Козоводы объединяйтесь: Козоводы, объединяйтесь! (Объявления о продаже)

Содержание

Козоводы, объединяйтесь!

Поиск на Upakovano.ru

Поиск на сайте upakovano.ru является универсальным и осуществляется по всем разделам сайта, качество выдачи результатов поиска прямо зависит от введенных ключевых слов.

Использование только одного слова или общих слов может привести к излишнему количеству документов, в таких случаях нужно использовать уточняющие ключевые слова.

Для повышения релевантности результатов поиска можно также использовать исключающие слова.

При формировании поискового запроса возможно использование языка запросов.

Обычно запрос представляет из себя просто одно или несколько слов, например: “свежая рыба треска” — по такому запросу находится информация, в которой встречаются все слова запроса.

Логические операторы позволяют строить более сложные запросы, например: “свежая рыба или пылесос” — по такому запросу находится информация, в которой встречаются либо слова “свежая” и “рыба”, либо слово “пылесос”.

“Свежая рыба не скумбрия” — по такому запросу находится информация, в которой встречаются слова “свежая” и “рыба” и не встречается слово “скумбрия”.

Вы можете использовать скобки для построения более сложных запросов.

Логические операторы.

Оператор “и”

Синонимы оператора “и”:

And
&
+

Подразумевается, что оператор “и” можно опускать: например, запрос “свежая рыба” полностью эквивалентен запросу “свежая” и “рыба”.

Оператор “или”

Синонимы оператора “или”:

Or
|

Оператор логическое «или» позволяет искать элементы, содержащие хотя бы один из операндов.

Оператор “Не”

Синонимы оператора “Не”:

Not
~

Оператор логическое «не» ограничивает поиск товарами, не содержащими слово, указанное после оператора.

Оператор ( )

Круглые скобки задают порядок действия логических операторов. При формировании строки запроса убедитесь, что для каждой открывающейся скобки есть парная скобка закрывающаяся.

Оператор » »

Поиск точной фразы. Обычно используется для поиска цитат.

Татьяна Полозова, Пермь, Россия, ВКонтакте, id41157959

Простые рецепты
Рецепты, собранные со всех уголков планеты, чтобы превратиться в блюдо на вашем столе. Знаете, что их объединяет? Вы сможете сами это приготовить!

Козоводы, объединяйтесь! (Объявления о продаже)
Данное сообщество предназначено только для добросовестных, здравомыслящих, как опытных, так и начинающих козоводов с целью обмена актуальной и ценной информацией по интересам! Перед размещением поста или объявления обязательно читайте «[vk.com/@kupikozy-pravila|ПРАВИЛА]», для исключения непонимания! Участникам сообщества можно: задать вопрос, поделиться опытом, разместить объявление в рамках тематики группы. Обязательные сведения в объявлениях: фотографии продаваемого животного, местоположение, краткое описание. Для размещения поста воспользуйтесь «[https://vk.com/kupikozy?w=app7297645_-94093160|ФОРМОЙ]». По поводу рекламы и объявлений вне очереди пишите в сообщения сообщества! При высказывании своего мнения быть МАКСИМАЛЬНО ДЕЛИКАТНЫМИ и СДЕРЖАННЫМИ, а также ПРОЯВЛЯТЬ УВАЖЕНИЕ к МНЕНИЮ собеседника. За оскорбления участников, хамство, сообщения не по теме и неконструктивную критику — бан!!!

Красиво сказано . . .

Типичный Краснодар
Наши правила: vk.com/topic-33025155_28739563

Шальная
Всё, что хоть как-то связано с девушками.

Храм Дорам ТВ
Все каждый день проводят в Храме — Учитель, друг и даже мама. Нет, мы не секта, как ни странно, У нас тут целый мир дорамный! Смотри новинки вечерами — Онгоинги всегда есть в Храме! Следи у нас за новостями, Ставь лайки и делись постами! Делись эмоциями с нами И будем мы с тобой друзьями! Все храмовята знают сами — Дорамщикам уютно в Храме😉

Моя дача
Здравствуйте, дорогие друзья! В нашей группе Вы найдёте полезную информацию для строительства и отделки ваших дачных помещений, интерьер и дизайн вашей дачи, много полезной информации о растениях, овощах и фруктах. Так же вы можете делиться фотографиями своего загородного домика, рассказать о своих секретах хорошего урожая или просто похвастаться как позитивно вы отдыхаете.

Безумные приколы

Наш Краснодар
ТОП-1 региональное СМИ! По результатам голосования. Вся жизнь края! Краснодар, как он есть. [https://vk.com/ourkrd?w=page-124428724_54748356|👉🏻 Наши площадки] [https://vk.com/ourkrd?w=page-124428724_53233930|👉🏻 Обсуждения] [https://vk.com/ourkrd?w=page-124428724_53233989|👉🏻 Полезные ссылки] [https://vk.com/ourkrd?w=page-124428724_53233689|👉🏻 Наши правила]

ПОДСЛУШАНО ЛЁВШИНО — ЭТО НАШ РАЙОН!
Правила пользования сообществом. СОХРАНЯЙТЕ ДРУЖЕСТВЕННУЮ АТМОСФЕРУ! Эта страница в первую очередь для обычных людей, для удобства жителей нашего района и только потом бизнес-площадка для желающих заработать. 1. Администрация всегда права. 2. Ссылки на другие группы и коммерческие сайты в комментах и темах обсуждений ЗАПРЕЩЕНЫ. Бан подписчика на месяц, неподписчика -пожизненно. 3. Мат и оскорбления личности ЗАПРЕЩЕНЫ. Если случай единичный -комментарий просто удаляется. Если нарушение повторяется : Бан автора-подписчика на неделю, неподписчика -зависит от степени тяжести: призывы к насилию, поголовный троллинг-бан навсегда. В других случаях на месяц. 4 .Поиск маникюрщиц , ресничниц , ремонтников и других специальностей публикуется с отключенными комментариями. Не забывайте открывать лички. 5.Прежде, чем предлагать вопрос, уточните ,возможно, в ленте уже есть ответ на ваш поиск. Достаточно ввести в строку «Поиск новостей » вверху новостной ленты ключевые слова, например «Ремонт холодильников» . 6.Продажи публикуем в фотоальбомы ( при соблюдении правил публикации). Время жизни объявлений в фотоальбомах и темах обсуждений 3 месяца. Площадкой могут пользоваться только подписчики. За публикацию неподписчками — пожизненный бан. 7. «Сдам в аренду» относится к разряду платных объявлений. 8. Вопросы ,на которые вы сами можете найти ответы в инете(расписание работы,номера телефонов и другие очевидные вещи)публиковаться НЕ будут,т.к. у площадки есть лимит-50 постов в сутки. 9.Постройка сетевых структур с помощью подписчиков без предварительных обсуждений с админами -бан сразу и навсегда. 10. Всем риэлторам, менеджерам и другим бизнесменам участие в комментариях запрещено. Комментирование допускается только с личных страниц . За неоплаченный бизнес в ленте — бан. 11. Торговля лекарствами (даже в остатках), сигаретами (комплектующими), алкоголем,наркотиками — запрещена. Бан. 12 .За хамство и оскорбление админов-бан навсегда. 13. Безвозмездными услугами сообщества могут пользоваться только подписчики. За спам в темах обсуждений неподписчиками — бан . 14. Посты после публикации не удаляем . Даже если они для вас больше не актуальны. Если планируете дальнейшее удаление-публикуйтесь в темах обсуждений (согласно правилам пользования сообществом).

W³: voices | перевод и озвучка

ГРАФИКОВ НЕТ! ЗА «КОГДА» БАН! По вопросам рекламы и сотрудничества w3studio@mail.ru

Идеи для дома — Дизайн интерьера
Идеи для вашего дома, квартиры и… даже комнаты! У нас уже более 1.500.000 читаталей. Станьте одним из них и вдохновляйтесь вместе с нами!

Госуслуги
Официальный канал портала государственных услуг Российской Федерации. Twitter: twitter.com/EPGU Одноклассники: ok.ru/gosuslugi Facebook: facebook.com/new.gosuslugi Telegram: t.me/gosuslugi YouTube: youtube.com/channel/UCSfb7em0J1GYXix2WjlFtkw Правила общения в сообществе: https://vk.com/topic-73442711_39498427 Следите за новостями!

«СУНДУЧОК» для воспитателей и педагогов
В группе «СУНДУЧОК» вы найдете много интересного и нужного материала для воспитания и обучения детей дошкольного и младшего школьного возраста. Хотите задать вопрос участникам группы или поделиться опытом, напишите в строчку группы «Предложить новость»

Проект « Дача » | ландшафт| огород

Мама, купи мне вон ту куклу!
Приветствую всех любителей кукол! Мы не продаем кукол. Здесь вы можете поделиться своими фотографиями BJD и полюбоваться другими куклами.

Старокорсунская
Предлагайте события, новости, происшествия, мероприятия и фотографии. ПО ВОПРОСАМ РЕКЛАМЫ ОБРАЩАТЬСЯ https://vk.com/lobashov91

Иван Неклютин ВКонтакте, Москва, Россия, id334221762

Сообщество игры Magnum Quest
Наше почтение, всем искателям приключений! Вместе мы спасем Армуду от БОССОВ и других врагов! В нашей группе ты можешь: *Узнать о последних обновлениях и новостях игры ‘Magnum Quest’! *Задавать вопросы по игре! *Найти полезную информацию и гиды по игре! *Поделиться своими достижениями и отзывами! В нашем сообществе не допускается : — грубость по отношению к участникам — разжигание религиозной и межнациональной розни — публикация материалов 18+ — обсуждение конкурентных проектов — не аргументированная критика администрации ресурса — продавать или передавать аккаунты — торговать игровым имуществом за реальные деньги — рассылать спам, включая ссылки на сторонние сайты — ругаться матом — реклама каких либо услуг, ОСОБЕННО по прокачке рефералок — перепродажа аккаунтов Команда Magnum Quest

VARVAR
Мы рады представить Вам работы компании VARVAR! VARVAR — это мужская работа, направленная на создание индивидуального стиля, которая придется по вкусу каждому. Ведь в каждом из нас живет VARVAR!

Продажа с/х животных и птицы в Тульской области
В объявлении обязательно указывайте город (населенный пункт) и цену!

СЛАВЯНСКИЙ КРЕМЛЬ Виталия Сундакова
Возрождение культурного наследия России, этнографические фестивали различных мировых культур — такие непростые задачи ставят для себя обитатели Славянского Кремля и, в частности, хозяин этого исторического чуда — профессиональный путешественник-исследователь Виталий Сундаков. ВИДЕО О СЛАВЯНСКОМ КРЕМЛЕ—> http://vkontakte.ru/video-10860173_117978700 На территории возведены и воссозданы: Княжий Терем, Славянский Храм, Русская изба, шатровая мельница, привезенная с Севера России и реконструированная на территории Славянского Кремля… Здесь ежегодно проводятся этнографические, исторические, культурологические и музыкальные фестивали, кологодные праздники, творческие встречи, мастер-классы и инициативные мероприятия различных интересных клубов. ОРГАНИЗАЦИЯ ВСТРЕЧ И ТРЕНИНГОВ «Как заполучить Сундакова на пару-тройку дней?» — спрашиваете вы нас. Являясь личным организатором событийных, частных и деловых визитов и тренингов Виталия Владимировича Сундакова, я и лично В.В.Сундаков, получаем обширную почту с вопросами: Когда же (по любому поводу) состоится его визит в тот или иной город, край, страну? Возможно ли частное приглашение? Ограничен ли перечень тем общения или сотрудничества?… Дело обстоит так: Вы связываетесь со мной (контакты есть на сайте sundakov.ru) и мы индивидуально, в зависимости от ваших интересов и возможностей согласовываем приемлемые даты и продолжительность его визита к вам. Ну и конечно же иные условия, которые зависят от цели поездки: тренинг, творческая встреча, участие в том или ином мероприятии, деловые переговоры о сотрудничестве, консультации, его участие в зарубежной поездке или путешествии с вами, его выступления в СМИ или роскошь частного общения. Поскольку Виталий Владимирович реализует ряд общественнозначимых проектов требующих финансовой поддержки (строительство Русской Школы русского языка, возведение музея, создание документальных фильмов и т.д.) существует райдер его визитов, который не зависит лишь от количественного показателя приглашаемых (лично это Вы, группа приятелей или очень большая аудитория). Пишите, звоните, спрашивайте, приглашайте. С уважением, ваш помощник Виктория =) info@slavkreml.ru info@sundakov.ru

Иванова фазенда

Группа «Полынья»
Фолк и латина, стихи и апельсины, любовь и странствия! Мы любим жизнь! Ту, которая происходит прямо в этот миг! Мы любим петь! Те песни которые рождаются внутри! Мы до краев наполнили их нашими эмоциями и светом. Нам важно делиться этим! Группа существует с 2004 года, за это время она успела записать 2 альбома, выступить на фестивалях «Нашествие», «Пустые холмы», «Дикая мята», «Фолк-рок-форум», «Усадьба Джаз», «Урожай», «Космофест», «Быть Добру», «Пущинский фестиваль ансамблей авторской песни», «Этнолайф», «Длина волны», «Международный фестиваль Иван Купала», «Чаща всего», «Купала на Рожайке» и некоторых других.

Экоцентр «Царская пасека» ГПБУ «Мосприрода»
Добро пожаловать на страницу экоцентра «Царская Пасека». Здесь вы найдете актуальную информацию о нашей эколого-просветительской деятельности. ______________________________________________________________________________ В экоцентре «Царская пасека» регулярно проходят экскурсионные программы, тематические занятия, творческие мастер-классы, традиционные праздники и эколого-просветительские акции, выставки рисунков, фотографий и поделок из природных материалов. В будние дни проводятся экскурсионные программы для организованных групп от 5 человек по предварительной записи. Каждую среду, в 14.00 все желающие приглашаются на открытый лекторий «Пчелиная среда». На наших занятиях вы можете познакомиться с основами ботаники, орнитологии, пчеловодства, энтомологии, ресурсосбережения и др. По субботам с сентября по апрель в 10.00 проходят занятия орнитологического кружка для детей 8-12 лет «Пернатые +». На занятия обязательна предварительная запись по телефону: 8-499-166-36-87! Каждое воскресенье в 12.00 ребята 3-6 лет могут посещать интерактивную программу «Я открываю мир» и узнавать о зверях, птицах, насекомых, деревьях и цветах, грибах и ягодах. Учиться отличать природные явления и беречь окружающую среду. На занятия обязательна предварительная запись по телефону: 8-499-166-36-87! По воскресеньям с 13.00 для детей 6-10 лет работает арт-студия «Цветная ящерица», где ребята учатся рисовать акварелью, гуашью и делать наброски. На занятия обязательна предварительная запись по телефону: 8-499-166-36-87! Каждое третье воскресенье месяца, в 12:00, 13.00 и 14.00, в экоцентре ждут всех желающих на бесплатные экскурсии по территории. ______________________________________________________________________________ КАК К НАМ ДОБРАТЬСЯ: От метро «Измайловская», выходите в первый вагон из центра, идете по аллее (крайняя левая), далее пешком по парку к Просянской плотине, проходите по плотине, переходите речку по мостику и выходите на аллею, вам надо повернуть налево и подниматься в горку, пред детской площадкой повернуть налево к деревянным воротам — Вы пришли! От метро «Шоссе Энтузиастов», далее на троллейбусе (№30) или трамвае (№38, №36, №37 и №43) до ост. «3-я Владимирская улица», затем прямо по аллее, увидите деревянный забор справа — это мы. ______________________________________________________________________________ Режим работы: Понедельник – четверг – 8.00 – 17.00 (понедельник методический день – экскурсии не проводятся) Пятница – 8.00 – 15.45 Суббота, воскресенье – 8.00 – 17.00 Перерыв — 12.00 — 12.45 КОНТАКТЫ: Телефон +7-499-166-36-87 е-mail: pasekaizm@gmail.com

Клуб практиков «Жизнь на Земле»
Миссия клуба: На основе успешного опыта практиков — к жизни в сотрудничестве с природой и людьми.

