Immunol. 173, 920–931. DOI: 10.4049 / jimmunol.173.2.920

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Reyer, H., Oster, M., Magowan, E., Dannenberger, D., Ponsuksili, S., Wimmers, K. (2017a). Стратегии повышения эффективности кормления свиней включают молекулярные сдвиги в метаболизме липидов и углеводов в печени. Внутр. J. Mol. Sci. 18 (8), 1674. doi: 10.3390 / ijms18081674

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Рейер, Х., Ширали, М., Понсуксили, С., Мурани, Э., Варлей, П. Ф., Jensen, J., et al. (2017b). Изучение генетики эффективности корма и особенностей кормового поведения в линии свиней, тщательно отобранных по эксплуатационным характеристикам. Мол. Genet. Геномика 292, 1001–1011. doi: 10.1007 / s00438-017-1325-1

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Родригес, К., Томас, А., Алвес, Э., Рамирес, О., Арке, М., Муньос, Г. и др. (2005). Отображение QTL для количества сосков при скрещивании иберийских свиней с мейшанскими свиньями. Anim. Genet. 36, 490–496. doi: 10.1111 / j.1365-2052.2005.01358.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Schumacher, M. A., Hedl, M., Abraham, C., Bernard, J. K., Lozano, P. R., Hsieh, J. J., et al. (2017). Передача сигналов ErbB4 стимулирует провоспалительный апоптоз макрофагов и ограничивает воспаление толстой кишки. Cell Death Dis. 8, e2622. doi: 10.1038 / cddis.2017.42

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Schuurbiers, O.К. Дж., Каандерс, Дж. Х. А. М., Ван Дер Хейден, Х. Ф. М., Дехуйзен, Р. П. Н., Ойен, В. Дж. Г., Буссинк, Дж. (2009). Путь PI3-K / AKT и механизмы радиационной устойчивости при немелкоклеточном раке легкого. J. Thorac. Онкол. 4, 761–767. doi: 10.1097 / JTO.0b013e3181a1084f

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Серао, Н. В., Гонсалес, П. Д., Бивер, Дж. Э., Боллеро, Г. А., Саути, Б. Р., Фолкнер, Д. Б. и др. (2013). Двумерный полногеномный ассоциативный анализ компонентов роста и потребления корма. PLoS One 8 (10), e78530. doi: 10.1371 / journal.pone.0078530

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Shannon, P., Markiel, A., Ozier, O., Baliga, N. S., Wang, J. T., Ramage, D., et al. (2003). Cytoscape: программная среда для интегрированных моделей сетей биомолекулярного взаимодействия. Genome Res. 13, 2498–2504. doi: 10.1101 / gr.1239303

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Стефанон, Б., Флорис, Р., Braglia, S., Davoli, R., Fontanesi, L., Olio, S.D., et al. (2004). Новый подход в ассоциативном исследовании однонуклеотидного полиморфизма генов качественных признаков туши и мяса коммерческих свиней. Ital. J. Anim. Sci. 3, 177–189. doi: 10.4081 / ijas.2004.177

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сураваджхала, П., Когельман, Л. Дж. А., Кадармидин, Х. Н. (2016). Интеграция и анализ многомерных данных с использованием подходов системной геномики: методы и приложения В животноводстве, здоровье и благополучии. Genet. Sel. Evol. 48, 1–14. doi: 10.1186 / s12711-016-0217-x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Tang, H.Y., Lin, H.Y., Zhang, S., Davis, F. B., Davis, P.J. (2004). Гормон щитовидной железы вызывает митоген-активируемое протеинкиназозависимое фосфорилирование ядерного рецептора эстрогена. Эндокринология 145, 3265–3272. DOI: 10.1210 / en.2004-0308

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Tylicki, A., Лотовски, З., Семенюк, М., Раткевич, А. (2018). Тиамин и отдельные антивитамины тиамина — биологическая активность и методы синтеза. Biosci. Реп. 38 (1), 1–23. doi: 10.1042 / BSR20171148

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Wang, H., Pan, X., Wang, C., Wang, M., Yu, L. (2015). Влияние различного соотношения концентратов и кормов и добавок тиамина на ферментацию рубца и бактериальное сообщество рубца у дойных коров. Anim.Prod. Sci. 55 (2), 189–193. doi: 10.1071 / AN14523