Loko Today | Локомотив Сегодня
LOKO TODAY — это новый проект от старых знакомых. Мы — это те самые люди, которые занимались Локомотив.инфо последние годы. Увы, наши пути с .инфо разошлись, но все наши идеи и желание создавать для вас интересный контент теперь смогут воплотиться в жизнь на новой площадке. Оставайтесь с нами и с «Локомотивом» — сегодня и всегда!

Игорь Гавриков ВКонтакте, Санкт-Петербург, Россия, id13358833

Открытки Поздравления Пожелания С Днем Рождения
Наше сообщество посвящено поздравительным открыткам на все случаи жизни! Ежедневно мы готовым открытки на темы: «Доброе утро», «Хорошего дня», «Прекрасного настроения», «С Днем рождения», «Спокойной ночи» и на все основные значимые праздники в году. Выбирайте понравившиеся открытки и поздравляйте своих друзей, дарите радость и счастье! А мы будем радовать вас новым и качественным контентом.

Идеи для дачи
Окунитесь в мир приусадебного хозяйства. Наше сообщество посвящено даче, ландшафтному дизайну приусадебного хозяйства, лайфхакам для дач. Присылайте свои работы в предложенные новости группы — мы их опубликуем и оценим по достоинству! А также не забывайте делиться нашими записями с друзьями 😉

Сделал сам | Строим вместе
Строим вместе | Сделал сам — это сообщество: 🏠Кому интересна стройка. 🏠Где можно взять новые идеи для дома! 🏠Как улучшить пространство для жизни! 🏠Новинки дизайна

Стивен Кинг и книги

Умный Строитель

Проекты домов
Наш интернет-магазин готовых проектов домов и проектов коттеджей обрадует Вас многообразием выбора и качеством работ. Кроме того Вы сможете купить проект дома по чрезвычайно низким ценам. Следите за нашими ежемесячными и пред праздничными акциями. База проектов домов насчитывает более 1000 шт, когда-либо воплощенных в жизнь из различных строительных материалов по всей нашей необъятной Родине. Проекты деревянных домов и проекты каменных домов занимают лидирующие позиции в нашей стране и соответственно в нашей фирме. Заказать проект дома Вы сможете не выходя из дома, заполнив простые формы на нашем сайте arplans.ru. Цены на типовые проекты гораздо ниже индивидуальных проектов. Но если все таки Вы хотите, что-нибудь этакое, то мы с удовольствием воплотим Вашу мечту в жизнь! Просто позвоните нам и закажите проект дома Вашей мечты.

КУЛИБИНО |Стройка, ремонт своими руками, проекты
Группа где подписчики делятся своим достижениями, поделками по теме строительства

Наследие древних цивилизаций. Наука, артефакты

METAL
● Сообщество, посвящённое тяжёлой музыке в целом ● Наш магазин (футболки, толстовки) — vk.cc/733NtY Удобный каталог одежды по исполнителям — vk.cc/6ClJNZ

Подслушано Грайворон
Жители Грайворонского района — объединяйтесь! Пишите свои пожелания и интересные истории, задавайте вопросы.

Санкт-Петербург | История Питера

MEAT l Мужская кухня
Вкуснейшие рецепты на каждый день! Свои рецепты или фото можно присылать в раздел «Предложить новость»

=|ROCKALTERNATIVE|=
Для фанов безбашеной и не очень альтернативы! Правила в группе очень просты: ВСТУПИЛ САМ, ПРИГЛАСИ ДРУЗЕЙ!!! Запомни: Музыка — это Жизнь Альтернатива — это Настоящая Музыка Альтернативная Музыка — единственное, что помогает Выжить в тяжелые моменты обострения морально-депрессивного психоза, который подстерегает нас за каждым углом… Альтернати́вный рок (англ. Alternative rock) — термин в современной музыке, под которым понимают различные жанры рок-музыки, противопоставляющие себя традиционным. Термин появился в 1980-е гг. и охватывал множество жанров, берущих своё начало в панк-роке, постпанке и др. В настоящее время альтернативный рок разделяют на две стадии: первая — это группы 1980-х гг. с широким диапазоном музыкальной самоидентификации; вторая — группы 1990-х гг., получившие после коммерческого успеха американского гранжа в 1991–1993 гг. такую же поддержку крупных лейблов и раскрутку, как и традиционные эстрадные и рок-коллективы (сам альтернативный рок в те годы стал ассоциироваться в основном с гранжем и постгранжевыми группами, сам, таким образом, став жанром), при этом более бескомпромиссные ансамбли ушли в андерграунд. Термин «альтернативный рок» наиболее употребителен в США. В России и Великобритании чаще используют названия «альтернативная музыка» и «альтернатива». Также в Великобритании эту музыку называют словом «инди». ——————————————————————- Гранж (англ. Grunge) — стилистическое направление в рок-музыке, ставшее одним из наиболее заметных явлений альтернативного рока конца 1980-х — середины 1990-х гг. Родиной гранжа стал город Сиэтл (США, штат Вашингтон), наиболее яркими представителями — четыре сиэтлских коллектива: Alice in Chains, Nirvana, Pearl Jam и Soundgarden и группа из Лос-Анжелеса Stone Temple Pilots.

Путевка! Распродажа туров
🔥 Путевка! — крутое онлайн-турагентство с историей by [id20299180|Юлия Кольчатова]

Необычный Гороскоп
Необычный гороскоп для каждого знака зодиака.

Строительство Коттеджей, ремонт квартир
Строительство коттеджей, комплексный ремонт квартир 401-66-66

Невероятная история | Исторический журнал

Гамаюн. Сервис рассылок сообщений | SMM

развитие в РФ, районы козоводства

Если рассматривать российское козоводство в историческом контексте, стоит отметить, что во времена Советского Союза эта животноводческая отрасль слабо поддерживалась государством, которая была представлена шерстным и пуховым направлениями.

Однако общее козье поголовье было малочисленным. Молочное и пуховое направления развивались только за счет личных домашних подворий. Это и предопределило высокую устойчивость отрасли, которая практически все время работала практически в рыночных условиях.
Загрузка …

Козоводство России. История

История этой отрасли животноводства в нашей стране насчитывает более 100 лет. В её развитии на территории России условно можно выделить три основных этапа:

первым этапом связан с трудами князя Урусова и других представителей российской знати, которые боролись за здоровье русской нации. В период с 1906-го по 1913-ый годы эти энтузиасты проделали большую работу. Из Европы (в основном из Германии и Швейцарии) было завезено несколько тысяч коз чистых пород (большая часть – зааненские), была заведена породная книга (которой в настоящее время не существует), был организован Союз козоводов России, в котором с течением времени объединились козоводы 42-х российских губерний, а также раз в месяц начал выходить тематический журнал под названием «Российское козоводство»;
второй этап начался в октябре 1917 года. Господдержка козоводства сошла на нет, и отрасль, несмотря на все усилия энтузиастов, попросту угасла. И все же, благодаря уникальным генетическим качествам ранее завезенных зааненских животных, даже в это трудное для козоводов время удалось улучшить русских беспородных малоудойных коз. Появились такие отечественные породы, как горьковская и советская зааненская, увы, не сохранившиеся до наших дней. Более того, козоводство в СССР мешало планам развития колхозов и совхозов, поскольку селяне, у которых было хотя бы пять коз, отказывались идти работать на молочно-товарные фермы, поскольку выгоднее было начесать пух и, сидя дома, вязать шерстяные изделия и жить с их продажи. Руководство страны приняло «мудрое» решение и ограничило разрешенное на одну семью количество голов этого мелкого рогатого скота до трех. Если человек работал в колхозе и был передовиком – так уж и быть, мог держать пять коз. А если человек был коммунистом или занимал руководящую должность (главный агроном или председатель), то он был вынужден в добровольном порядке отказаться от содержания на своем подворье этих животных;
третий этап – современное состояние этой отрасли. Несмотря на труднейшие девяностые годы прошлого столетия, отечественное козоводство выжило и начинает развиваться. Современное состояние этого животноводческого направления в России сильно отстает от тех же Соединенных Штатов Америки, в которых оно начало развиваться одновременно с российским, но в настоящее время значительно его опережает (поголовье чистопородных коз в США насчитывает более миллиона особей).

Перспективы развития козоводства РФ

Несмотря на появление в нашей стране первых крупных козоводческих предприятий, эта отрасль все-таки пока развивается в основном за счет личных подсобных и мелких крестьянско-фермерских хозяйств. В настоящее время (согласно информации Росстата), именно в них находится больше 91-го процента всего козьего стада страны.

Ни в одной больше животноводческой отрасли нет такой концентрации поголовья у населения. К примеру, в овцеводстве этот показатель составляет 80 процентов.

Следует сказать, что разведение мелкого рогатого скота (коз и овец) включено отдельным разделом в госпрограмму по развитию отечественного сельского хозяйства. Это позволяет надеяться на то, что козоводство начнет постепенно развиваться и в нашей стране, в особенности молочное его направление.

Для успешного развития пухового козоводства (включая грубошерстное направление), нужно организовать развитую сеть сбытовой кооперации. Это позволить создать производственные предприятия по типу народных промыслов, организовать грамотную маркетинговую и рекламную компанию как в нутрии страны, так и за её пределами. Можно организовать переработку козьего пуха в пряжу прямо на местах его производства, там же создать небольшие цеха для пошива изделий из него, привлекая для этого школьников и молодежь. Это значительно повысит занятость населения и повысит уровень его доходов.

Шерстное козоводство, скорее всего. будет ограничено сравнительно небольшой численностью поголовья. Его основной продукт – шерсть, будет применяться в целях удовлетворения потребностей некоторой части российского населения, у которой использование козьих шерстяных изделий связано с местными традициями.

Самым перспективным выглядит молочное козоводство в России, поскольку козье молоко представляет собой ценный диетический продукт, который хорошо подходит для детского питания и полезен для людей пожилого возраста. К слову, спрос на такое молоко постепенно и стабильно увеличивается.

Уже сейчас отечественные предприниматели начали инвестировать в эту отрасль значительные средства. Первые молочные козьи фермы промышленного типа созданы в Ленинградской области (ЗАО «Приневское»), в районе Подмосковья (СПК «Красная Нива»), планируется создание подобных предприятий в Сибири и в Татарстане («ЛукозСаба»). Крупные племенные хозяйства уже работают в республике Мари-ЭЛ («Лукоз»), в Ставрополье (СНИИЖК и КХ «Русь-1») и другие. Такие племхозяйства, кроме непосредственного производства молока, также выращивают племенных животных, спрос на которых сейчас значительно превалирует над предложением.

Однако, поскольку завезенное сто лет назад чистопородное стадо практически перестало существовать, импорт племенных молочных коз все же необходим. Пока что он ограничен из-за высокой цены на таких животных, обусловленной дефицитом предложений. Однако выход из такой ситуации, несомненно, есть. Это – широкое селекционное скрещивание местных пород с высокопродуктивными производителями либо зааненской, либо родственной ей породной группы. Руководство ООО «Лукоз», пойдя по этому пути, за довольно короткое время смогли получить племенное поголовье, средний удой в котором за одну лактацию превышает 800 килограмм.

Несмотря на то, что есть примеры успешного перевода козоводства на промышленную основу, в ближайшем будущем все-таки его развитие будет происходить за счет личных подворий и мелких КФХ. Это связано с тем, что молочное козоводство как бизнес прекрасно подходит под многие действующие программы по социальному развитию российского села (например, программа переселения с Крайнего Севера, программа «Семейная молочная ферма», проект повышения занятости населения села и так далее).Основными преимуществами, которое позволяет использовать молочное козоводство под эти программы, являются небольшой размер необходимого стартового капитала и довольно быстрая окупаемость предприятия.

Проблем в отечественном козоводстве молочного направления еще много. Это и отсутствие инфраструктуры, которая могла бы обеспечить качественную переработку и последующую реализацию продукции, и отсутствие сбытовой и снабженческой кооперации, и, наконец, неспособность отечественной промышленности выпускать маломощное доильное и перерабатывающее оборудование. Однако, все эти проблемы вполне решаемы.

Резюмируя вышесказанное, можно сказать, что российское козоводство живо и постепенно развивается, однако каких-то глобальных перемен пока не наблюдается. Самым динамично развивающимся на данный момент является молочное направление.

Продолжается и научная работа в этой отрасли. Она посвящена совершенствованию технологий кормления и содержания этих домашних животных, проблемам выращивания молодняка, вопросам воспроизводства и улучшения существующего стада, а также разработке новых и улучшению существующих методик искусственного оплодотворения. Не забыта и селекционная работа по созданию новых отечественных козьих пород. Помимо этого, разработан комплекс необходимых нормативных документов (которые еще требуют утверждения на государственном уровне). К ним относятся нормы оценки, система племенного и зоотехнического учета животных и так далее. Существует вероятность появления в нашей стране такого направления, как мясное козоводство.

Козоводы России

В 2015 году была в нашей стране была создана «Ассоциация промышленного козоводства».

Её учредили известные отечественные козоводы, братья Кожановы. Возглавляемые ими козоводческие предприятия «Лукоз» (Марийская республика) и «ЛукозСаба» (Татарстан) стали её первыми членами, а затем к ним присоединилась чувашская агрофирма «Путиловка». В настоящий момент в её составе более 10-ти членов из Подмосковья, Ленинградской и Калужской областей и других регионов России.

Цель создания этой ассоциации её учредители видят в консолидации усилий ведущих отечественных козоводов для популяризации этого животноводческого направления и дальнейшего его развития (в том числе – с помощью государственной поддержки). Кроме того, эта организация призвана защитить интересы отечественных заводчиков коз, а также помочь в решении многочисленных проблем, возникающих в этой отрасли российского животноводства.

Несомненным плюсом вступления в ряды АПК видится возможность обмена опытом и приобретенными знаниями, а также возможность получить доступ к племенным животным членов ассоциации на взаимовыгодной основе. Как и любое объединение отраслевиков, АПК позволит вывести работу по развитию козоводства на новый, государственный уровень, ведь там, где не слышен голос одного – услышат хор единомышленников. Все это вселяет оптимизм и позволяет российским козоводам с оптимизмом смотреть в будущее.

YouTube responded with an error: API key expired. Please renew the API key.

Список используемой литературы:

https://ru.wikipedia.org/wiki/Животноводство
Животноводство // Энциклопедический словарь Брокгауза и Ефрона : в 86 т. (82 т. и 4 доп.). — СПб., 1890—1907.
А.П. Солдатов. Основы животноводства. — 3-е изд. — М.: Агропромиздат, 1988.

местных рынков — United Producers

Альбион, Иллинойс

775 Иллинойс 130
Альбион, Иллинойс 62806

(618)445-2337

Посмотреть рынок

Apple River, IL

100 North Broadway Road
Apple River, Иллинойс 61001

(815)594-2415

Посмотреть рынок

Bowling Green, KY

4350 Louisville Road
Bowling Green, Кентукки 42101

(270) 843-3224

Посмотреть рынок

Bucyrus, Огайо

3153 Огайо 98
Bucyrus, Огайо 44820

(419)562-2751

Посмотреть рынок

Колдуэлл, Огайо

39902 Marietta Road
Caldwell, Огайо 43724

(740) 783-5215

Посмотреть рынок

Cass City, MI

6425 East Cass City Road
Cass City, Michigan 48726

(989) 872-2138

Посмотреть рынок

Колумбия, TN

1231 Industrial Park Road
Columbia, Теннесси 38401

(931)223-8323

Посмотреть рынок

Корпоративный офис

8351 North High Street
Колумбус, Огайо 43235

(800) 456-3276

Посмотреть рынок

Крестон, Огайо

256 South Main Street
Крестон, Огайо 44217

(330)435-6867

Посмотреть рынок

Дитрих, Иллинойс

23831 Иллинойс 33
Дитерих, Иллинойс 62424

(618) 919-0644

Посмотреть рынок

Итон, Огайо

617 South Franklin Street
Итон, Огайо 45320

(937) 456-4161

Посмотреть рынок

Fairfield, IL

1525 Иллинойс 15
Фэрфилд, Иллинойс 62837

(618) 847-3391

Посмотреть рынок

Fayetteville, TN

1700 Winchester Highway
Fayetteville, Tennessee 37334

(931)433-5256

Посмотреть рынок

Фаулер, Мичиган

1050 South Grange Road
Fowler, Michigan 48835

(989)593-3143

Посмотреть рынок

Франкфорт, IN

709 Crawford Street
Франкфорт, Индиана 46041

(765)654-7660

Посмотреть рынок

Галлиполис, Огайо

357 Джексон Пайк
Галлиполис, Огайо 45631

(740) 446-9696

Посмотреть рынок

Goreville, IL

448 Иллинойс 37
Горвилл, Иллинойс 62939

(618)995-2327

Посмотреть рынок

Хиллсборо, Огайо

976 West Main Street
Хиллсборо, Огайо 45133

(937)393-3424

Посмотреть рынок

Ирвингтон, Кентукки

155 North Old US 60 Loop, Ирвингтон, KY 40146, США

(270) 547-4021

Посмотреть рынок

Little York, IN

10050 East Mill Road
Скоттсбург, Индиана 47170

(812)752-4222

Посмотреть рынок

Манчестер, Мичиган

9534 Chelsea Manchester Road, M-52, Manchester, MI 48158

(734)428-8352

Посмотреть рынок

Marshall, MO — Откормочные свиньи

Маршалл, Миссури, США

(660) 815-4154

Посмотреть рынок

Милледжвилл, Иллинойс

219 Railroad Avenue
Милледжвилл, Иллинойс 61051

(815) 821-4182

Посмотреть рынок

Маунт-Вернон, Огайо

14200 Cassell Road
Fredericktown, Огайо 43019

(740)397-5015

Посмотреть рынок

Оттава, IL

1926 North 35th Road
Оттава, Иллинойс 61350

(517)231-0300

Посмотреть рынок

Овентон, Кентукки

86 Bramblett Lane, Owenton, KY 40359, USA

(502)484-5010

Посмотреть рынок

Raymond, IL

21163 Иллинойс 127
Раймонд, Иллинойс 62560

(217)229-3241

Посмотреть рынок

Rushville, IN

3491 Индиана 44
Рашвилл, Индиана 46173

(765) 932-3346

Посмотреть рынок

Салем, IL

1225 Иллинойс 37
Салем, Иллинойс 62881

(618)548-4050

Посмотреть рынок

Shelbyville, IL

2017 Иллинойс 16
Шелбивилль, Иллинойс 62565

(217)774-3939

Посмотреть рынок

ул.Луи, Мичиган

7810 North Croswell Road
Сент-Луис, Мичиган 48880

(989)681-2191

Посмотреть рынок

Страйкер, Огайо

398 West Mulberry Street
Страйкер, Огайо 43557

(419)682-7336

Посмотреть рынок

Vincennes, IN

760 East Elkhorn Road
Vincennes, Indiana 47591

(812)882-7150

Посмотреть рынок

Ветеринары и производители объединяются для борьбы со здоровьем коз

Производители коз и заинтересованные стороны из отрасли имели возможность повысить свои навыки в области здоровья коз и биобезопасности на Дне здоровья и производства коз на ферме в ЮАР в начале этого года.

Организованный в феврале Джоном и Беком Фалькенхагенами, Idealview Goat Dairy, семинар был инициативой пилотной группы проекта «Goat Innovation Platform» проекта «Готовность к ящуру» *, группы под руководством производителей, изучающей наблюдение за домашним скотом и биобезопасность на фермах.

Среди 21 участника семинара были

производителей коз, представители отрасли, ветеринары из частной практики, представители правительства и научно-исследовательских институтов, а также студенты ветеринарных специальностей.

Д-р Бартон Лоечел, научный сотрудник CSIRO и руководитель пилотной группы инновационной платформы Goat Innovation Platform проекта FMD Ready, провел день в качестве фасилитатора.

На семинаре было представлено несколько информативных презентаций, среди которых:

обзор отрасли от Джона Фалькенхагена, президента Австралийского совета по козьей промышленности
обзор значительных экзотических болезней от доктора Селии Дикасон
сводка отчетов д-ра Джереми Роджерса об эндемических болезнях коз
борьба с глистами и вакцинация от доктора Колина Тренгова
обзор микоплазмы, сделанный доктором Робом Патерсоном
для высокопродуктивного стада коз от Энтони Пирса из Hills Farm Supplies.

Презентация Энтони Пирса стала ярким событием для группы, предоставив освежающий отчет о развивающихся рекомендациях по питанию, основанных на молочной промышленности и отвечающих конкретным потребностям ведущего козьего молочного хозяйства.

После презентаций для участников семинара была организована экскурсия по хлеву для детей и отъемышей, доильному стаду взрослых на 500 голов и молочной ферме.

Семинар был интересным и практичным способом для посетителей получить доступ к всестороннему обзору козоводства и проблем со здоровьем, а также поразмышлять о многообещающих перспективах экспорта козьего молока, мяса и живого мяса.

Необходима бдительность

Несмотря на то, что у австралийского козоводства есть ряд возможностей, группа согласилась, что необходимо проявлять бдительность в отношении ряда эндемических заболеваний, таких как энцефалит козьего артрита, лихорадка Ку, болезнь Джона и микоплазма.

Участники признали необходимость изменения взглядов на биобезопасность, чтобы повысить осведомленность о рисках экзотических болезней, чтобы свести к минимуму вероятность вторжения.

O&I Goats — Oats & Ivy Farm

Поздравляем с решением добавить коз в свою семью! Вам понравится каждое мгновение, проведенное со своими новыми «детьми».Пожалуйста, внимательно ознакомьтесь с нашей политикой продаж перед заполнением анкеты. Спасибо!

Политика продаж: Чтобы зарезервировать детей, пожалуйста, заполните анкету ниже. После того, как мы получим вашу анкету, мы свяжемся с вами по электронной почте или по телефону в течение нескольких дней. Вам нужно будет внести невозвратный депозит в размере долларов США в размере за ребенка, который пойдет на покрытие стоимости животного. Хотя нет гарантии, что конкретная племенная пара произведет требуемый пол, выбор осуществляется в порядке очереди.Если плотина не производит желаемого ребенка, у вас будет следующий выбор вашего указанного пола из доступных детей. Вы получите свой залог обратно, если указанный пол не получен от животных. Примечание. Если вы ищете детей нигерийских карликов, зарегистрированных в ADGA, то правила депозита не распространяются на детей из лагерии.

Мы оставляем за собой право изменить решение о продаже животного в любое время и по любой причине. Не все самцы будут считаться достойными пастухов. Мы выберем только лучшее, а все остальное.Потенциально доступные потери устойчивости и цены указаны в профилях козлов выше. Все самки (кастрированные самцы) и домашние животные будут стоить 200 долларов.

Дети остаются на ферме минимум 2 месяца, прежде чем они смогут переехать в свои новые дома. Мы будем растить детей на молоке матери и постепенно переводить их на искусственное вскармливание, когда вы их забираете. Мы настоятельно рекомендуем продолжать кормить детей из бутылочки, пока им не исполнится 4 месяца.

Продажа животных считается окончательной после того, как животное покидает ферму.Мы гарантируем, что все животные будут здоровыми, когда они покинут нашу ферму. Мы проведем с вами медицинский осмотр в день, когда вы заберете своих коз. Вы несете единоличную ответственность за их уход после их отъезда. Мы делаем все возможное, чтобы избавиться от коз с лишенными опушек, но иногда может появиться налет, особенно на неповрежденных самцах. Если вы хотите, чтобы ваши козы сохранили свои рога, вам необходимо будет заплатить полную невозмещаемую сумму в течение 3 дней после рождения.

Если вы раньше не выращивали коз и хотели бы узнать больше, прежде чем привезти новых животных домой, мы предлагаем мастер-классы на ферме.У нас есть неполный дневной семинар, посвященный выращиванию коз для домашних животных, а также обширный многодневный семинар, предназначенный для тех, кто хочет разводить и доить своих коз. Вы можете найти больше информации на вкладке «Мастерские». Если вы просто хотите иметь под рукой отличный ресурс для справки (мы ссылаемся на наши бесчисленное количество раз в течение года, чтобы освежить в памяти вещи и устранить неполадки, если есть проблема), то я не могу достаточно рекомендовать Holistic Goat Care от Джанаклиса Колдуэлла. Она была нашим наставником, когда мы начали разводить коз, и абсолютным экспертом в этом вопросе.

Множественное материнское происхождение и слабая филогеографическая структура домашних коз

Домашние козы ( Capra hircus ) мог сыграть центральную роль в Неолитическая сельскохозяйственная революция и распространение человеческих цивилизаций по всему миру (1, 2). Происхождение домашних коз остается неясным и спорны, но археологические данные свидетельствуют о том, что они были вероятно, впервые был одомашнен в районе Плодородного полумесяца Ближнего Восток ≈10 000 лет назад (YA) (1–5).Некоторые исследования намекают, что второй одомашнивание в Пакистане могло привести к появлению кашемировых пород. (2, 6). Другие предполагают, что по крайней мере два диких вида Capra (7) могли внести свой вклад в генофонд домашние козы (8). Это кажется возможным в свете огромной морфологическое разнообразие среди более 300 пород коз (2). Козы являются наиболее адаптируемым и географически широко распространенным животным видов, от гор Сибири до пустынь и тропики Африки.Они являются основным экономическим ресурсом во многих развивающихся странах, и их экономическое значение в западных страны (2).

Чтобы понять филогенетическую историю коз, мы секвенировали первый гипервариабельный сегмент (HVI) контрольной области мтДНК 406 козы из 44 стран Европы, Азии, Африки, и Ближний / Ближний Восток. Чтобы оценить время, прошедшее с момента расхождения линий мтДНК, мы секвенировали весь цитохром b ген у шести коз.Затем мы сравнили географические особенности HVI. изменение коз и моделей крупного рогатого скота с использованием опубликованных данных (9, 10). Нашей целью было ( i ) оценка материнского происхождение домашних коз и ( ii ) оценка уровней генного поток между популяциями коз, чтобы сделать вывод о важности коз в историческая человеческая коммерция и движение населения. Эти цели рассматриваются в свете последних публикаций как в археозоологии, так и в молекулярная генетика четырех основных видов домашнего скота [крупный рогатый скот (9, 10), овцы (11), свиньи (12) и козы].

Методы

Отбор проб и извлечение ДНК.

Наша обширная выборка охватила большую часть распространения Старого Света коз из Нигерии в Исландию и из Монголии в Малайзию, в том числе потенциальные центры одомашнивания [например, Турция, Египет, Иордания, Ирак, и Пакистан (см. Таблицу 3, которая публикуется в качестве дополнительных данных по веб-сайт PNAS, www.pnas.org)]. Мы пробовали только чистые коренные жители. козы из маленьких отдаленных деревень и исключенных исследовательских центров, большие городов и прибрежных гаваней, куда недавно отправились международные перевозки козы можно.Четырнадцать диких Capra особей были отобранные, включая представителей всех основных таксонов, для использования в качестве аутгруппы. Биопсии крови или кожи собирали и хранили в течение 6–12 лет. месяцев при -20 ° C или в 95% этаноле (соответственно) перед ДНК добыча. ДНК экстрагировали с помощью стандартных коммерческих наборов (Qiagen наборы тканей и крови, Чатсуорт, Калифорния).

Секвенирование.

Мы секвенировали HVI контрольной области мтДНК, потому что это доказало информативный для вывода истории человека и домашних животных (9–11, 13, 14).Праймеры CAP-F (5′-CGTGTATGCAAGTACATAC-3 ‘) и CAP-R (5’-CTGATTAGTCATTAGTCCATC-3 ‘) использовали для амплификации ДНК длиной 579 п.н. фрагмент (это значение исключает вставки / удаления). ПЦР амплификации проводили в объеме 25 мкл, содержащем 2,5 мМ MgCl ₂, 200 мкМ каждого dNTP, 1 мкМ каждого праймер и 1 ед. полимеразы AmpliTaq Gold (Applied Biosystems). ПЦР-смесь прошла 35 циклов по 30 с при 95 ° С, 30 с. при 50 ° C и 1 мин при 72 ° C. Продукты ПЦР очищали с использованием Колонки Quaquick для ПЦР (Qiagen).Затем мы секвенировали сегмент 481 п.н. продукты ПЦР с использованием двух «внутренних» праймеров CAP-FI (5′-TCCATATAACGCGGACATAC-3 ‘) и CAP-RI (5’ATGGCCCTGAAGAAAGAAC-3’). Все последовательности были получены для обеих цепей ДНК с использованием красителя ABI PRISM. Готовый реакционный комплект для определения последовательности цикла терминатора (Applied Biosystems) в объем 20 мкл, содержащий 40-50 нг очищенной ДНК и 3,2 пмоль грунтовка. Реакции секвенирования прошли 25 циклов по 30 секунд при 96 ° C, 30 секунд при 58 ° C и 4 минуты при 72 ° C на термоциклере (PE 2400, PE 9600, или PE 9700; Перкин – Элмер).Убраны лишние терминаторы красителя. очисткой на спин-колонке. Реакции секвенирования подвергали электрофорезу. в течение 6 часов на секвенаторе ДНК ABI 377 PRISM (Applied Biosystems) в 5% гель Long Ranger (FMC).