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Wang, Y., Ma, C., Sun, Y., Li, Y., Kang, L., Jiang, Y. (2017). Динамический анализ транскриптома и ДНК-метилома на длинной мышце спины для выявления генов, лежащих в основе содержания внутримышечного жира у свиней. BMC Genomics 18, 780. doi: 10.1186 / s12864-017-4201-9

PubMed Реферат | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Wang, Y., Ning, C., Wang, C., Guo, J., Ван Дж., Ву Ю. (2019). Полногеномное ассоциативное исследование содержания внутримышечного жира у черных свиней китайского лулай. Азиатско-Австралийский. J. Anim. Sci. 32, 607–613. doi: 10.5713 / ajas.18.0483

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Wei, H., Zhou, Y., Jiang, S., Huang, F., Peng, J., Jiang, S. (2016). Транскрипционная реакция скелетных мышц свиней на кормление растущими свиньями рационом, обогащенным льняным семенами. J. Anim. Sci. Biotechnol. 7, 6. DOI: 10.1186 / s40104-016-0064-1

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Yin, J., Han, H., Li, Y., Liu, Z., Zhao, Y., Fang, R., et al. (2017). Ограничение лизина влияет на потребление корма и метаболизм аминокислот через микробиом кишечника у поросят. Cell. Physiol. Biochem. 44, 1749–1761. doi: 10.1159 / 000485782

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Yu, J. S. L., Cui, W. (2016). Пролиферация, выживаемость и метаболизм: роль передачи сигналов PI3K / AKT / mTOR в определении плюрипотентности и клеточной судьбы. Разработка 143, 3050–3060. doi: 10.1242 / dev.137075

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Zhang, C., Kemp, R.A., Stothard, P., Wang, Z., Boddicker, N., Krivushin, K., et al. (2018). Геномная оценка характеристик компонентов кормовой эффективности у свиней породы дюрок с использованием последовательностей 80К, 650К и полногеномных вариантов. Genet. Sel. Evol. 50, 1–13. doi: 10.1186 / s12711-018-0387-9

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

MicroRNA в сперме кабанов дюрок, ландрас и йоркшир

Sevignani, C., Калин, Г. А., Сиракуза, Л. Д. и Кроче, С. М. МикроРНК млекопитающих: маленький мир для тонкой настройки экспрессии генов. Mamm Genome 17, 189–202 (2006).

CAS Статья Google ученый

Бартель, Д. П. МикроРНК: геномика, биогенез, механизм и функция. Cell 116, 281–297 (2004).

CAS Статья Google ученый

Krol, J., Loedige, I.& Филипович, В. Широкое распространение регуляции биогенеза, функции и распада микроРНК. Nat Rev Genet 11, 597–610 (2010).

CAS Статья Google ученый

Винтер, Дж., Юнг, С., Келлер, С., Грегори, Р. И., Дидерикс, С. Многие пути к зрелости: пути биогенеза микроРНК и их регуляция. Nat Cell Biol 11, 228–234 (2009).

CAS Статья Google ученый

Амарал, А.J. et al. Общегеномные следы приручения и отбора свиней выявлены путем массивного параллельного секвенирования объединенной ДНК. PloS One 6, e14782 (2011).

CAS ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

Ojeda, A. et al. Эволюционное исследование потенциальной целевой области отбора у свиньи. Наследственность 106, 330–338 (2011).

CAS Статья Google ученый

Гао, Ю.и другие. Обнаружение дифференциально экспрессируемых генов в longissimus dorsi северо-восточных коренных и крупных белых свиней. Генетика и молекулярные исследования: GMR 10, 779–791 (2011).

CAS Статья Google ученый

Портер В. и Теббит Дж. Свиньи. Справочник пород мира. (Маунтфилд: Хелм, Восточный Сассекс, 1993).

Li, H. Y. et al. Идентификация и сравнение микроРНК из скелетных мышц и жировой ткани двух пород свиней.Anim Genet 43, 704–713 (2012).

CAS Статья Google ученый

Timoneda, O. et al. Анализ профиля экспрессии миРНК в почках свиней разных пород. PLoS One 8, e55402 (2013 г.).

CAS ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

Li, J. et al. Различия в экспрессии микроРНК и профиле редактирования легочных тканей разных пород свиней связаны с иммунными ответами на HP-PRRSV.Научный журнал 5, 9549 (2015).