1140 п.н. цитохрома b (мтДНК) секвенировали на два коз, произвольно выбранных (с разными последовательностями контрольной области) из каждой расходящейся линии ( C. hircus линий A – C) с использованием праймеры L14724V (3′-ATGATATGAAAAACCATCGTTG-5 ‘) и h25915V (3’-TCTCCTTCTCTGGTTTACAAGAC-5 ‘).ПЦР проводили как для HVI, за исключением те же праймеры использовали для начальной ПЦР и секвенирования под следующие условия реакции: 35 циклов (или 25 для секвенирования) из 30 сек при 95 ° C, 30 сек при 55 ° C и 2 мин при 72 ° C. Два отечественных последовательности овец ( Ovis aries ) были получены от двух независимые исследования, перечисленные в GenBank (инвентарные номера AF034730 и X56284).

Анализ данных.

Деревья, соединяющие соседей, а также UPGMA (метод невзвешенных парных групп). с использованием средних арифметических) и деревьев максимального правдоподобия, были построен с использованием программного обеспечения PAUP * версии 0.64d. Следуя Уэйкли (15), неоднородность показателей замещения среди ветвей было смоделировано для HVI коз с использованием гамма-распределения. В Параметр альфа-формы гамма-распределения оценивался с помощью методом максимального правдоподобия из выборки из 35 диких и домашних коз с помощью программного обеспечения paml версии 1.3b (16) под управлением Kimura 2-параметрическая модель подстановки (17). Мы наблюдали существенные гетерогенность в скоростях замен среди нуклеотидных сайтов (альфа 0,29), как это наблюдалось для HVI у других млекопитающих (10, 13, 14).В иерархические компоненты вариации мтДНК рассчитывались по Система AMOVA (Анализ молекулярной дисперсии) (18) с использованием программное обеспечение arlequin, версия 1.1 (http://anthropologie.unige.ch/arlequin). В Процедура AMOVA включает как предполагаемое расхождение между последовательности и частоты. Между домашним и диким Capra (использовались как наши группы), мы обнаружили только четыре и два вставки / удаления одного п.н. и двух п.н. соответственно; в оставшиеся полиморфизмы представляли собой однонуклеотидные замены.

Филогенетические деревья (максимальная экономия и соседство) группируют последовательности цитохрома козы b в одни и те же три кластера ( C. hircus A – C), идентифицированный контрольной областью HVI. последовательности на рис. 1. Молекулярные часы критерий отношения правдоподобия (для неоднородности в скоростях замещения) был проведено с использованием цитохрома шести коз и двух овец b последовательности, проанализированные на 380 нуклеотидов в положениях третьего кодона (т.е. синонимичные позиции вряд ли будут выбраны).Тест не было значимым ( P > 0,05), что позволило нам использовать количество расхождений между последовательностями овец и коз для оценки приблизительное время до последнего предка (TMRCA) трех коз родословные. Используя пять или семь миллионов лет назад в качестве расхождения между овец и коз (19, 20), мы оцениваем TMRCA для генов домашних коз примерно 201 380 лет или 281 932 года. Все последовательности депонированы в GenBank (инвентарные номера AJ317533 – AJ317875).

Рисунок 1

Соседнее дерево типов мтДНК от 406 домашних коз и 14 Дикий Капра .Деревья, построенные другими методами (например, UPGMA или соединение соседей с альфа = 0,20–0,40) были почти идентичны по форме. Большое звездное скопление ( C. hircus A) содержит 316 типов мтДНК (обнаружено у 370 человек и у всех пород). Две меньшие линии ( C. hircus B и C) содержат только восемь и семь типов мтДНК (найдены в 25 и 11 лиц соответственно). C. hircus B обнаружен только в восточной и южной Азии. C. hircus C обнаружен в Монголии, Швейцарии и Словении (рис.2). Цифры на филиалах — это процент 2000 бутстрап-деревьев с одной и той же ветвью состав. Даны только значения начальной загрузки> 70. Дикий таксон с Последовательности, наиболее похожие на домашних коз, — Capra aegagrus (в среднем 61,3 замены с использованием расстояние с поправкой на гамма). Второй по сходству таксон — Capra cylindricornis (84,5 замен; см. Таблицу 4, который публикуется в качестве дополнительных данных на веб-сайте PNAS, www.pnas.org). Неудивительно, что некоторые дикие таксоны кажутся парафилетический, потому что ( i ) таксономия Capra очень плохо изучена и ошибочна в таксономическом отношении возможны классификации (7), ( ii ) парафилий имеет сообщалось (33, 34) и ( iii ) интертаксон возможна гибридизация (23) и считается, что она имеет место в Дагестане. откуда произошли наши (парафилетические) образцы.

Результаты и обсуждение

Последовательности контрольной области были высокополиморфными: 160 вариабельных сайтами определен 331 митохондриальный тип у домашних коз. Большинство мутаций были однонуклеотидные замены. Только три вставки / делеции одного, двух и 76 нуклеотидов были обнаружены в трех, двух и двух различных последовательностях соответственно. В соотношение переходов к трансверсиям было высоким (17/1), как и наблюдались для сегмента мтДНК HVI у крупного рогатого скота и человека (9, 10, 13).

Происхождение коз и мтДНК.

Филогенетический анализ выявил три сильно дивергентных мтДНК коз. линии, включающие 316, восемь и семь типов мтДНК соответственно (Рис. 1, C. hircus A – C). Три различных родословных могли интерпретироваться как свидетельство либо ( и ) трех отдельных материнское происхождение из генетически различных популяций, или ( ii ) одно происхождение от очень большой популяции содержащий три сильно расходящихся линии передачи.

Аргументом в пользу единственного происхождения является то, что появляются три козьих родословных. быть монофилетическим (рис. 1). Если три разных диких Capra популяции были одомашнены, можно ожидать парафилетического дерева в котором сгруппированы некоторые последовательности из дикого Capra между тремя линиями домашних коз ( C. hircus A – C). Однако этот аргумент неубедителен, отчасти потому, что многие вероятные популяции-предшественники диких Capra в настоящее время вымерли (7), что касается крупного рогатого скота, и поэтому не могут быть взяты пробы.Кроме того, это маловероятно, что такие расходящиеся линии произошли от одного наследственное население, потому что население должно было быть чрезвычайно большой, чтобы поддерживать родословные, которые были достаточно расходящимися, чтобы иметь дали начало сильно расходящимся родословным, обнаруживаемым сегодня у коз. В размер предкового населения, который необходимо было бы дать рост до трех расходящихся ветвей составляет ≈38 000–82 000 репродуктивных самки, предполагая, что продолжительность поколения составляет 2–3 года, и предполагая, что одомашнивание произошло ≈10 000 лет назад (см. дополнительный текст, который опубликованы в качестве дополнительных данных на веб-сайте PNAS, www.pnas.org). Приручение коз маловероятно был намного раньше 10 000 лет назад, согласно обширным археологическим данным запись (см. ниже и Таблицу 1).

Таблица 1

Некоторые археологические памятники, в которых утверждается, что приручение домашнего скота было произведено

С другой стороны, четыре линии доказательств подтверждают гипотезу множественное материнское происхождение. Во-первых, линия C. hircus B. (Рис.1) обнаружен только в Восточной и Южной Азии (Монголия, Пакистан, Индия и Малайзия; Инжир.2), а не в Европе, Африке или на Ближнем и Среднем Востоке, где выборка была обширной (включая 314 особей 63 пород и 36 особей). страны). Эта линия, вероятно, возникла в Азии. это маловероятно, чтобы все три линии имели одно географическое происхождение (скажем, в Плодородном полумесяце) и что линия B распространилась на восточную Азию, не оставляя следов в других частях света. Это действительно маловероятно что эта линия могла бы исчезнуть случайно (дрейфовать) из Плодородный регион Полумесяца, потому что раннее домашнее население было расширяется, и дрейф ограничен во время расширения населения.это поэтому более вероятно, что они возникли в Азии.

Рисунок 2

Географическое распределение образцов и трех линий мтДНК. В размер каждого круга пропорционален размеру выборки (от 1 до 62) из каждая из 44 стран. Присутствие каждой линии в стране представлен другим цветом (черный, линия A; серый, линия B; белый, линия C). Таким образом, азиатская линия B встречается в Пакистане, Индии, Малайзия и Монголия. Цифры рядом с каждым кружком на карте показывают количество особей от каждой линии.Полный список породы и количество отобранных особей по породе и стране приведена в Таблице 3, в которой опубликованы дополнительные данные.

Секунда, время с момента расхождения между тремя домашними козами линии ( C. hircus A – C) значительно раньше времени одомашнивание предполагалось на основании летописи окаменелостей. Мы оценили время расхождения козьих линий путем секвенирования всей мтДНК ген цитохрома b от двух коз каждой линии а затем путем калибровки скорости замены гена (при третье положение кодонов) путем сравнения последовательностей козла и овцы.Овцы и козы разошлись на ≈5–7 млн лет назад, по данным копытных. летопись окаменелостей (19, 20). Расчетное расстояние между козой и овцой последовательности в положении третьего кодона составляли 0,536 замен на сайт, что дает приблизительную скорость 0,038–0,054 замен на сайт на миллионов лет, если использовать 7 и 5 миллионов лет соответственно в качестве время расхождения. При использовании этой калибровки самые последние общие предок (т. е. происхождение) линий домашних коз датируется между ≈201,380 и 281,932 лет назад.Это задолго до предполагаемого время одомашнивания (≈9,000–13,000 лет назад), предполагаемое окаменелостью записи для всех сельскохозяйственных животных и растений, которые были одомашнены в Старый Свет (1–5). Это расчетное время расхождения похоже на (≈200000 лет назад) для двух линий мтДНК крупного рогатого скота, которые являются общепринято считать, что произошли от двух независимых одомашнивания (9, 10). Таким образом, эти данные позволяют предположить, что три козьи линии произошли из генетически обособленных популяций, а не из от одной дикой популяции.

В-третьих, недавние исследования мтДНК у всех других основных сельскохозяйственных животных. (крупный рогатый скот, овцы и свиньи) также выявили множество сильно расходящихся линии, одна из которых существует только или в основном на юге или востоке страны. Азия (9–12). Это подразумевает возможный азиатский центр происхождения в дополнение к центру (ам) Плодородного полумесяца (1–5). Эти результаты поддержать гипотезу множественного генетического происхождения коз, и они предполагают, что множественное материнское происхождение является общей темой среди домашних животных.

В-четвертых, самые последние археологические данные соответствуют по крайней мере два (а возможно, до пяти) разных мест для одомашнивания козы (таблица 1). Козлов действительно держали в неволе на юге Турецкий регион долины Евфрата ≈11000 лет назад, как показано на Невали Чори (4). Появление домашних коз ≈10 000 лет назад в г. Загрос (Гандж-Даре, Иран), более 800 км к востоку, указывает на второе и, вероятно, самостоятельное место для одомашнивания козы (5).Внешний вид домашних коз (вместе с овцами, свиньями, и крупный рогатый скот) ≈9000 лет назад в бассейне Инда (Мехргарх, Восточный Белуджистан) предполагает возможное третье независимое местное одомашнивание. (6). Наконец, вопросы, касающиеся местного приручения коз. ≈9,000–10,000 лет назад в Южном Леванте (21) и центральной Анатолии (3) все еще обсуждаются (Таблица 1).

В свете приведенных выше свидетельств как археологических, так и молекулярных генетика домашнего скота, самая скупая интерпретация наших данных состоит в том, что козы имеют множественное материнское происхождение, возможно, возникшее из-за множественные независимые одомашнивания.Однако все еще возможно, что множественные материнские линии у коз (и всех видов домашнего скота) возникло через интрогрессию, а не через отдельное приручение События. Интрогрессия возможна, потому что весь домашний скот виды (козы, крупный рогатый скот, овцы и свиньи) могут скрещиваться с дикими родственные виды (9, 11, 12, 22–24). Стоит отметить, что мтДНК менее чувствительна к интрогрессии диких видов, чем ядерная ДНК потому что мтДНК передается только от самок. Таким образом, мтДНК больше полезен для изучения одомашнивания, потому что он обнаруживает только интрогрессия от самок, что менее вероятно, чем интрогрессия от диких самцов (24).

Расширение населения.

Анализ распределения несоответствий выявил генетическую подпись рост населения с разной датой расширения для каждого из три линии мтДНК коз (рис. 3). Анализ распределений рассогласования (т. Е. Распределений всех попарных различия последовательностей), используя последовательности контрольной области мтДНК, имеют часто использовался для обнаружения и датировки исторического населения разложения (13, 14, 25–27). Для коз — колоколообразное несоответствие распределения и звездчатые филогении (рис.1 и 3) являются в соответствии с демографическим ростом населения, например, ожидается после происхождения каждой линии от ограниченного числа учредители (25–27).

Рисунок 3

Распределения рассогласования (т. Е. Попарная разность последовательностей распределения) для типов мтДНК из основной линии козла последовательности, C. hircus A, и от двух меньших линии, C. hircus B и C. Признак популяции рост (т. е. колоколообразное распределение) отчетливо виден в распределение для всех трех кластеров последовательностей, как и следовало ожидать для популяций, расширяющихся после приручения относительно небольшого числа учредители-физические лица (25).Средние раздачи разные, предлагая разные даты расширения для каждой из трех коз родословные. Азиатская линия ( C. hircus B) показывает самая последняя дата расширения.

Можно порассуждать о приблизительных относительных датах расширения каждой козьей линии путем сравнения количества вариаций последовательности в пределах каждой линии и предполагая аналогичное (ограниченное) количество мтДНК разнообразие внутри каждой родословной основателей. Данные свидетельствуют о том, что линия C.hircus A претерпел относительно древний рост населения, в то время как две другие линии (B и C) пережила относительно недавнее расширение. Разнообразие внутри крупная линия C. hircus A (≈10.9 парных различий, по среднее) намного выше, чем разнообразие внутри каждого из двух меньшие линии (≈2,3–5,6 различий; рис. 3). Меньший линии широко распространены географически (например, C. hircus B встречается от Монголии до Пакистана и Малайзии; см. ниже) вероятно из-за относительно недавнего распространения этих линий мтДНК.Если возникли две меньшие линии передачи, которые распространились на 8 000–10 000 лет назад, вскоре после предполагаемой даты первоначального одомашнивания (1–5), мы ожидаем, что возникнут более расходящиеся линии передачи, как в более крупный кластер мтДНК ( C. hircus A). Относительная датировка прироста населения является информативным, потому что даты расширения должно примерно соответствовать времени, когда каждая линия коз начала стать многочисленными и, таким образом, стать важными в историческом человеческом общества и экономики.

Мы можем приблизительно оценить относительные даты распространения каждой линии с использованием параметров ступенчатого расширения населения (по оценкам из распределений рассогласования), и с учетом неоднородность скоростей мутаций в соответствии с гамма-распределением с расчетный параметр α = 0,29 (26). Время расширения выражено в единицах мутации (τ = 2 ut , где u — частота мутаций для 481 пары оснований, и t — время в поколений) равны 10.8 (ДИ _90% = 9,37 — 11,27) для C. hircus A, 2,3 (ДИ _90% = 0,95 — 3,89) для С. hircus B и 6,6 (ДИ _90% = 3,67 — 8.94) для C. hircus C. Предполагая, что большая линия ( C. hircus A) соответствует начальному одомашниванию, которое произошло ≈10,000 лет назад, находим даты ≈2,130 и ≈6,110 лет назад, соответственно для расширений C. hircus B и C. Мы может оценить минимальное и максимальное значение для этих двух последних дат на основе 90% доверительных интервалов для дат расширения С.hircus B и C выражены в мутационных единицах. Эти минимальная и максимальная даты — 841–4 151 лет назад для C. hircus B, и 3,253–9,536 лет назад для C. hircus C. Эти временные интервалы не перекрывать время первичного расширения (10000 лет) и, следовательно, обеспечивают некоторую поддержку гипотезы о том, что как C. hircus B и C представляют собой вторичные расширения после первоначального относительно древняя экспансия ( C. hircus C). В этом анализе используются относительные даты и, следовательно, не зависит от точности предполагаемая абсолютная дата первоначального одомашнивания (т.э., ≈10 000 Ю.А.).

Структура населения.

Географическая структуризация среди козла была на удивление слабой. популяций, как показал филогеографический анализ 406 последовательности контрольной области. Например, типы мтДНК из основных линии ( C. hircus A) были обнаружены во всех странах и породы. МтДНК из C. hircus B были обнаружены во многих Азии, включая Пакистан (три породы), Индию (две породы), Малайзия и Монголия. Представители C.hircus C были обнаружены даже в Словении, Швейцарии и Монголии (рис. 2 и Таблица 3, которая публикуется в качестве дополнительных данных). Близко связанный Типы мтДНК (различающиеся 1–4 заменами) обнаружены в отдаленных местоположения — например, Дания и Португалия, Монголия и Украина, а также Алжир и Турция. Кроме того, сильно различающиеся типы мтДНК (отличающихся более чем на 18 замен) были обнаружены внутри пород и географические регионы. Мы количественно оценили степень структурирования по вычисление компонентов вариации мтДНК (внутри пород vs.между породы в сравнении с континентальными группами пород) в иерархической Каркас AMOVA (18). Этот расчет показал, что большой процент (78,72%) от общей вариации мтДНК у C. hircus составляет Распространен внутри пород. Меньший, но значительный процент существует среди континентальных групп (10,58%; P <0,001) и среди пород (10,70%; P <0,001) (Таблица 2).