CAS Статья Google ученый

Кнехт, Д., Сродонь, С. и Дузиньски, К. Влияние породы кабана и сезона на параметры спермы. Южноафриканский журнал зоотехники 44, 1–9 (2014).

Артикул Google ученый

Церешко А., Оттобре Дж. С. и Глоговски Дж. Влияние сезона и породы на активность акрозина спермы и качество спермы хряков.Anim Reprod Sci 64, 89–96 (2000).

CAS Статья Google ученый

Смиталь, Дж., Де Соуза, Л. Л. и Мохсен, А. Различия между породами и проявление гетерозиса в выделении спермы свиней для искусственного осеменения. Anim Reprod Sci 80, 121–130 (2004).

CAS Статья Google ученый

Кондрацки, С., Высокиньска, А., Банашевска, Д. и Зайда, Дж. Породные вариации в эякулятах у свиней для искусственного осеменения.Anim Sci Pap Rep 24, 121–129 (2006).

Google ученый

Смитал Дж. Влияние на сперму хряка. Anim Reprod Sci 110, 335–346 (2009).

CAS Статья Google ученый

Stowe, H.M. et al. МикроРНКом спермы быка и влияние токсикоза овсяницы на экспрессию микроРНК сперматозоидов. PLoS One 9, e113163 (2014).

ADS Статья Google ученый

Карри, Э., Сафрански, Т. Дж. И Пратт, С. Л. Дифференциальная экспрессия микроРНК сперматозоидов свиней и их связь с морфологией и подвижностью сперматозоидов. Териогенология 76, 1532–1539 (2011).

CAS Статья Google ученый

Роджерс, А. Б., Морган, С. П., Бронсон, С. Л., Ревелло, С. и Бейл, Т. Л. Отцовское воздействие стресса изменяет содержание микроРНК в сперматозоидах и репрограммирует регуляцию оси стресса HPA потомства. J. Neurosci 33, 9003–9012 (2013).

CAS Статья Google ученый

Kim, H. et al. Изучение генетической характеристики размера тела миниатюрной свиньи Юкатана. PLoS One 10, e0121732 (2015).

Артикул Google ученый

Пэн, Дж., Чжао, Дж. С., Шен, Ю. Ф., Мао, Х. Г. и Сюй, Н. Ю. Профилирование экспрессии микроРНК лактирующей молочной железы у пород свиней с дивергентным фенотипом. Int J Mol Sci 16, 1448–1465 (2015).

CAS Статья Google ученый

Siengdee, P. et al. Профили экспрессии микроРНК в мышцах до и после рождения у двух пород свиней, различающихся по мускулистости. Gene 561, 190–198 (2015).

CAS Статья Google ученый

Ховард, Дж. Т., О’Нан, А. Т., Мальтекка, К., Бейнс, Р. Э. и Эшвелл, М. С. Дифференциальная экспрессия генов в зависимости от породы и пола у коммерческих свиней, которым вводили фенбендазол и флуниксин меглумин.PLoS One 10, e0137830 (2015).

Артикул Google ученый

Li, R., Jia, Y., Zou, H. & Zhao, R. Породоспецифическая экспрессия DROSHA, DICER и AGO2 регулируется глюкокортикоид-опосредованными miRNA в печени новорожденных поросят. Anim Genet 45, 817–826 (2014).

CAS Статья Google ученый

Вольф, Дж. Генетические параметры сперматозоидов у хряков ИО, оцененные на основе данных по отдельным эякулятам.Reprod Domest Anim 44, 338–344 (2009).

CAS Статья Google ученый

Вольф, Дж. Наследственность и генетические корреляции размеров помета и признаков семени чешских крупных белых и ландрасских свиней. J Anim Sci 88, 2893–2903 (2010).

CAS Статья Google ученый

Робинсон Дж. А. и Бур М. М. Влияние генетического отбора на управление заменой хряков.Териогенология 63, 668–678 (2005).

CAS Статья Google ученый

Гонсалес-Пенья, Д., Нокс, Р. В., Макнейл, М. Д. и Родригес-Зас, С. Л. Генетическая выгода и экономическая ценность стратегий отбора, включая признаки семени в трех- и четырехсторонних системах скрещивания для производства свиней. J Anim Sci 93, 879–891 (2015).

Артикул Google ученый

Фустер, Д.Г. и Александр, Р. Т. Традиционные и новые роли обменников Na + / H + SLC9. Pflugers Arch 466, 61–76 (2014).

CAS Статья Google ученый

Чо, Ю. С., Свелто, М. и Каламита, Г. Возможные функциональные последствия водных каналов аквапорина в репродуктивной физиологии и при оплодотворении с медицинской помощью. Cell Mol Biol (Noisy-le-grand) 49, 515–519 (2003).

CAS Google ученый

Михайлов Ю., Ickowicz, D. & Breitbart, H. Zn2 + -стимуляция емкости сперматозоидов и акросомной реакции опосредуется активацией EGFR. Дев Биол, 396, 246–255 (2014).

CAS Статья Google ученый

Thundathil, J., de Lamirande, E. & Gagnon, C. Различные пути передачи сигнала задействованы во время емкости человеческого сперматозоида, вызванной биологическими и фармакологическими агентами. Mol Hum Reprod 8, 811–816 (2002).

CAS Статья Google ученый

Mu, X.и другие. Нацеленная инактивация тестикулярного ядерного орфанного рецептора 4 задерживает и нарушает позднюю профазу мейоза и последующие мейотические деления сперматогенеза. Mol Cell Biol. 24, 5887–5899 (2004).

CAS Статья Google ученый

Гонсалес-Фернандес, Л. и др. Идентификация протеинтирозинфосфатаз и фосфатаз с двойной специфичностью в сперматозоидах млекопитающих и их роль в подвижности сперматозоидов и фосфорилировании протеинтирозина.Биол Репрод 80, 1239–1252 (2009).

Артикул Google ученый

Тяги, Г. и др. Потеря Etv5 снижает пролиферацию и уровни RET в половых клетках семенников новорожденных мышей и вызывает аномальную первую волну сперматогенеза. Биол Репрод 81, 258–266 (2009).

CAS Статья Google ученый

Melaine, N. et al. Молекулярное клонирование нескольких транспортеров ABC крысы, включая новый транспортер ABC, Abcb8, и их экспрессия в семенниках крысы.Int J Androl 29, 392–399 (2006).

CAS Статья Google ученый

Хуанг, Ю., Мао, X., Бойс, Т. и Чжу, Г. З. Незаменимая роль PTEN в сперматогенезе мышей. Cell Biol Int. 35, 905–908 (2011).

CAS Статья Google ученый

Zhang, X. & Lui, W. Y. Трансформирующий фактор роста β3 регулирует реструктуризацию межклеточных соединений посредством MAPK-опосредованной дестабилизации мРНК и Smad-зависимой деградации белка соединительной адгезионной молекулы B (JAM-B).Biochim Biophys Acta 1849, 601–611 (2015).