Таблица 2
Иерархическое распределение разнообразия мтДНК (HVI) в пределах и среди пород (и континентальных групп пород) для коз и крупный рогатый скот согласно расчетам AMOVA framework (15)
Интересно, что степень географической структурированности мтДНК козла вариативность намного слабее, чем у крупного рогатого скота.Например, межконтинентальных подразделений подразделений составляют ≈84% общая вариабельность мтДНК у крупного рогатого скота (10), по сравнению с только ≈10% у козы (таблица 2). Если исключить Азию (где второй подвид диких крупный рогатый скот, возможно, был одомашнен), межконтинентальное подразделение все еще составляет> 50% вариаций мтДНК у крупного рогатого скота. Слабее генетическая структура коз, вероятно, является результатом более межконтинентального транспортировка коз, чем крупного рогатого скота. Это соответствует тот факт, что козы более портативны и представляют собой меньшую денежную единицу чем крупный рогатый скот (8).Овцы и свиньи, как и крупный рогатый скот, по-видимому, тоже проявляют существенное филогенетическое структурирование, хотя данные ДНК меньше обширные (11, 12), и необходимы дальнейшие исследования.
Маловероятно, что ограниченная структура популяций коз (относительно крупного рогатого скота) является результатом недавней перевозки коз между континентами по трем причинам. Сначала мы сделали выборку с удаленного географические местоположения, а не районы, где могли быть козы отправлены недавно (например, в крупные города и прибрежные гавани).Мы тоже отобраны только местные породы и исключены недавно «улучшенные» породы, такие как южноафриканский бур. Во-вторых, коз стало меньше экономически важны, чем крупный рогатый скот, овцы и свиньи, и поэтому были перевозили меньше в последнее время, в течение которого современный транспорт сделал более осуществима перевозка скота на большие расстояния (особенно крупный рогатый скот, менее выносливый, чем козы). Наконец, козьи гаметы в последнее время перевозятся реже, потому что технология искусственного оплодотворения и трансплантации эмбрионов меньше развиты и редко проводятся на козах по сравнению с другими домашний скот.Эти аргументы предполагают, что если недавний транспорт уменьшился структурирование поголовья скота, это должно было ослабить структурирование больше крупного рогатого скота, чем коз. Тем не менее, козы далеко более слабая структура населения, чем крупный рогатый скот.
Отсутствие сильной филогеографической структуры (т.е. высокий поток генов) в козах имеет интригующее значение для истории человечества движение населения и торговля. Слабое структурирование среди козла популяции предполагает, что коз часто перевозили для коммерческой торговли или во время миграционных и поисковых перемещений люди.Например, козлов возили на кораблях и иногда выпущен на океанические острова и далекие континенты для обеспечения свежих источники молока и мяса (2). Вполне разумно, что козлы были перевозили чаще и успешнее, чем другой домашний скот потому что «козы, пожалуй, самые универсальные из всех жвачных животных в их пищевые привычки, фактор, который сильно повлиял на их успех как домашнее животное »и потому что козы« также чрезвычайно выносливы. и будет процветать и размножаться на минимуме еды и в крайних случаях температура и влажность »(исх.8, стр. 75).
Таким образом, множественное материнское происхождение представляется обычным явлением. среди домашних животных. Различное происхождение и повторяющийся ген поток из диких животных, вероятно, способствовал развитию сегодня есть самые разные и высокопродуктивные породы. К сожалению, растущие темпы исчезновения диких таксонов и домашние породы серьезно уменьшают генетическое разнообразие, на котором будущее улучшение породы может зависеть. Обнаружение дивергентной мтДНК родословная в Азии для всех четырех основных видов домашнего скота согласуется с центр происхождения в Азии, в дополнение к центру в плодородной Полумесяц (1–5).По сравнению с крупным рогатым скотом, козы, похоже, испытали гораздо более обширный межконтинентальный поток генов. Это согласуется с надежность, приспособляемость и относительная простота транспортировки коз (особенно в исторические времена). Это также предполагает, что козы могут сыграли важную роль в исторических человеческих колонизациях, миграции и коммерция.
Благодарности
Мы благодарим D. Bradley, M. Bruford, P. England, I. Till-Bottraud, B. Уэйна и трех анонимных рецензентов за полезные комментарии к рукопись.Большое спасибо В. Карри и М.-П. Бижу-Дювалю за помощь с лабораторные анализы и тем, кто любезно предоставил образцы: Н. Хасима, А. Вирк, А. Гаффар, О. Ханотт (ILRI), Э. Бедин, П. Вайнберг, Р. Соригер, С. Даннер, М. К. Саньяси, Л. О. Нгере, Д. Зигойяннис, Л. О. Эйк, Х. Ларсен, А. Амкофф, М. Гоф, П. Эванс, Н. Аззопарди, Ф. Пилла, Д. Матассино, В. Фет, Х. Аматурадо, И. Коройу, И. Моглан, Т. М. Коррейч, Э. Зимба, С. Брезник, Э. Эйторсдоттир, В. Хамдин, Дж. Хонмоде, Дж. М. Виллемот, В.Я. Глазко, Э. Мартынюк, М. М. Шафи, Ferme du Pic Bois, C. Куртюрье, М. Н. Дай, Р. Дель Ольмо, Т. Фор и особенно М. Або-Шехада, О. Эртугрул, М. Ю. Загдсурен, М. А. А. Эль-Бароди, Г. Обексер-Рафф и Г. Дольф. Работа финансировалась грантом. от Европейской комиссии (BIO4CT961189). L.E. был поддержан Грант Швейцарского национального фонда 31-56755.99.
Наша история
Миссия
В Baetje Farms мы придерживаемся очень высоких стандартов.Мы считаем, что лучший сыр получается из лучшего молока животных в наилучшей физической форме. В каждом кусочке вы можете почувствовать страсть и преданность делу, которые вкладываются в создание каждого продукта.
Наша история
Baetje Farms, произносится как «Bay-G», возникла, когда соучредители Стив и Вероника Баетье купили свою первую козу чуть более 20 лет назад. В качестве хобби они искали лучший способ приготовить козий сыр «Pure Artisan Farmstead» во французском стиле. Вскоре после этого они впервые поделились с публикой 88 кусочками шевра в форме сердца в St.Луи Винный фестиваль. Когда очередь была обернута вокруг здания для людей, желающих попробовать сыр, и они выбежали, они знали, что кое-что нашли. С тех пор фермы Баетже получили более 70 национальных и международных наград за свой сыр и продаются по всей территории Соединенных Штатов.
Наша ферма
Baetje Farms расположена между холмами юго-восточного Миссури и естественным родниковым ручьем в долине Форш-дю-Кло. Мы находимся в 4,8 км от межштатной автомагистрали 55, к югу от Санкт-Петербурга.Луи у входа в винный погреб Миссури в Блумсдейле, штат Миссури. Этот район является одним из старейших поселений к западу от реки Миссисипи, поскольку французские поселенцы спустились по реке Миссисипи из Канады в начале 1700-х годов и остановились здесь из-за разнообразия земель и богатых почвенных условий для выращивания сельскохозяйственных культур. Наш сарай начинался как сарай для комплектов Sears and Roebuck, построенный дядей нашего соседа в 1912 году.
Сыроварня
Наше сырное производство построено для производства небольших партий сыра в сочетании с современными технологиями выдержки. помещения, обеспечивающие точный температурный и влажностный режим.Мы используем очень свежий сычужный фермент и культуры, импортированные из Франции и Дании. Первый сыроваренный завод был добавлен в коровник в 2006 году, а второй — в 2011 году для удовлетворения спроса. Кто знает, возможно, нас скоро снова добавят!
Наша молочная ферма
Baetje Farms начиналась как ферма, и теперь мы работаем с другими фермерами, которые также придерживаются таких же высоких стандартов качества. Вместе наши козы получают неограниченный запас фильтрованной родниковой воды из родниковых ручьев.Они получают органические минеральные добавки, люцерну, выращенную на месте, и питаются натуральным зерном, не содержащим антибиотиков. Козы могут свободно пастись на пастбищах, их не кормят гормонами для увеличения производства молока и они размножаются естественным путем. Счастливые и здоровые козы производят отличное молоко, что помогает нашим сыроделам делать отличный сыр!
Наша команда
За 20 лет, прошедших с тех пор, как основатели запустили ведущий в отрасли бизнес по производству сыров, многое изменилось, но так много осталось! Наша команда продолжает расти, но это не мешает нам сосредоточиться на создании первоклассных вкусных сыров, отмеченных наградами.Мы поддерживаем истоки, из которых была основана Baetje Farms, знаем, что члены нашей команды — наши самые большие ресурсы, и гордимся тем, что делимся с вами нашими продуктами! Вот почему наша команда также рада поделиться ….
Ремесленник родился
В рамках нашей приверженности наследию Baetje Farms мы хотели поделиться им с нашими клиентами, поэтому мы открыли его агротуризму и строительству The Artisan; центр мероприятий. Название отдает дань уважения огромному труду наших сыроваров.Пространство приглашает гостей на свадьбы, собрания, экскурсии и просто наслаждаться любимым сыром. Мы рады продемонстрировать историю фермы Баетже и открыть ее для гостей, чтобы они смогли насладиться таким особенным местом!
Геномные варианты из RNA-seq для коз, устойчивых или чувствительных к желудочно-кишечной нематодной инфекции
Abstract
Желудочно-кишечные нематоды (GIN) являются важным препятствием для производства мелких жвачных животных. Генетический отбор устойчивых животных — это потенциальная стратегия устойчивого контроля.Достижения в области молекулярной генетики привели к идентификации нескольких молекулярно-генетических маркеров, связанных с генами, влияющими на важные с экономической точки зрения признаки. В этом исследовании варианты в геноме креольских коз, устойчивые или чувствительные к GIN, были обнаружены путем секвенирования РНК. Мы идентифицировали SNP, вставки и делеции, которые различают два генотипа, устойчивый и чувствительный, и охарактеризовали эти варианты с помощью функционального анализа. Путь передачи сигналов рецептора Т-клеток был одним из важнейших путей, которые отличают устойчивый генотип от восприимчивого, при этом 78% генов, участвующих в этом пути, демонстрируют геномные варианты.Ожидается, что эти геномные варианты предоставят полезные ресурсы, особенно для молекулярного разведения устойчивости к GIN у коз.
Образец цитирования: Aboshady HM, Mandonnet N, Johansson AM, Jonas E, Bambou J-C (2021) Геномные варианты из последовательности RNA-seq для коз, устойчивых или чувствительных к желудочно-кишечной нематодной инфекции. PLoS ONE 16 (3): e0248405. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0248405
Редактор: Ралука Матееску, Университет Флориды, США
Поступила: 7 февраля 2020 г .; Принята к печати: 25 февраля 2021 г .; Опубликовано: 15 марта 2021 г.
Авторские права: © 2021 Aboshady et al.Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License, которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии указания автора и источника.
Доступность данных: Необработанная последовательность операций чтения загружена в стабильный общедоступный репозиторий (NCBI BIOPROJECT) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/667825 Доступ: PRJNA667825 ID: 667825.
Финансирование: Это исследование финансировалось проектом MALIN (регион Гваделупа и фонд Européens FEDER).H.M.A была поддержана докторской стипендией в рамках проекта European Graduate School in Animal Breeding and Genetics.
Конкурирующие интересы: Авторы заявляют об отсутствии конкурирующих интересов.
Введение
Желудочно-кишечные нематоды (ГИН) являются одними из наиболее патогенных паразитов овец и коз, вызывающих большие экономические потери. Широкое географическое распространение и растущая устойчивость к антигельминтным молекулам требуют альтернативных стратегий борьбы [1].Отбор устойчивых животных с использованием генетической информации является многообещающей стратегией. Однако отбор, основанный на фенотипических признаках, таких как подсчет фекальных яиц (FEC), был успешно использован [2–4], хотя эта стратегия реализует определенную степень неопределенности, поскольку FEC является косвенным показателем устойчивости. Измерение FEC также требует времени и затрат, поскольку требует заражения животных паразитами естественным или экспериментальным путем. С другой стороны, отбор с использованием информации из генома может обеспечить более быстрый и надежный инструмент в селекции на устойчивость к GIN.Идентификация геномной изменчивости — главный шаг к пониманию взаимосвязи между генотипом и фенотипом. Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) продемонстрировали потенциал в качестве молекулярных маркеров для связывания генотипов с желаемыми признаками у коз, такими как качество и количество молока [5–7], размер помета [8, 9], скорость роста [8, 10], качество волокна. [11–13] и устойчивость к болезням [14].
Недавно Piskol et al. [15] показали, что геномные варианты, обнаруженные с помощью данных секвенирования РНК (RNA-seq), предлагают экономичную и надежную альтернативу для обнаружения SNP.Они показали, что среди SNP, вызванных из данных RNA-seq, более 98% также были идентифицированы с помощью подходов секвенирования всего генома или всего экзома. Технология RNA-seq была разработана в первую очередь для картирования и количественной оценки транскриптомов для анализа глобальной экспрессии генов в различных тканях. Помимо возможности обнаружения дифференциально экспрессируемых генов, поскольку функциональные гены RNA-seq секвенированы с высоким охватом, может быть выполнен поиск полномасштабных вариантов (SNP, вставок и делеций) в кодирующих генах.На сегодняшний день этот метод используется как метод обнаружения SNP в транскрибируемых регионах эффективным и экономичным способом [13, 16–19]. В этом исследовании мы провели анализ обнаружения геномных вариантов транскриптомов слизистой оболочки сычуга устойчивых и восприимчивых креольских коз, экспериментально инфицированных Haemonchus contortus , выбранных по его распространенности у овец и коз в умеренных и тропических регионах мира, и охарактеризовали выявленные варианты.
Материалы и методы
Заявление об этике
Все методы и процедуры обращения с животными, а также процедуры экспериментального заражения, отбора проб тканей и забоя были одобрены Французским комитетом по этике № 069 (Comité d’Ethique en Matière d’Expérimentation Animale des Antilles et de la Guyane, CEMEAAG ) утвержден Министерством высшего образования, исследований и инноваций Франции. Эксперимент проводился в экспериментальном центре INRA PTEA (Plateforme Tropicale d’Expérimentation sur l’Animal) в соответствии с сертификатом № A 971-18-02 о разрешении на проведение экспериментов на живых животных, выданным Министерством сельского хозяйства Франции.
Животные и опытный образец
Родословная каждого животного экспериментального стада, использованного в этом исследовании, была доступна от поколения фонда в 1979 году. Кроме того, с 1995 года, образцы фекалий собирались регулярно (6 и 7 недели после промывания) от каждого животного через 11 месяцев после полива. возраст для генетической оценки в среднем по 2 измерениям FEC. Эта генетическая оценка обеспечивает племенную ценность (BV) для FEC каждой козы экспериментального стада PTEA на основе FEC их родителей, объединенной с их собственными, когда они доступны (т.е. в 11 месяцев). Восемь 9-месячных креольских детей были выбраны на основе их экстремальной оценки BV (4 ребенка с самым высоким BV по устойчивости и 4 ребенка с самым высоким BV по восприимчивости) в их когорте (n = 89). Перед экспериментом дети выращивались на пастбище от рождения до 9 месяцев с ограниченным уровнем загрязнения GIN (FEC <500). FEC 8 детей (n = 4 устойчивых и n = 4 восприимчивых) статистически не различались в возрасте 9 месяцев. Среднее значение BV двух групп животных было разделено на 1.04 генетическое стандартное отклонение. Животных залили моксидектином (Cydectine®, Fort Dodge Veterinaria S.A., Tours, Франция, 300 мкг / кг) и поместили в закрытом помещении в условиях отсутствия гельминтов в одном загоне за месяц до начала эксперимента. В возрасте 10 месяцев дети были инфицированы перорально (испытание 1) однократной дозой 10 000 H . contortus личинок третьей стадии (L3), которые затем залили моксидектином через 5 недель. После 4 недель отдыха в условиях, свободных от паразитов, фистулу хирургическим путем имплантировали в сычуг каждого животного для взятия образцов слизистой оболочки сычуга.Через четыре недели после хирургической процедуры животных инфицировали орально (заражение 2) однократной дозой 10 000 H . contortus L3. Во время контрольного заражения 2 у каждого животного брали биопсию слизистой оболочки сычуга через 0, 8, 15 и 35 дней после инфицирования (dpi). Кроме того, во время второго заражения дважды в неделю брали пробы фекалий. Подробная информация об отборе проб фекалий, измерениях FEC и анализе данных была опубликована ранее [20].
Хирургическая процедура
Специально разработанная сычужная канюля состояла из гибкой резиновой трубки длиной 7 см и диаметром 2 см с закругленным основанием диаметром 4 см.Этот гибкий пластик был выбран для ограничения возможности механического истирания слизистой оболочки сычуга. За 16 ч до операции по установке канюли животных не кормили. Животным предварительно вводили кетамин (2 мг / кг внутримышечно, Le Vet Pharma, Wilgenweg, Neitherlands), ксилазин (0,2 мг / кг внутримышечно, Le Vet Pharma, Wilgenweg, Neitherlands) и окситетрациклин (20 мг / кг внутримышечно, Eurovet Animal Health. , Handelsweg, Нидерланды). Животные располагались в положении лежа на левом боку. Кожа над операционным полем была выбрита и обработана повидон-йодом (Vétédine, Laboratoire Vetoquinol S.А., Люр, Франция). Был сделан разрез по средней линии вентральной части, чтобы определить местонахождение сычуга и выделить его наружу. Нить кисетной нитью шириной 3 см (Silk 2–0) накладывалась посередине между малой и большой кривизной, а в центре делался колотый разрез для введения канюли. Затем кисетный шов был затянут и завязан. Чтобы сохранить сычуг в анатомически правильном положении, на брюшной стенке на расстоянии 10 см от лапаротомного разреза в правой парамедианной области был сделан еще один колотый разрез, чтобы канюля могла свободно проходить.На внешнюю часть канюли накладывали внешний фланец и фиксировали лейкопластырем. В канюлю вставляли стерильный компресс в качестве стопора. После хирургической операции все животные были размещены индивидуально со свободным доступом к пресной воде и сену.
Процедура отбора биопсии