CAS Статья Google ученый

Upperhand Genetics :: Производители стада

ПРЕВЫШЕНИЕ ЦЕН НА СЕМЕНУ ВО ВРЕМЯ ОСНОВНЫХ СЕЗОНОВ Предлагается начиная с полудня EST в дни сбора и во все дни после дня сбора.
ОФИСНЫЙ ТЕЛЕФОН — 260.224.6464
Беркшир Честерс Дюрок Хэмпшир Херефорд Ландрас Польша Споты Тамворт Йоркшир Кроссбреды Отцы из Зала славы Справочные отцы
БЕРКШЕРЫ
Bueno Jet Black x Berkin ‘Off Новинка Upperhand!	MONSTER Just For Men x Berkin Off	MUCHO Scouts Honor x Injured Reserve Новинка в Upperhand!
ЧЕСТЕРС
POP ROCKS Kid Rock x Ein Новинка в Upperhand!
DUROCS
ALLEY OOP Dunked On x Next Глава Новое в Upperhand!	COMMENCE Hibachi x So Cold Новинка Upperhand!	CREATION Hibachi x So Cold Новинка Upperhand!
HIBACHI Maximus x Next Chapter	ОТВЕРСТИЕ В ОДНОМ Выбирка x Необходимая шероховатость Новинка Upperhand!	Красные глаза LD x Block Caller
Саботаж Maximus x Lesson Learned	В ПЕРЕМЕШИВАНИИ Deal With It x Maximus Новое в Upperhand!	UNBROKEN Unforgettable x Следующая глава New at Upperhand!
HAMPSHIRES
EDUARDO Diablo x Solution Новое в Upperhand!	Все знают One Bite x Click 285	NETFLIX Top Gun Dam x Grand Entrance Новинка в Upperhand!
OWN IT Own The World x Click 285 Новинка в Upperhand!	QB SUITE Marvel x Get It Right Новинка Upperhand!
HEREFORD
Deep END Анкер x Crooked Karma
LANDRACE
LOMBARDI Время вправо x изменение темпа Новинка Upperhand!
ПОЛЬША
Mamba Out Black Mamba x Purple Rain	SNAKE FARM Mamba Out x Rain Dance Новинка Upperhand!
ТОЧКИ
LED Lights Off x Loud Mouth Новинка в Upperhand!	завязанный язык громкий рот x громкий рот	RIOT Bail Out x Free N ‘Clear
VAN WILDER Lampoon x Downtown Новинка в Upperhand!
ТАМВОРТ
РОГАТКА Big Shot x Guess What	STONE COLD Back2Future x Zippo Новинка в Upperhand!
Йоркшир
ASTRONAUT Emotion x Times Up Новинка Upperhand!	BABY SHARK Baby Step x 6 Speed ​​ Новинка Upperhand!	BABY STEP Большой шаг x прирост капитала
BIG STEP Big Stick x Gain Control	FIGHT CLUB Times Up x Leaps And Bounds Новинка в Upperhand!	НОКАУТ раз вверх x прыжки и границы
ПЕРЕДАЧИ И ОГРАНИЧЕНИЯ Усилено x В контроле	PILOT Emotion x Times Up Новинка Upperhand!	RIGHT STEP Big Step x Prime Новинка Upperhand!
ROOTS Next Level x Savior Новое в Upperhand!	STEP ONE Big Step x Light This Новинка Upperhand!	UFC Knockout x Big Step Новинка Upperhand!
ПЕРЕКРЕСТОК
.96 Отменено x Teen Spirit Новинка Upperhand!	BLUE BIRD Blue Moon x Брачная ночь Новинка Upperhand!	CRUEL 95 Cruel Intentions x ReRoute Новинка Upperhand!
DIRECTORS CUT Правило 21 x Грязные слова Новинка!	Hidden Gem Ничего не скрывать x Никогда раньше Новинка Upperhand!	HIGH HORSE Пони Ап x Dirty Secret x Distinct
Holy Smokes Семейные узы x Curtain Call	I’M ON IT One Man Band x Kiss My Socks	ДЕРЖАТЬ РЕАЛЬНО Provoked x Dirty Secret
МОИ ПРАВИЛА Нарушение правил x Король Джеймс	ONE MAN BAND Dirty Secret x Lesson Learned	ПРЕВЫШАЕТ Правило 21 x Visionary
Quittin Time Следующее намерение x Dirty Secret x Distinct	АРЕНДА ДЕНЬГИ King Pin x Bad To The Bone Новинка в Upperhand!	SKULL & BoNES Secret Society x Lesson Learned Новое в Upperhand!
TEEN SPIRIT Lock It Up x Kissing Cousins ​​	МОЛОДАЯ ЛЮБОВЬ Грязная любовь x Проверить цену
ЗАЛ СЛАДА БОЕЦ КАБАНОВ БОЛЬШЕ С НАМИ….. НО СЛЕВА ОТМЕТКА
ВСЕ ГЛАЗА Outlaw x Homemade 45-1	DADDY MACK Mack Attack x NBS	I DO Ружье Wedding x Gary Coleman
GOT EM Замена WTX x Triple Threat	LOUD MOUTH Get Loud x Big Foot	РЕШЕНИЕ ПРОБЛЕМ Power Wagon x Pi R Squared
ПЕРЕИМЕНОВАТЬ Recovery x Swamp Monkey	НЕБО — ПРЕДЕЛ Big Affair x Big Sky	SKY WIRE Sky’s The Limit x Drop Shot
ЗАДНЯЯ ПОДСТАВКА Free-N-Easy x Home Brew	ТРАНСФОРМАТОР Special Reserve x Maximus
ССЫЛКИ
Справочные производители Berkshire	Chester Reference Sires	Справочные производители Duroc
Хэмпшир Справочные производители	Херефордские справочные производители	Ландрас Референсные производители
Польша Справочные производители	Точечные справочные производители	Йоркширские справочные производители
Кроссбредные справочные производители

.