Биоптаты были взяты со слизистой оболочки сычуга с помощью гибкого эндоскопа (FG-24V, Pentax, Франция). Образцы биопсии размером 2 × 2 × 2 мм, взятые с помощью эндоскопических пинцетов с окном (модель KW1815S), быстро замораживали в жидком азоте и хранили при -80 ° C до экстракции РНК.Животных удерживали в шлейке с хирургической простыней, позволяющей выступать ногам животного и открывающей канюлю. Седативный эффект не применялся, поскольку во время или после процедуры не наблюдалось никаких признаков дискомфорта или боли. Стерильный компресс, вставленный в канюлю, удаляли и собирали сычужное содержимое. Эндоскоп вводили в просвет сычуга, и на каждое животное брали по 3 биопсии в определенные моменты времени из сычужных складок слизистой оболочки глазного дна. В каждый момент времени наблюдалась вся слизистая оболочка фундального отдела, и не наблюдалось никаких признаков повреждения слизистой оболочки из-за предыдущего отбора образцов.
Экстракция и секвенирование РНК
Суммарную РНК экстрагировали с использованием набора для выделения РНК NucleoSpin® (Macherey-Nagel, Hoerdt, France) в соответствии с инструкциями производителя, за исключением того, что расщепление ДНКазой выполняли с вдвое превышающим указанное количество фермента. Концентрацию общей РНК измеряли с помощью NanoDrop 2000 (ThermoScientific TM, Франция). Целостность РНК проверяли с помощью Agilent Bioanalyzer 2100 (Agilent Technologies, Франция) с числом целостности РНК> 7.5. Экстрагированную тотальную РНК хранили при -80 ° C до секвенирования.
Высококачественная РНК из всех образцов была обработана для подготовки библиотек кДНК с использованием набора для подготовки образцов РНК Illumina TruSeq для анализа мРНК в соответствии с протоколами Illumina. После контроля качества и количественной оценки библиотеки кДНК были объединены в группы по 6 технических повторов и секвенированы на 5 дорожках на HiSeqTM 2000 (Illumina® NEB, США) для получения примерно 30 миллионов считываний (100 пар оснований) для каждого образца со вставкой. размеры от 200 до 400 пар оснований.
Биоинформатический анализ
Проверка контроля качества необработанных чтений в формате FASTQ была обработана с использованием FASTQC. Остальные считывания были сопоставлены с геномом Capra hircus (сборка ARS1 из NCBI) с использованием выравнивателя Burrows-Wheeler (BWA). Геномные варианты, включая SNP, а также небольшие вставки и делеции (инделения) были обнаружены с помощью mpileup в SAMtools. Критерий фильтрации вариантов: обнаруженный вариант сохранялся только при соблюдении четырех критериев: глубина чтения более 10, оценка качества более 20, частота минорного аллеля более 0.05 и варианты присутствуют, по крайней мере, у 50% индивидуумов группы и повторяются, чтобы гарантировать постоянство каждого варианта между индивидуумами одной и той же группы (вариант, специфичный для группы).
Статистика вариантов и функциональная аннотация
SNP, вставки и делеции сравнивали между образцами из устойчивой и восприимчивой групп. Общие варианты были исключены, и только разные варианты между двумя группами были оставлены для последующего анализа. Идентификатор генов и его положение на хромосоме (начальное и конечное положение) были извлечены из файла NCBI gff (GCF_001704415.1_ARS1_genomic.gff), используя команды Unix, затем объединенные с группами обнаруженных файлов вариантов в зависимости от положения варианта для определения генов, содержащих варианты. Информация о вариантах распределения между генами была рассчитана в программе R после слияния вариантов с соответствующими аннотированными генами. Влияние вариантов (SNP, вставок и делеций) на гены определяли с помощью инструмента веб-интерфейса VEP (VEP), предоставляемого онлайн-инструментами Ensembl (https://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/ показатель.html) в справочнике генома козы (сборка: ARS1), а результаты были извлечены в виде файла .txt для графического интерфейса с помощью программы R. Гены, содержащие варианты, были аннотированы терминами Gene Ontology (GO) по категориям биологических процессов, молекулярных функций и клеточных компонентов с использованием пакета clusterProfiler R [21]. В качестве порогового значения использовалось скорректированное по Бонферрони значение P ≤ 0,05. Дополнительно обогащенные пути KEGG для генов, содержащих варианты, были идентифицированы с использованием того же пакета.Для визуализации использовался пакет Pathview [22]. Использовалась версия R 3.5.1.
Результаты
Фенотипическая оценка устойчивых и восприимчивых животных
Животных тестировали на FEC дважды в неделю во время контрольного заражения 2 для оценки статуса устойчивости и восприимчивости животных. Результаты показали, что при 21 dpi не было разницы в FEC между устойчивыми и восприимчивыми животными. Между тем, FEC была значительно ниже у устойчивых по сравнению с восприимчивыми животными от 23 точек на дюйм до конца второго заражения (35 точек на дюйм).Это подтвердило статус животных как устойчивых или восприимчивых к инфекции GIN со значительными различиями для FEC между группами.
Секвенирование и открытие SNP
RNA-seq произвел в среднем 15,3 миллиона необработанных считываний на образец. Наши результаты выравнивания считывания показали, что 99,3% считываний секвенирования (15,2 миллиона) были успешно сопоставлены с эталонным геномом козы ARS1 при среднем 79% секвенировании парных концов.
Использование RNA-seq считывает в сумме ~ 2,33 и ~ 1.82 миллиона необработанных позиций геномных вариантов, экспрессируемых в слизистой оболочке сычуга устойчивых и восприимчивых животных, были обнаружены в различные моменты времени инфицирования (таблица 1). После анализа с фильтрацией вариантов мы смогли идентифицировать 354 598 и 253 218 SNP, 20 463 и 15 455 записей вставок и 20 397 и 14 841 делеций для резистентных и восприимчивых детей, соответственно. Эти варианты затем были использованы для построения диаграмм Венна (рис. 1), чтобы представить общие и не распространенные варианты между устойчивыми и восприимчивыми животными.При сравнении геномных вариантов двух генотипов в разные моменты времени инфицирования было обнаружено 200 053 SNP, 10095 делеций и 8755 вставок (рис. 1). Чтобы изучить различные варианты генома у устойчивых и восприимчивых животных, мы исключили общие варианты и провели последующий анализ с необщими вариантами.
Необычные SNP были аннотированы соответствующими генами. У резистентных и восприимчивых животных было идентифицировано в общей сложности 12 142 и 8635 генов, содержащих SNP, соответственно.В образцах от восприимчивых животных в среднем было идентифицировано 5,19 SNP на ген. Между тем, удвоенное количество SNP (10,53 SNP на ген) было идентифицировано в данных, полученных от устойчивых животных. Среди генов, содержащих SNP, чаще встречались гены только с 1 SNP (1759 для устойчивых и 2629 для восприимчивых). Гены с 10 или менее SNP составили 69,1% и 88,9% всех SNP, идентифицированных в образцах от устойчивых и восприимчивых животных, соответственно. Результаты распределения SNP среди генов показали, что у восприимчивых животных было идентифицировано больше генов, содержащих один или два SNP, тогда как у устойчивых животных было идентифицировано больше генов, содержащих 3 или более SNP (рис. 2).
Следуя той же процедуре, в гены были аннотированы необычные вставки и делеции. Всего 4848 и 3292 генов, содержащих вставки, и 4660 и 2610 генов, содержащих делеции, были идентифицированы по данным, полученным от устойчивых и восприимчивых животных, соответственно. Среди них гены с одной вставкой или делецией были более распространены и составляли более 50% всех идентифицированных вставок или делеций. Распределение вставок и делеций среди генов показано на рис. 3. Данные по устойчивым животным всегда содержали больше вставок и делеций среди генов.
Все варианты (SNP, инсерции и делеции) были объединены в два файла: один для вариантов, идентифицированных в данных по устойчивым животным, и один для вариантов, идентифицированных в данных по восприимчивым животным. Для обоих файлов был проведен анализ прогнозирования эффекта вариантов, и результаты показаны на рис. 4. Наивысшее соотношение вариантов составило около 50% для вариантов интронов из вариантов у устойчивых (56%) и восприимчивых (47%) животных, за которыми следовали нижестоящие животные. и варианты вышестоящих генов (20% и 8% у устойчивых и 25% и 8% у восприимчивых животных).Всего было предсказано 3% миссенс-вариантов у устойчивых и 4% у восприимчивых животных (рис. 4).
После анализа, обогащенного GO, 10 736 и 8 538 генам, содержащим геномные варианты у устойчивых и восприимчивых животных, были присвоены одним или несколькими терминами GO. 10 основных терминов GO в категориях биологических процессов, молекулярных функций и клеточных компонентов этих аннотированных генов показаны на рис. 5. Шесть-семь из 10 основных терминов в каждой категории GO были одинаковыми независимо от генотипа.Что касается клеточного компонента, то основной категорией, которая была идентифицирована в данных по устойчивым, но не восприимчивым животным, была митохондриальная матрица. Что касается молекулярной функции, активность гидролазы сложного эфира фосфорной кислоты была наиболее представительным термином для вариантов, идентифицированных в данных по устойчивым животным, которые не присутствовали в данных по чувствительным животным. Наиболее значимыми терминами ГО в категории биологических процессов были фосфолипидный метаболический процесс и макроаутофагия, которые были идентифицированы только по данным устойчивых животных.
10 основных путей KEGG для генов, содержащих геномные варианты, идентифицированные в данных для обоих генотипов, представлены на рис. 6. Путь передачи сигналов митоген-активируемой протеинкиназы (MAPK), путь передачи сигналов рецептора Т-клеток (TCR), путь регулирования гепатита B и долголетия. были наиболее значимыми путями, идентифицированными только по данным, полученным от устойчивых животных. Активация Т-лимфоцитов является ключевым событием адаптивного иммунного ответа хозяина. Поэтому мы сосредоточились на сигнальном пути TCR, который был идентифицирован в основных путях KEGG для устойчивых животных.Путь передачи сигналов TCR и количество геномных вариантов для каждого гена в этом пути в данных, полученных от устойчивых животных, представлены на фиг. 7. Известно, что всего 100 генов контролируют этот путь в C . гирков пород. По крайней мере, один геномный вариант был идентифицирован в 78 генах из этих 100 генов (рис. 7).
Обсуждение
Технология
RNA-seq обеспечивает глубокий и эффективный способ изучения всего транскриптома, который включает полный набор транскриптов на соответствующей стадии развития или физиологическом состоянии.RNA-seq широко используется для количественной оценки транскриптомов для анализа глобальной экспрессии генов в различных тканях [23–26]. Кроме того, недавно было показано, что RNA-seq обеспечивает ресурс для открытия связанных с генами SNP [13, 19, 27]. В этом исследовании мы впервые использовали RNA-seq для открытия SNP, связанного с устойчивостью к GIN у коз. Одна из основных проблем геномного анализа коз и овец заключается в том, что функциональный анализ не был доступен для коз или овец в качестве эталонных видов из-за отсутствия данных для C . hircus и Ovis aries в программах функционального анализа. Таким образом, почти во всех предыдущих публикациях по геному коз и овец в качестве эталона для функционального анализа использовался геном человека [28–30] или крупного рогатого скота [31]. В настоящее время доступность референсного генома козы в путях Ensembl и KEGG сделала возможным и более специфичным для коз прогнозирование эффекта вариантов и анализ путей. Наше исследование — одно из первых, в котором геном козы используется в качестве эталона при функциональном анализе.Кроме того, мы использовали породу коз из тропического региона, где обитает 80% мировой популяции коз и является одним из основных источников животного белка [32] (http://www.fao.org/faostat/).
Исследования ассоциативного анализа обычно проводят для выявления геномных вариантов, которые влияют на фенотипические вариации устойчивости к GIN. Полногеномное исследование ассоциации у коз выявило семь SNP, связанных с устойчивостью к GIN, а гены, расположенные рядом с этими позициями, были связаны с иммунным ответом и другими функциями [33].Между тем, в других исследованиях был проведен анализ SNP генов-кандидатов, в основном иммунных генов, для выявления SNP, связанных с устойчивостью к GIN у коз [34, 35]. Ограничением для исследований ассоциации SNP на устойчивость к паразитам является то, что они требуют генотипирования и фенотипирования большого количества животных [36]. Недавно профилирование экспрессии генов с помощью RNA-seq выявило сотни генов, которые участвуют в иммунной функции устойчивости коз к GIN [20, 29, 37]. Посредством RNA-seq, помимо возможности профилирования экспрессии генов, функциональные гены секвенируются с высоким охватом, что позволяет обнаруживать полноразмерные варианты в кодирующих генах.Этот метод использовался как метод эффективного и экономичного обнаружения SNP в транскрибируемых регионах у коз по признакам адаптации к изменению климата [17] и качеству волокна [13]. Признаки адаптации к изменению климата изучались путем поиска ген-ассоциированных SNP из РНК-секвенирования образцов печени и почек индийских пород коз из различных климатических регионов, а также анализировались различные биологические процессы и вовлеченные генные сети [17]. Кроме того, большое количество предполагаемых SNP было идентифицировано с помощью анализа RNA-seq кожи кашемировой козы, и была проведена функциональная аннотация для этих SNP, чтобы указать различные пути, участвующие в развитии и качестве волокон [13].В настоящем исследовании мы использовали данные из последовательности РНК образцов слизистой оболочки сычуга от устойчивых к GIN и восприимчивых коз креольских коз в четырех точках времени после H . contortus для выявления предполагаемых геномных вариантов. Насколько нам известно, это первое исследование по идентификации геномных вариантов на основе данных RNA-seq у коз, инфицированных GIN.
Одним из преимуществ вызова вариантов из RNA-seq является сосредоточение внимания на генах / транскриптах, которые экспрессируются в ткани-мишени.Однако есть некоторые опасения по поводу информации, предоставляемой такими данными. Ранее было показано, что некоторые ложноположительные SNP, идентифицированные в кДНК, возникают в результате выравнивания считывания с неправильным геном, что представляет проблему для семейств генов с высококонсервативными доменами при использовании считывания короткой последовательности [16, 38]. Эта ситуация также наблюдалась в областях, связанных с повторами последовательностей [39]. Таким образом, одна из серьезных проблем при использовании секвенирования Illumina для анализа транскриптомов — это малая длина считывания.Мы использовали набор для подготовки образцов РНК Illumina TruSeq, который генерировал длины считывания 2 × 75 пар оснований с считыванием парных концов, чтобы увеличить охват оснований в экспрессируемых генах в образце и, как результат, улучшить чувствительность обнаружения вариантов.
Наше исследование выявило множество вариантов в интронных областях. Действительно, было показано, что процент прочтений интронов был выше, когда библиотеки были приготовлены методами экстракции тотальной РНК, как в настоящем исследовании, по сравнению с библиотеками поли (А) РНК [40].Следует также отметить, что результаты, представленные здесь для положения вариантов, не обязательно отражают процентное соотношение интрона / экзона, поскольку прогнозирование эффекта варианта было сделано не для всех вариантов, а только для тех, которые различаются между устойчивыми и восприимчивыми животными.
Исследования GIN-инфекции у крупного рогатого скота показали, что термины GO, связанные с генами, которые по-разному экспрессировались у устойчивого и восприимчивого крупного рогатого скота, были преимущественно связаны с метаболизмом липидов, а основная функция идентифицированных регуляторных сетей была связана с метаболизмом липидов [41].Наши результаты показали, что наиболее значимым термином ГО, связанным с генами, содержащими варианты, у устойчивых животных, был процесс метаболизма фосфолипидов. Т-клетки представляют собой разновидность лимфоцитов, которые играют центральную роль в адаптивном иммунном ответе. TCR представляет собой комплекс интегральных мембранных белков на поверхности Т-клеток, который участвует в активации Т-клеток в ответ на распознавание антигена и в конечном итоге приводит к пролиферации, дифференцировке, продукции цитокинов и / или гибели клеток, вызванной активацией. [42].В настоящем исследовании мы обнаружили, что гены, содержащие геномные варианты у устойчивых коз, были связаны с сигнальным путем TCR в анализе, обогащенном путем KEGG. Интересно, что быстрое увеличение количества γδ-TCR + T-клеток в слизистой оболочке сычуга через 3 и 5 дней после H . Инфекция contortus ранее была показана у овец [43, 44]. Эти результаты предполагают, что эта ранняя передача сигналов TCR в сочетании с образованием стабильного и специализированного соединения между Т-клетками и антигенпрезентирующими клетками будет участвовать в защитном иммунном ответе против инфекции GIN [42].
Митоген-активированные протеинкиназы (MAPK) являются высококонсервативными ключевыми регуляторами систем клеточной трансдукции, активируемыми, в частности, факторами роста, гормонами и цитокинами, опосредующими рост клеток, апоптоз, стрессовую реакцию и иммунный ответ в клетках млекопитающих [45]. Путь передачи сигналов MAPK был одним из наиболее значимых путей, идентифицированных из генов, содержащих геномные варианты устойчивого генотипа. Активация этого пути была связана с по-разному экспрессируемыми генами, идентифицированными в транскриптоме крови и слизистой оболочке сычуга соответственно у коз и овец, что указывает на ключевую роль передачи сигналов MAPK в механизмах устойчивости к GIN [29, 46].
Заключение
Это исследование предполагает, что сигнальный путь TCR играет важную роль в устойчивости к GIN у коз и предоставляет ценные ресурсы для характеристики геномных маркеров устойчивости к GIN у коз. Кроме того, здесь мы показали возможность использования данных RNA-seq в качестве эффективного и экономичного метода для обнаружения геномных вариантов в транскрибируемых геномных областях. Дополнительное использование таких высокопроизводительных данных может стать отличным ресурсом для получения дополнительных знаний о ресурсах животных.
Благодарности
Авторы выражают благодарность команде Дюкло за заботу о животных и обращению с ними: Ф. Помье, Ф. Нимирф, Ф. Периакарпен, К. Делумо и М. Жан-Барта. Особая благодарность доктору Гарри Архимеду за его ценный вклад в хирургическую процедуру.
Список литературы
1. Джаббар А., Икбал З., Кербеф Д., Мухаммад Г., Хан М. Н., Афак М. Устойчивость к глистогонам: пересмотр состояния дел. Life Sci. 2006. 79 (26): 2413–31.pmid: 16979192
2. Моррис С., Уиллер М., Уотсон Т., Хоскинг Б., Литвик Д. Прямая и коррелированная реакция на отбор по высокому или низкому количеству яиц фекальных нематод у овец Перендейл. New Zeal J Agric Res. 2005. 48 (1): 1–10.
3. Карлссон LJE, Greeff JC. Селекционная реакция на подсчет яиц фекальных червей в стае, устойчивой к паразитам Rylington Merino. Aust J Exp Agric. 2006; 46: 809–11.
4. Кемпер К.Э., Палмер Д.Г., Лю С.М., Грифф Дж.С., Бишоп С.К., Карлссон Л.Дж.Снижение количества яиц фекальных червей, количества червей и плодовитости червей у овец, отобранных по устойчивости к глистам, после искусственного заражения Teladorsagia circusiccta и Trichostrongylus colubriformis. Vet Parasitol. 2010. 171 (3–4): 238–46. pmid: 20471175
5. Li Z, Chen Z, Lan X, Ma L, Qu Y, Liu Y и др. Два новых cSNP гена ткача у коренных китайских коз и их связь с удоем. Mol Biol Rep. 2010; 37: 563–9. pmid: 19760098
6. Hou JX, An XP, Song YX, Wang JG, Ma T, Han P и др.Комбинированное влияние четырех SNP в гене PRLR козы на показатели молочной продуктивности. Ген. 2013; 529: 276–81. pmid: 23954220
7. An X, Song Y, Hou J, Wang S, Gao K, Cao B. Идентификация функционального SNP в 3’-UTR гена MTHFR коз, который связан с уровнями белка в молоке. Anim Genet. 2016; 47: 499–503. pmid: 27062401
8. Xiong Q, Chai J, Li X, Suo X, Zhang N, Tao H и др. Два tagSNP в гене рецептора пролактина связаны с признаками роста и помета у гибридных коз Бур и Маченг Блэк.Livest Sci. 2016; 193 (октябрь): 71–7.
9. Zhang R, Lai F, Wang J, Zhai H, Zhao Y, Sun Y. Анализ локусов SNP вокруг стартовых сайтов транскрипции, связанных с основанием признака плодовитости коз, на ресеквенировании всего генома. Ген. 2018; 643 (декабрь 2017): 1–6. pmid: 29208414
10. Ма Л., Цинь Ц., Ян Ц., Чжан М., Чжао Х., Пан С. и др. Ассоциации шести SNP генов пути POU1F1-PROP1-PITX1-SIX3 с признаками роста у двух коренных китайских пород коз. Ann Anim Sci.2017; 17 (2): 399–411.
11. Чжоу Дж., Чжу X., Чжан В., Цинь Ф., Чжан С., Цзя З. Новый однонуклеотидный полиморфизм в 5 ’вышестоящей области гена рецептора пролактина связан с характеристиками клетчатки у кашемировых коз Ляонин. Genet Mol Res. 2011; 10 (4): 2511–6. pmid: 22009863
12. Ван X, Zhao ZD, Xu HR, Qu L, Zhao HB, Li T, et al. Вариация и экспрессия гена KAP9.2, влияющего на свойство кашемира у коз. Mol Biol Rep. 2012; 39 (12): 10525–9. pmid: 23053952
13.Ван Л., Чжан И, Чжао М., Ван Р., Су Р., Ли Дж. Открытие SNP из транскриптома кашемировой козьей кожи. Азиатско-австралийский J Anim Sci. 2015; 28 (9): 1235–43. pmid: 26323515
14. Миноцци Г., Маттиелло С., Гроссо Л., Крепальди П., Чесса С., Паньякко Г. Первые выводы о генетике казеозного лимфаденита у коз. Ital J Anim Sci. 2017; 16: 31–8.
15. Пискол Р., Рамасвами Г., Ли Дж. Б. Надежная идентификация геномных вариантов по данным RNA-Seq. Am J Hum Genet.2013; 93: 641–51. pmid: 24075185
16. Cánovas A, Rincon G, Islas-Trejo A, Wickramasinghe S, Medrano JF. Обнаружение SNP в транскриптоме коровьего молока с использованием технологии RNA-Seq. Мамм Геном. 2010; 21: 592–8. pmid: 21057797
17. Шарма У., Банерджи П., Джоши Дж., Кумар Виджх Р. Идентификация SNP у коз (Capra hircus) с использованием анализа RNA-Seq. Int J Anim Vet Adv. 2012. 4 (4): 272–83.
18. Мартинес-Монтес А.М., Фернандес А., Перес-Монтарело Д., Алвес Е., Бенитес Р.М., Нуньес И. и др.Использование данных SNP RNA-Seq для выявления потенциальных причинных мутаций, связанных с производственными признаками свиней и редактированием РНК. Anim Genet. 2017; 48 (2): 151–65. pmid: 27642173
19. Pareek CS, Błaszczyk P, Dziuba P, Czarnik U, Fraser L, Sobiech P, et al. Обнаружение однонуклеотидного полиморфизма в печени крупного рогатого скота с использованием технологии RNA-seq. PLoS One. 2017; 12 (2): 1–26. pmid: 28234981
20. Абошади Х.М., Мандонне Н., Фелисите Й., Хира Дж., Фурко А., Барбье С. и др. Динамические транскриптомные изменения слизистой оболочки сычуга коз в ответ на инфекцию Haemonchus contortus.Vet Res. 2020; 1–12. pmid: 31924264
21. Ю Г, Ван Л-Г, Хань И, Хе Ц-И. clusterProfiler: пакет R для сравнения биологических тем среди генных кластеров. Omi A J Integr Biol. 2012. 16 (5): 284–7.
22. Луо В., Брауэр С. Pathview: пакет R / Bioconductor для интеграции и визуализации данных на основе путей. Биоинформатика. 2013. 29 (14): 1830–1. pmid: 23740750
23. Эль-Ашрам, Аль-Наср I, Мехмуд Р., Суо X, Эль-Ашрам С., Эль-Кемари М. и др.Профили ранней и поздней экспрессии генов слизистой оболочки овцы в ответ на инфекцию Haemonchus contortus с использованием технологии Illumina RNA-seq. Parasitol Int. 2017; 66 (5): 681–92. pmid: 28552633
24. Geng R, Yuan C, Chen Y. Изучение дифференциально экспрессируемых генов с помощью RNA-Seq в коже кашемировой козы (Capra hircus) во время развития волосяного фолликула и цикла. PLoS One. 2013; 8 (4): e62704. pmid: 23638136
25. Chen HY, Shen H, Jia B, Zhang YS, Wang XH. Дифференциальная экспрессия генов в яичниках черных овец Qira и Hetian с использованием метода RNA-Seq.2015; 1–15.
26. Ли Р.В., Чоудхари Р.К., Капуко А.В., Урбан Дж. Ф. Изучение транскриптома хозяина на предмет механизмов, лежащих в основе защитного иммунитета и устойчивости к нематодным инфекциям у жвачных животных. Vet Parasitol. 2012; 190 (1–2): 1–11. pmid: 22819588
27. Ю Й, Вэй Дж, Чжан Х, Лю Дж, Лю Ц., Ли Ф и др. Обнаружение SNP в транскриптоме белой тихоокеанской креветки Litopenaeus vannamei путем секвенирования следующего поколения. PLoS One. 2014; 9 (1): 1–9. pmid: 24498047
28.McRae KM, Good B, Hanrahan JP, McCabe MS, Cormican P, Sweeney T. и др. Транскрипционное профилирование сычужного лимфатического узла овцы показывает роль времени иммунного ответа в устойчивости желудочно-кишечных нематод. Vet Parasitol. 2016; 224: 96–108. pmid: 27270397
29. Bhuiyan AA, Li J, Wu Z, Ni P, Adetula AA, Wang H, et al. Изучение генетической устойчивости к инфекции желудочно-кишечных нематод у коз с помощью секвенирования РНК. Int J Mol Sci. 2017; 18: 751–67.pmid: 28368324
30. Chitneedi PK, Suárez-Vega A, Martínez-Valladares M, Arranz JJ, Gutiérrez-Gil B. Изучение механизмов устойчивости к инфекции Teladorsagia Circccincta у овец с помощью транскриптомного анализа слизистой оболочки сычуга и сычужных лимфатических узлов. Vet Res. 2018; 49 (1): 1–11. pmid: 29316972
31. Ахмед А.М., Гуд Б., Ханрахан Дж. П., МакГеттиган П., Браун Дж., Кин О. М. и др. Различия в транскриптоме сычужного лимфатического узла овцы между породами, которые, как известно, различаются по устойчивости к желудочно-кишечным нематодам.PLoS One. 2015; 10 (5): e0124823. pmid: 25978040
32. Рыцари М., Гарсия Г.В. Статус и характеристики коз (Capra hircus) и их потенциальная роль как важного производителя молока в тропиках: обзор. Small Rumin Res. 1997. 26 (3): 203–15.
33. Сильва Ф. Ф., Бамбу Дж. К., Оливейра Дж. А., Барбье С., Флери Дж., Мачадо Т. и др. Полногеномное исследование ассоциации выявило новые гены-кандидаты на устойчивость к нематодам у креольских коз. Small Rumin Res. 2018; 166 (декабрь 2016): 109–14.
34. Алам МББ, Омар А.И., Фарук МО, Ноттер Д.Р., Периасами К., Мондал ММН и др. Однонуклеотидные полиморфизмы в генах-кандидатах в значительной степени связаны с устойчивостью коз коз, вызванной Haemonchus contortus. J Anim Sci Biotechnol. 2019; 10 (1): 1–15.
35. Bressani FA, Tizioto PC, Giglioti R, Meirelles SLC, Coutinho R. Однонуклеотидный полиморфизм в генах-кандидатах, связанных с желудочно-кишечной нематодной инфекцией у коз. Genet Mol Res.2014. 13 (4): 8530–6. pmid: 25366747
36. Маккарти М.И., Абекасис Г.Р., Кардон Л.Р., Голдштейн Д.Б., Литтл Дж., Иоаннидис JPA и др. Полногеномные исследования ассоциации сложных признаков: консенсус, неопределенность и проблемы. Nat Rev Genet. 2008. 9 (5): 356–69. pmid: 18398418
37. Абошади Х.М., Мандоннет Н., Стир М.Дж., Арке Р., Бедерина М., Сарри Дж. И др. Вариации транскриптома в ответ на инфекцию желудочно-кишечных нематод у коз. PLoS One. 2019; 14 (6): e0218719.pmid: 31220166
38. Цирулли Э. Т., Сингх А., Шианна К. В., Д. Д., Смит Дж. П., Майя Дж. М. и др. Скрининг экзома человека: сравнение секвенирования всего генома и всего транскриптома. Genome Biol. 2010; 11 (5): 1–8. pmid: 20598109
39. Морозова О., Марра М.А. Применение технологий секвенирования нового поколения в функциональной геномике. Геномика. 2008. 92 (5): 255–64. pmid: 18703132
40. Ли С., Чжан А.Ю., Су С., Нг А.П., Холик А.З., Асселин-Лабат М.-Л и др.Покрытие всех ваших основ: включение интронного сигнала из данных RNA-seq. НАР Геномикс Биоинформа. 2020; 2 (3): 1–12. pmid: 33575621
41. Ли Р. В., Ринальди М., Капуко А. В. Характеристика сычужного транскриптома для механизмов устойчивости к желудочно-кишечным нематодам у крупного рогатого скота. Vet Res. 2011; 42 (1): 114. pmid: 22129081
42. Хьюз М. Сигнальная сеть рецепторов Т-клеток. J Cell Sci. 2009. 122: 1269–73. pmid: 19386893
43. Балик А., Боулз В.М., Мееузен ЛОР.Механизмы иммунитета к инфекции Haemonchus contortus у овец. Parasite Immunol. 2002. 24 (1): 39–46. pmid: 11856445
44. Робинсон Н., Пьедрафита Д., Снибсон К., Харрисон П., Мееузен EN. Кинетика иммунных клеток в слизистой оболочке сычуга овец после гипериммунизации и заражения Haemonchus contortus. Vet Res. 2010. 41 (4): 1–10. pmid: 20167198
45. Чжан В., Лю Х.Т. Сигнальные пути MAPK в регуляции пролиферации клеток в клетках млекопитающих. Cell Res.2002; 12 (1): 9–18. pmid: 11942415
46. Guo Z, González JF, Hernandez JN, McNeilly TN, Corripio-Miyar Y, Frew D, et al. Возможные механизмы устойчивости хозяина к инфекции Haemonchus contortus у пород овец, произрастающих на Канарских островах. Sci Rep. 2016; 6 (апрель): 1–14. pmid: 27197554
Катастрофы, подобные разрушению Харви. Но они тоже объединяются.
Примечание редактора: Это четвертая часть эссе, состоящего из пяти частей, в котором изучаются способы сплочения продовольственного сообщества Хьюстона после Харви.Прочтите части 1, 2 и 3 здесь.
Часть 4
Суббота, 2 сентября
К субботе в районе Хьюстона произошли тысячи актов хаотического сострадания: от соседей, помогавших вычищать дома, до Эйми Вудалл, основательницы агентства Black Sheep Agency, и Карлы Валенсии де Мартинес, издателя Local, открывшей Giving Hub — a организация помощи изгоев, которая с сентябряС 1 по 20 сентября собрал и распространил буквально тонны воды, подгузников, салфеток, моющих средств и нескоропортящихся продуктов среди местных организаций, церквей, семей и отдельных лиц, нуждающихся в помощи после Харви.
Фермеры и сыроделы в стиле панк-рок, Лиза и Кристиан Сегер, владельцы фермы «Голубая цапля» в округе Уоллер, также хотели помочь. Они не понаслышке знают о щедрости ресторанного сообщества Хьюстона. Когда в 2011 году лесной пожар угрожал их козам и разрушил соседние дома и фермы, победитель Джеймса Берда Крис Шеперд собрал автобус поваров, чтобы они принесли припасы, готовили для пожарных и помогали всем, чем могли.
Сегеры не забыли. Первоначально они хотели внести свой вклад, купив козье молоко у фермера, пострадавшего от Харви, и переработали его в сыр для Midtown Kitchen Collective. Лиза попросила свое сообщество в Facebook помочь собрать 300 долларов на покупку молока.
Прежде чем она это узнала, у нее было 1400 долларов. Обеспокоенная лишними деньгами, она отрезала отчисления. Но потом у нее появилась идея.
Seger продает сыр, козий фета, козий йогурт и некоторые другие продукты на фермерском рынке Истсайда Urban Harvest.Рынок в субботу, 26 августа, был отменен из-за Харви. Фермеры и продавцы потеряли неделю дохода.
Кроме того, во время урагана пострадали несколько хозяйств.
Сильнее всего пострадал Gundermann Acres. Расположенный недалеко от реки Колорадо в округе Уортон, он является одним из крупнейших производителей овощей в районе Хьюстона. 29 августа, когда мы готовили фо в Монтроузе, раздутое дождем Колорадо вышло на берег, затопив более 400 акров их фермы — местами глубиной 10 футов.Паводок уничтожил все посевы, тракторы и оборудование. На следующий день вода, в которой они нуждались во время недавней засухи, затопила их дом.
Идея
Сегер заключалась в том, чтобы продолжить сбор денег, а затем покупать у фермеров на рынке в субботу, 2 сентября. Затем она отдала мясо и продукты Коллективу. Как говорится, это был беспроигрышный вариант: выиграли бы и фермеры, и выжившие Харви.
Я согласился помочь Сегеру закупить, собрать и доставить продукцию.Это было не так просто, как кажется. Фермеры, как я знал от деда, упрямые люди, и они, как и повара, щедры в своем желании накормить людей.
Часть урожая, который компания Gundermann Acres смогла собрать во время наводнения во время урагана Харви.
Дэвид Леввич
Когда я впервые обратился к Гаррету Гундерманну, который вместе со своей женой Гундерманн владеет Акресом, по поводу закупки продуктов для Коллектива, его первым побуждением, несмотря на потерю всего, кроме овощей, которые он собрал перед бурей, было пожертвовать.
Потребовалось некоторое время, прежде чем он позволил мне заплатить. С фермером за фермером история была похожа. Они хотели подарить или продать по сниженным ценам. Сегер хотела платить розничные цены, но ее товарищи-фермеры не имели этого.
Это едва ли отражает щедрость хьюстонских обществ питания и напитков. Лайл Бенто, шеф-повар и совладелец компании Southern Goods из района Бомонт, собирал воду, припасы и еду для сильно затопленных районов Бомонта и Порт-Артура.Затем он и несколько друзей, в том числе Алекс Грегг, совладелец бара Moving Sidewalk, который более двух недель водили грузовики для Коллектива и Раздающего центра, двинулись по все еще затопленным шоссе, чтобы доставить их.
В первые дни после урагана ресторан Down House собирал грузовики с товарами, а затем организовывал их доставку туда, где они были больше всего нужны. The H Town Restaurant Group (Hugo’s, Xochi, Caracol и Backstreet Café), State of Grace и несколько других ресторанов возглавили свои собственные усилия по оказанию продовольственной помощи.Группа мексиканских пекарей, застрявших в пекарне Эль-Болильо, потратила две прямые формы для выпечки дульсе, которые в конечном итоге были переданы в приюты (еще один момент в Хьюстоне).
Список ресторанов, продуктовых магазинов, продавцов, фермеров, владельцев ранчо и поставщиков, которые давали продукты Коллективу и другим мероприятиям по оказанию помощи, состоит из нескольких страниц. Я чувствую себя виноватым, не признавая щедрость каждого человека или компании, которые внесли свой вклад — и это только из-за попыток накормить людей.
Неудивительно, что многие в профессиональном сообществе Хьюстона, специализирующегося на продуктах питания и напитках, были лидерами в усилиях по оказанию помощи.Конечно, в случае бедствия, когда у некоторых мало или совсем нет еды, те, кто сможет закупить ингредиенты и превратить их в еду, будут пользоваться большим спросом.
Но повара хороши в бедствиях не только потому, что они могут делать эти две вещи.
Быть хорошим шеф-поваром — значит возбудить чей-то вкус так же, как и управлять кризисом. Поварам приходится чистить туалеты и канализацию, пока у них есть ресторан, полный гостей. Им приходится ремонтировать сломанные настольные миксеры и роботы-купе, при этом убивая говядину по бокам; найти замену посудомоечной машине на 5 р.м. в День святого Валентина; поджечь мясо, как сантехник подкладывает газ под их ногами; и продолжайте готовить при 120-градусной жаре, когда в августе на кухне отключится кондиционер.
Они знают, как растянуть ограниченный бюджет на питание, и они знают, как управлять персоналом с разным опытом и часто говорящим на разных языках.
Поэтому неудивительно, что, когда я вошел в коллектив в четверг утром, уже сложилась знакомая, хотя и импровизированная, кухонная иерархия.
Найт взял на себя роль шеф-повара; Воутсинас был поваром кухни; А.Дж. (Я думаю, его звали — это было типично; незнакомцы, собранные вместе, помогая другим, обмениваясь анекдотами, колкостями и, возможно, позже, пивом, но чьи имена вы никогда не узнали) был су-шеф; Горстка профессионалов и любителей были поварами и поварами.
Это был, как и большинство ресторанов, управляемый хаос — именно то, что нужно после катастрофы.
Любой, кто наблюдал за сплоченным сообществом ресторанов и баров Хьюстона в течение последних нескольких лет, также не будет удивлен их щедростью после Харви или их способностью сотрудничать в трудные времена.
Грузовик загружен припасами в Центре раздачи.
Дэвид Леввич
Несколько лет назад, когда уважаемая бармен Линда Салинас получила серьезную травму головы в результате аварии на скутере, сообщество сплотилось. Они провели серию мероприятий и сборов средств, чтобы помочь ей покрыть медицинские расходы. Салинас заплатил вперед. Она не только помогала разносить еду оставшимся в живых в Джорджа Р. Брауна, но также помогала рубить овощи и мыть полы в Коллективе.
Члены сообщества, сплотившиеся вокруг Салинаса, позже основали OKRA Charity Saloon, один из первых баров в стране, который жертвует свои ежемесячные доходы некоммерческим организациям, модель, которая вдохновила другие подобные бары по всей стране.
И многие повара, которые готовили для Харви, уже участвуют в различных благотворительных мероприятиях, как и до Харви.
Но не только люди, занимающиеся продуктами питания и напитками, помогли усилить усилия по оказанию помощи. В Коллективе ключевую роль сыграли музыканты, профессионалы в области инновационного маркетинга и связей с общественностью, а также художники.
Это тоже не сюрприз. Когда я жил в Нью-Йорке, Вашингтоне, Д.С. и Филадельфия, сообщества и профессии существовали в основном в своих собственных бункерах. Но в Хьюстоне многие из этих барьеров были сломаны, если они вообще существовали.
Здесь больше свободы и сотрудничества между людьми. Дело не в том, что у нас нет преград. Несмотря на наше разнообразие, по-прежнему существует сегрегация и дискриминация по признаку расы, этнической принадлежности и экономики, а наше географическое разрастание создает разрозненные карманы. Но нам здесь не хватает определенных предлогов, и это не способствует созданию уникальных и зачастую прочных связей не только внутри сообществ, но и между ними.
Эти существующие социальные связи заложили основу, которая повысила эффективность этих усилий по оказанию помощи в случае всплывающих окон. Не случайно церкви, за некоторыми примечательными исключениями в Хьюстоне, часто имеют сильное присутствие во время стихийных бедствий. Служение часто является частью их миссии, и у них есть физическое пространство для оказания помощи. Не менее важно то, что у них есть уже существующие социальные связи, на которые они могут опираться.
В Хьюстоне светские сообщества также установили прочные социальные и профессиональные связи, которые привели к эффективному сотрудничеству до и во время Харви.И те препятствия, которые могли существовать до Харви, были устранены подъемом воды и нуждающимися людьми.
Катастрофы могут разрушать, но они также объединяют.
Дэвид Леввич — исполнительный редактор Sugar & Rice, издания о еде и культуре побережья Мексиканского залива, базирующегося в Хьюстоне.

Козоводы объединяйтесь: Козоводы, объединяйтесь! (Объявления о продаже)